王琳 作品数:2 被引量:9 H指数:2 供职机构: 山西农业大学农学院 更多>> 发文基金: 山西省科技攻关计划项目 山西省科技基础条件平台建设计划项目 更多>> 相关领域: 农业科学 更多>>
山西省植物病原镰孢菌种群分布及遗传变异分析 被引量:3 2017年 【目的】通过对镰孢菌(Fusarium)ITS、EF-1α和β-tubulin 3个基因序列比较分析,筛选适合于镰孢菌种类鉴定的基因序列,并以此序列分析山西省植物病原镰孢菌种群分布及遗传变异情况。【方法】从2013—2015年在山西省11市28县(区)采集分离的625株镰孢菌菌株中选取形态学清晰的菌株进行ITS、EF-1α和β-tubulin基因序列联合分析,运用Sequencher软件对序列进行拼接和校对,将测序结果与NCBI及FUSARIUM-ID数据库中所有已公布的序列进行BLAST分析,结合下载概念清晰或标准种序列,运用Clustal X和Gel Doc软件进行序列对齐和编辑,运用MEGA、Excel、DNAstar和Taxon Gap软件分析镰孢菌种内种间遗传变异情况,从ITS、EF-1α和β-tubulin中筛选适合镰孢菌种类鉴定的基因序列,并以此序列分析山西省镰孢菌的种群分布特点等。【结果】在3个候选基因序列中,EF-1α基因序列是最适用于镰孢菌种类鉴定的基因序列,其种间平均遗传距离分别是种内平均遗传距离的24倍,种内差异小于种间差异的种的数量最多,达到供试种的73%,物种鉴定准确率最强,达到87%。基于EF-1α基因片段的系统发育分析结果表明,在供试的27种镰孢菌中,有22种表现出单系性,相同种的不同菌株以较高支持率聚成独立支。在27种镰孢菌中,F.oxysporum是山西省镰孢菌的优势种,分离频率最高(22.1%),且分布最广,在23个县(区)均有分布;其次是F.solani(13.8%),在14个县(区)有分布。从不同地区镰孢菌的种群结构及分布来看,运城、临汾、忻州、长治、吕梁、晋中和太原均以F.oxysporum为优势种,朔州以F.lateritium为优势种,大同以F.solani为优势种,晋城以F.verticillioides为优势种,阳泉以F.incarnatum为优势种;其中晋中和忻州的镰孢菌种类最丰富,临汾次之,朔州最少。从不同寄主镰孢菌的种群结构及分布来看,番茄上镰孢菌的种类最多(15种),其次是马铃薯(13种)和大豆(1 王琳 李新凤 徐玉梅 畅引东 王建明关键词:镰孢菌 种群分布 系统发育分析 抑杀根结线虫的疣孢漆斑菌代谢活性物质的分离鉴定 被引量:6 2019年 根结线虫病是设施蔬菜生产中一种常见病害(Chen et al.,2004),几乎能侵染温室内所有蔬菜,已严重影响该产业发展。真菌的胞外酶或者次生代谢毒素能促进寄生真菌对线虫的寄生(Fleming et al.,1990)或毒杀线虫(金娜等,2015)等。从高等真菌中筛选毒杀线虫的活性化合物,有助于获得新型、安全的高效杀线剂。 董海龙 王海香 张作刚 徐玉梅 王琳 王建明关键词:根结线虫病 次生代谢 寄生真菌 活性化合物 常见病害