刘书东
- 作品数:35 被引量:36H指数:3
- 供职机构:塔里木大学更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金新疆生产建设兵团博士基金塔里木大学校长基金更多>>
- 相关领域:农业科学生物学经济管理更多>>
- 普通PCR与TD-PCR扩增叶尔羌高原鳅抗菌肽Hepcidin基因的比较被引量:1
- 2011年
- 为了比较普通PCR和降落PCR(TD-PCR)扩增Hepcidin基因的效果,通过Trizol法提取叶尔羌高原鳅肝胰脏总RNA并合成cDNA,分别利用普通PCR和降落PCR扩增Hepcidin基因片段。结果显示,降落PCR能有效扩增叶尔羌高原鳅Hepci-din。测序结果显示:叶尔羌高原鳅抗菌肽Hepcidin基因与普通鱼类基因同源性达90%,而普通PCR则不能扩出明显目的条带。本研究结果表明在相同反应体系中,降落PCR在不影响PCR特异性的条件下,能提高扩增效率,可用于扩增普通PCR难以扩增的基因片段。
- 刘书东王娟娟陈根元李莲瑞
- 关键词:降落PCR叶尔羌高原鳅HEPCIDIN基因
- 绵羊基因组26号染色体上绵羊脱毛症相关基因的分析方法
- 本发明公开了一种绵羊基因组26号染色体上绵羊脱毛症相关基因的分析方法,包括步骤如下:步骤1:取健康绵羊和脱毛症绵羊的26号染色体,进行case‑control分析,确定分子标记位点及分子标记位点所在26号染色体的物理区域...
- 刘书东陈根元王帅
- 文献传递
- 新疆多浪羊白细胞介素8 cDNA的克隆测序及其变异SNP的分析被引量:1
- 2011年
- 采集多浪羊的血液,分离白细胞,提取总RNA,用白细胞介素8(IL-8)的引物进行两步法的RT-PCR扩增、克隆与酶切鉴定,测序后进行序列比对,与NM_001009401.1同源性高达99%,初步判定为多浪羊的IL-8编码全长cDNA。通过序列比对,发现多浪羊IL-8的基因起始密码子上游第七个碱基发生突变,在NM_001009401.1中是T,而在测序的多浪羊的IL-8中是C。对该测序序列进行数据库搜索和序列比对,发现该碱基变异很独特,并对该变异可能对mRNA蛋白翻译的影响进行了初步的分析。
- 杨威华左文斌潘辉贺艳艳刘书东徐丽君王娟娟李莲瑞
- 关键词:多浪羊白细胞介素8SNPMRNA二级结构
- 高致病性蓝耳病毒与低致病性蓝耳病毒RT-PCR检测方法被引量:7
- 2011年
- 将高致病性蓝耳病和低致病性蓝耳病病毒接种于Marc145细胞培养并观察细胞病变情况,将有细胞病变的病毒进行连续传代培养。根据高致病性蓝耳病与低致病性蓝耳病在NSP2基因上有87 bp连续缺失,从NCBI上下载7对高致病性蓝耳病保守序列设计一对引物。通过RT-PCR方法进行检测证明实验室所保存的这两株毒株分别为高致病性蓝耳病和低致病性蓝耳病,并且建立了高致病性蓝耳病与低致病性蓝耳病的检测方法。
- 顾海洋左文斌贺艳艳潘辉刘书东李莲瑞
- 关键词:蓝耳病NSP2基因RT-PCR
- OXT基因在策勒黑羊卵巢不同生理时期的表达差异及生物信息学分析
- 2023年
- 本研究旨在通过分析OXT基因的生物信息功能及其在策勒黑羊卵巢组织不同生理时期的表达量,为其在绵羊卵泡发育过程中调控功能的研究奠定基础。根据绵羊OXT基因序列,设计特异性引物,用MEGA5.1软件构建OXT蛋白的系统进化树,并通过生物信息学软件预测该蛋白理化性质、结构以及亚细胞定位和蛋白互作,采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测策勒黑羊卵泡期、黄体期以及妊娠早期卵巢组织中OXT基因表达量。生物信息学分析发现,策勒黑羊OXT基因CDS区序列全长为378 bp,编码126个氨基酸,没有CpG岛,理论等电位为5.54,OXT蛋白是不稳定的疏水性蛋白,相对保守的神经垂体肽激素,其存在1个跨膜结构域和1个信号肽。OXT蛋白定位于细胞外,在细胞核和线粒体中也有表达,可与GNRH1、POMC、TRH、AVP、CRH、PRL、LNPEH等蛋白发生互作。qRT-PCR结果显示,OXT基因在策勒黑羊黄体期卵巢中的表达量极显著高于卵泡期和妊娠早期,且妊娠早期OXT基因表达量显著高于卵泡期,说明OXT基因在绵羊卵泡发育方面发挥重要作用。本研究结果为研究OXT基因表达和促进优势化卵泡生长及排卵作用机制奠定基础,并为解析策勒黑羊常年发情提供分子生物学参考。
- 周稳韩志鹏白新宇张璐璐王彩军王权锋杨建礼马正委佐建明刘书东刘春洁
- 关键词:策勒黑羊生物信息学
- 棉酚对多浪羊淋巴细胞凋亡的影响被引量:2
- 2011年
- 通过棉酚对多浪羊淋巴细胞的研究,探索棉酚体积分数对淋巴细胞的影响.主要用细胞培养、瑞氏-吉姆萨染色、DNA电泳等方法观察棉酚对多浪羊淋巴细胞的凋亡效应.结果表明:当细胞培养液中棉酚体积分数为0.071mol/L,培养淋巴细胞8h后,可抑制多浪羊淋巴细胞的增殖,并且促进其凋亡.
- 刘书东左文斌贺艳艳潘辉徐丽君顾海洋杨威华李莲瑞
- 关键词:棉酚多浪羊淋巴细胞凋亡
- 策勒黑羊X染色体多胎性状的关联分析
- 2024年
- 为促进多胎性状策勒黑羊品种的培育,以策勒黑羊多胎性状和X染色体分子标记为对象,探究策勒黑羊多胎性状在X染色体上的遗传解析。选择100只策勒黑羊进行基因分型,利用PLINKv1.90进行质量控制,同时对X染色体上的SNP位点和策勒黑羊的多胎性状进行关联分析,选取P<0.01的SNP位点进行标记,将筛选出的SNP位点附近的基因进行注释和分析,获得X染色体多胎性的候选基因。结果表明,有14个SNPs与策勒黑羊X染色体多胎性状在全基因组范围内显著相关。共筛选出20个候选基因,对20个候选基因进行生物学功能分析,多胎性状相关联的候选基因6个,其中,FTH1基因已有文献报道是多胎性状的候选基因。
- 彭玉薇王尚龙王渊锋王权锋杨建礼马正委佐建明刘书东
- 关键词:策勒黑羊多胎性状X染色体候选基因
- 一组与南疆绵羊抗病力有关的基因及其筛选方法与应用
- 本发明涉及一组与南疆绵羊抗病力有关的基因及其筛选方法与应用,属于分子生物学技术领域。本发明筛选得到一组与南疆绵羊抗病力有关的基因,包括DVL2、ALOX12B等42个基因中的一种或多种。这些基因为以后选育南疆地区绵羊的引...
- 刘书东韩志鹏周稳韩亚辉
- 一种与绵羊品种质量、对恶劣环境适应性有关的SNP探针及应用和基因组芯片
- 本发明涉及分子生物学技术领域,尤其涉及一种与绵羊品种质量、对恶劣环境适应性有关的SNP探针及应用和基因组芯片。本发明筛选出可用于制备基因芯片的4992个探针组合。该基因芯片覆盖绵羊26条常染色体和x性染色体,用于对绵羊品...
- 刘书东张成龙
- 策勒黑羊母羊脂尾性状特征及其与体重、体尺的相关性分析被引量:3
- 2022年
- 为了探究策勒黑羊脂尾性状特征及其与体重、体尺的相关性,试验选取健康的成年策勒黑羊母羊408只,测定体重(y)、体高(x_(1))、体长(x_(2))、体斜长(x_(3))、胸宽(x_(4))、胸深(x_(5))、胸围(x_(6))、管围(x_(7))、尾长(x_(8))、尾宽(x_(9))和尾周长(x_(10)),计算尾体积(x_(11)),分析策勒黑羊母羊的尾体积差异,根据尾体积进行尾型分型,并对体重与脂尾性状和体尺指标进行相关性分析,构建体重的最优回归方程。结果表明:策勒黑羊母羊平均尾体积较大,为(18108.51±11868.52)cm3,策勒黑羊母羊的尾型分为小尾型、中尾型、大尾型和肥尾型;肥尾型策勒黑羊母羊的数量比较少(9只),中尾型数量较多(223只);肥尾型的策勒黑羊母羊的体重、体长、体斜长、胸围、尾长、尾宽和尾周长均极显著大于其他三种尾型(P<0.01);策勒黑羊母羊的体高、体长、体斜长、胸深、胸围、管围、尾长、尾宽和尾周长与体重均呈极显著正相关(P<0.01);构建的母羊体重最优回归方程为y=0.152x_(5)+0.078x_(6)+0.146x_(9)+0.284x_(2)+6.430。说明策勒黑羊尾部性状与体重密切相关,揭示尾部性状对产肉性能具有一定影响,在策勒黑羊生产性能测定和品种选育中要关注尾部性状。
- 米热妮萨·图尔荪托合提张继虎买尔哈巴郑浪漫李亮刘书东
- 关键词:策勒黑羊体尺性状