焦斐
- 作品数：8 被引量：19H指数：3
- 供职机构：中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所更多>>
- 发文基金：国家肉牛牦牛产业技术体系项目公益性行业科研专项中央级公益性科研院所基本科研业务费专项更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 牛FTO基因功能结构生物信息学分析
- 引言FTO(fat mass and obesity associated)基因也称肥胖基因,是一种与肥胖相关的等位基因,Peters等在首次在小鼠中克隆出这个基因。近年来,随着对FTO基因的研究,多个单核苷酸多态性位点...
- 刘建阎萍梁春年郭宪包鹏甲裴杰丁学智褚敏吴晓云焦斐
- 文献传递
- 牛FAS基因的生物信息学分析
- 对牛FAS基因进行生物信息学分析,以预测FAS基因编码产物的理化性质、结构与功能。结果表明,FAS基因编码产物为较稳定疏水性蛋白,不具有信号肽,为非分泌蛋白。二级结构主要以α螺旋和无规则卷曲为主,主要在质膜中发挥生物学作...
- 焦斐阎萍梁春年郭宪包鹏甲裴杰丁学智褚敏吴晓云刘建
- 关键词：FAS基因蛋白质结构生物信息学
- 文献传递
- 牦牛FASN基因多态性及其与肉质性状的相关性研究被引量：6
- 2014年
- 利用PCR-SSCP技术,对甘南牦牛、大通牦牛和天祝白牦牛的FASN基因第3内含子进行SNPs筛选,并将筛选到的突变位点与牦牛部分肉质性状进行相关性分析。结果发现,3个牦牛群体在第3内含子检测到g.5477 C→T的突变,由此产生3种基因型:HH、HG、GG。相关性分析表明,HH基因型和HG基因型个体的脂肪含量显著高于GG基因型个体(P<0.05)。HH、HG、GG 3种基因型对失水率、熟肉率、pH24值和剪切力的影响差异不显著(P>0.05)。
- 褚敏焦斐吴晓云阎萍梁春年郭宪裴杰丁学智包鹏甲朱新书
- 关键词：牦牛SNPS肉质性状
- 牦牛PRKAG3、FAS基因多态性与肉质相关性研究
- 本研究以甘南牦牛、天祝白牦牛、大通牦牛为研究对象，采集牦牛血样341头份，其中甘南牦牛98头份，天祝白牦牛137头份，大通牦牛106头份；采集肉样166份，其中甘南牦牛40头，天祝白牦牛58头，大通牦牛68头。采用PCR...
- 焦斐
- 关键词：牦牛肉品质PRKAG3基因FAS基因关联性分析
- 文献传递
- 牦牛VEGF-A基因的克隆及生物信息学分析被引量：4
- 2012年
- 利用分子克隆技术获得了牦牛VEGF-A基因编码区序列,并采用生物信息学方法对该基因及其编码蛋白的基本理化性质、疏水性、信号肽、二级结构等方面进行了预测和分析。结果表明,牦牛VEGF-A基因包含一个573 bp的开放阅读框,编码190个氨基酸;其编码蛋白属于亲水性蛋白,具有明显的信号肽。二级结构主要以无规则卷曲和α螺旋为主。VEGF-A基因编码产物氨基酸邻接系统树表明,牦牛VEGF-A与黄牛、绵羊和成都麻羊等物种的VEGF-A氨基酸遗传距离较近,具有高度同源性。
- 吴晓云阎萍梁春年郭宪包鹏甲裴杰褚敏丁学智刘文博焦斐刘建
- 关键词：牦牛克隆生物信息学分析
- 牦牛ATP6和Cytb基因的分子进化研究
- 线粒体基因组(Mitochondrial Genome)具有区别于核基因组的诸多特性,文章通过对牦牛线粒体基因组的ATP6和Cytb基因进行分子进化分析发现,ATP6和Cytb基因均受到纯化选择,且ATP6基因受到纯化选...
- 吴晓云阎萍梁春年郭宪包鹏甲裴杰丁学智褚敏焦斐刘建
- 关键词：ATP6CYTB分子进化
- 文献传递
- 牦牛PRKAG3基因部分序列多态性分析被引量：2
- 2012年
- 采用PCR-SSCP技术,对甘南牦牛、大通牦牛和天祝白牦牛的PRKAG3基因第3、第9内含子的多态性进行检测。结果表明,牦牛PRKAG3基因在第3、第9内含子中均存在多态位点,2个位点分别存在AA、AB和EE、EF基因型。其中,A和E为优势等位基因,2个位点在3个牦牛群体中均处于Hardy-Weinberg平衡状态。独立性检验结果表明,在1 806 bp处天祝白牦牛与甘南牦牛之间差异显著(P<0.05),大通牦牛与甘南牦牛、天祝白牦牛之间差异不显著(P>0.05);在4 487 bp处大通牦牛和天祝白牦牛、甘南牦牛之间差异极显著(P<0.01),天祝白牦牛与甘南牦牛之间差异不显著(P>0.05)。
- 焦斐杨富民阎萍梁春年郭宪包鹏甲裴杰丁学智褚敏刘文博吴晓云刘建
- 关键词：牦牛PRKAG3基因PCR-SSCP多态性
- 牛RHOQ基因的电子克隆与生物信息学分析被引量：1
- 2012年
- 利用电子克隆技术获得牛RHOQ基因cDNA序列,采用生物信息学方法对该基因及其编码蛋白的基本理化性质、疏水性、信号肽、二级结构和亚细胞定位等方面进行预测和分析。结果表明,牛RHOQ基因的cDNA序列全长1 517 bp,包含1个618 bp开放阅读框,编码205个氨基酸;其编码蛋白属疏水性蛋白,不存在信号肽及跨膜结构,定位于分泌系统囊泡;二级结构主要以无规则卷曲和α-螺旋为主。牛RHOQ基因编码蛋白可能具有生长因子功能,可能在神经再生和突触延伸过程中起重要作用。
- 吴晓云阎萍梁春年郭宪包鹏甲裴杰丁学智褚敏刘文博焦斐刘建
- 关键词：电子克隆生物信息学分析
