朱鹏 作品数:53 被引量:67 H指数:4 供职机构: 广西大学 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家高技术研究发展计划 国家科技重大专项 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 医药卫生 更多>>
增殖细胞核抗原在水牛腔前卵泡中的表达与卵巢组织定位 2013年 【目的】探讨在水牛中增殖细胞核抗原(PCNA)参与卵泡发生的时期及其在卵巢组织不同时期卵泡中的表达定位;【方法】采用石蜡切片结合免疫组化的方法对PCNA在卵巢组织中进行定位,利用实时荧光定量PCR(QRT-PCR)技术检测PCNA在腔前卵泡中的表达情况。【结果】免疫组化结果显示:原始卵泡中的卵母细胞能检测到PCNA的表达,但颗粒细胞并未观察到PCNA的免疫染色;初级卵泡到次级卵泡,卵母细胞和颗粒细胞中均可检测到PCNA的表达,且在颗粒细胞中的表达有增强的趋势;有腔卵泡中,颗粒细胞、卵泡膜细胞及包围卵母细胞的卵丘细胞中都能观察到很强的免疫染色。定量表达检测结果显示:PCNA在原始卵泡、初级卵泡及次级卵泡中的表达呈上升趋势,并且有显著差异(43.50333±0.138338 vs 1.633804±0.093796 vs 1±0.012219,P<0.01);【结论】从初级卵泡开始在颗粒细胞中能检测到PCNA的表达,并且其表达随着卵泡的发育有明显的增强趋势,腔前卵泡中PCNA表达的QRT-PCR测定结果与免疫组化结果相一致,研究结果为阐明PCNA参与卵泡发生的分子调控机制奠定了基础。 马帆 周宇 高亚可 朱鹏 雷小灿 刘庆友 石德顺关键词:水牛 PCNA 水牛HSD17B1基因克隆分析及其真核表达载体构建 被引量:3 2016年 为了阐明水牛17β-羟类固醇脱氢酶1(17beta-hydroxysteroid dehydrogenase 1,HSD17B1)基因对水牛繁殖性能的影响,本试验采用了3′-RACE克隆获得HSD17B1基因,并对其核苷酸序列和蛋白质序列进行了生物信息学分析,通过构建其真核表达载体并转染293T细胞验证所构建载体的准确性。结果表明,水牛HSD17B1基因编码区长954bp,3′-UTR区长58bp,编码317个氨基酸。BLAST分析显示水牛HSD17B1核苷酸序列与牛、绵羊、猪、马、犬、非洲象和人的相似性分别为100%、100%、92%、94%、87%、87%和87%,系统进化树分析结果表明,HSD17B1基因在不同物种及进化的过程中具有高度保守性。蛋白质分析结果表明HSD17B1蛋白呈弱酸性,无信号肽,亚定位于细胞质,存在type1_17beta-HSD-like_SDR_c、PRK05993、LPOR和FabG等结构域。试验成功构建了水牛HSD17B1基因真核表达载体pEGFPN1-HSD17B1,转染293T后,产生较强的绿色荧光信号,表明能够形成HSD17B1-EGFP融合蛋白。水牛HSD17B1基因的克隆及其真核表达载体的成功构建,为今后阐明HSD17B1基因在水牛卵泡及胚胎发生过程中的作用及分子机制奠定了理论基础。 朱鹏 庞春英 邓廷贤 段安琴 陆杏蓉 陈明棠 杨炳壮 梁贤威关键词:水牛 克隆分析 水牛浮舰蛋白2基因克隆及序列分析 被引量:2 2016年 试验旨在克隆水牛浮舰蛋白2(Flotillin 2,FLOT2)基因并对其进行生物信息学分析,为揭示该基因在水牛发育繁殖中的作用奠定基础。本研究通过PCR扩增获得了FLOT2基因全长并进行克隆测序,结合生物信息学分析方法,预测及分析其蛋白质结构。结果表明,水牛FLOT2基因编码区长1 287bp,编码428个氨基酸,3′UTR区长277bp。多重序列比较分析显示,水牛FLOT2基因核苷酸序列与牛、山羊、绵羊、小鼠、马、猫和人相应序列的相似性分别为98%、98%、97%、90%、93%、92%和92%,系统进化树分析结果表明,FLOT2基因在不同物种以及进化的过程中具有高度保守性。对FLOT2蛋白质的分析表明,该蛋白呈弱酸性,无信号肽,细胞亚定位于细胞质中,存在SPFH_flotillin和SPFH_hflk等结构域。microRNA预测结果表明,bta-miR-2438、bta-miR-2379和bta-miR-1777a可能是其3′UTR潜在靶标。研究结果为今后阐明FLOT2基因在水牛繁殖性能中的功能,尤其是在配子及胚胎发生过程中的作用及分子机制奠定了基础。 段安琴 庞春英 朱鹏 邓廷贤 陆杏蓉 梁贤威关键词:水牛 克隆 黄牛类胚胎干细胞的培养 本研究采用分离着床前囊胚的内细胞团的方法培养黄牛类胚胎干细胞,通过对分离胚胎内细胞团方法和控制饲养层密度以及传代方法的培养条件的实验摸索,得出以下结论:使用器械分离法分离出囊胚内细胞团,使其贴壁在密度为80%的饲养层生长... 马玉洁 劳艳萍 朱鹏 阮秋燕 雷钏 杜姗姗 王萍 陆凤花 石德顺关键词:黄牛 胚胎干细胞 文献传递 水牛LGALS3BP基因克隆及序列分析 被引量:1 2016年 为了阐明水牛半乳糖凝集素3结合蛋白(lectin,galactoside-binding,soluble,3 binding protein,LGALS3BP)基因的结构及功能,本试验采用了3'RACE克隆获得LGALS3BP基因并对其进行了信息学分析。结果表明:水牛LGALS3BP基因编码区长1 668 bp,3'UTR区长590 bp,编码555个氨基酸。BLAST程序比对结果表明克隆获得的LGALS3BP序列与人、非洲象、猫、马、猪、绵羊和牛的同源性分别为82%、82%、84%、83%、94%、94%和97%,系统进化树分析结果表明,LGALS3BP基因在不同物种以及进化的过程中具有高度保守性。蛋白质分析结果表明LGALS3BP蛋白呈弱酸性,第18~19位氨基酸为其蛋白信号肽剪切区域,亚定位于细胞外,存在SR,BACK和BTB等结构域。micro RNA预测显示bta-mi R-2316,bta-mi R-484和btami R-2888等可能为LGALS3BP 3'非翻译区(untranslated region,UTR)潜在靶标。总之,本研究成功克隆获得了水牛LGALS3BP基因并对其进行了系统的信息学分析。 朱鹏 庞春英 段安琴 邓廷贤 陆杏蓉 梁贤威关键词:水牛 克隆分析 沼泽型水牛微卫星DNA的遗传多样性分析 被引量:2 2016年 为探究中国沼泽型水牛品种或类群的遗传多样性,本研究采用了沼泽型水牛30个微卫星标记结合LabChip芯片检测法对德昌水牛、德宏水牛、温州水牛、贵州水牛、西林水牛、富钟水牛及两个引进品种摩拉水牛、尼里-拉菲水牛等40个样本进行了检测和遗传多样性分析。结果表明,在30个微卫星DNA标记上共发现332个等位基因,平均基因多样性和PIC值分别为0.7808和0.7554。聚类分析结果显示,德宏水牛和德昌水牛先聚为一类,随后与富钟水牛、贵州水牛、温州水牛、西林水牛聚为一类;摩拉水牛与尼里-拉菲水牛聚为一类。本研究证实了所选的30个沼泽型水牛微卫星DNA标记可作为有效的遗传标记用于水牛品种间的遗传多样性分析,同时也丰富了当前的水牛微卫星标记资源。 邓廷贤 庞春英 朱鹏 陆杏蓉 段安琴 梁贤威关键词:水牛 微卫星 芯片检测 水牛透明带3基因启动子克隆及转录活性检测 被引量:1 2015年 为了阐明水牛透明带3基因(ZP3)表达调控机理,通过PCR技术、载体构建和细胞转染等技术,对其转录活性进行了研究。结果表明:成功克隆得到广西本地水牛ZP3基因5'侧翼序列及部分编码区序列(CDS)区序列,共3 081 bp;广西本地水牛ZP3核苷酸序列与河流型水牛、黄牛、绵羊和山羊的相似性分别为99%、96%、92%和92%;在ZP3翻译起始位点上游-147 bp至-196 bp处存在TATA box,启动子区存在GATAs、Foxo3、Nobox、Stat3、Stat4、Stat5a、Stat5b、Stat6和YY1等反式作用因子结合位点,其中Stats家族在ZP3启动子区存在多个结合位点,且同一位点又存在多个Stats结合的情况;水牛ZP3启动子不能启动绿色荧光蛋白(Enhanced green fluorescent protein,EGFP)在HEK-293T细胞中的表达,但能启动其在CHO细胞中的表达,且启动子活性比CMV启动子弱。 庞春英 陆杏蓉 朱鹏 邓廷贤 段安琴 陈明棠 杨炳壮 梁贤威关键词:水牛 克隆分析 转录活性 水牛ASAH1基因克隆分析及其真核表达载体构建 被引量:1 2015年 为了阐明水牛ASAH1基因在水牛卵泡发生和胚胎发生过程中的作用及分子机制,采用RT-PCR及载体构建技术对ASAH1进行了研究。结果表明:水牛ASAH1基因的编码区全长993 bp,共编码330个氨基酸。多重序列比较分析显示水牛ASAH1核苷酸序列与牛、山羊、绵羊、猪、马、人和非洲象相应序列的相似性分别为99%、97%、96%、90%、90%、89%和87%,结合系统进化树分析结果,ASAH1基因在不同物种以及进化的过程中具有高度保守性。对ASAH1蛋白质的分析表明:该蛋白呈弱酸性,无信号肽,细胞亚定位于溶酶体,存在NAAA-beta和Ntn_AC_NAAA结构域。成功构建水牛ASAH1基因真核表达载体,转染293T和CHO细胞系后,均能够正确形成ASAH1-EGFP融合蛋白,产生绿色荧光信号。我们的结果为今后阐明ASAH1基因在水牛水牛卵泡发生和胚胎发生过程中的作用及分子机制奠定了理论基础。 庞春英 朱鹏 邓廷贤 陆杏蓉 段安琴 杨炳壮 梁贤威关键词:水牛 克隆分析 一种PEP‑1肽介导绿色荧光蛋白转导水牛胚胎的方法 本发明涉及细胞穿膜肽靶向运输的技术领域,特别涉及一种PEP‑1肽介导绿色荧光蛋白转导水牛胚胎的方法,所述方法包括PEP‑1‑EGFP和EGFP片段的优化、原核表达载体pCZN1‑PEP‑1‑EGFP和pCZN1‑EGFP... 朱鹏 梁贤威 庞春英 邓廷迟 段安琴 陆杏蓉文献传递 水牛ALK5基因克隆分析与组织表达模式研究 被引量:1 2015年 为了阐明水牛ALK5基因在水牛卵泡发生过程中的作用,了解其在水牛不同组织中的表达模式,试验采用了RT-PCR及QRT-PCR方法对ALK5基因进行了研究,参考已公布的Gen Bank中牛ALK5基因序列,设计特异性引物应用RT-PCR方法扩增克隆获得目的基因片段;应用生物信息学方法,系统分析和预测了水牛ALK5基因的遗传进化、蛋白质的理化性质、二级和三级结构,并应用QRT-PCR技术对ALK5基因在水牛组织的表达进行了差异分析。结果表明:水牛ALK5基因的编码区全长为1 512 bp,共编码503个氨基酸;水牛ALK5核苷酸序列与牛、绵羊、猪、人和小鼠相应序列的相似性分别为99%、97%、95%、93%和90%,结合系统进化树分析结果推测ALK5基因在不同物种以及进化的过程中具有高度保守性;该蛋白呈弱碱性,有信号肽,细胞亚定位于胞膜上,存在low complexity和GS结构,呈典型跨膜蛋白结构;水牛ALK5基因在肺脏、垂体、下丘脑组织中不表达,在水牛大脑、肝脏、骨骼、卵巢、肌肉和心脏等12个组织细胞中具有不同程度的表达,其中卵巢中表达量最高,心脏和肾脏次之,肌肉表达量最低。说明试验成功地克隆了沼泽型水牛ALK5基因,其具备典型的TGF-β受体家族结构,表达具有一定的组织特异性。 朱鹏 赵鲜红 粟小平 苏节 刘金凤 刘庆友 石德顺关键词:水牛 克隆分析