冯沛春
- 作品数:4 被引量:12H指数:2
- 供职机构:西南交通大学生命科学与工程学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:农业科学医药卫生更多>>
- 铁皮石斛甘露糖结合凝聚素的分子建模与对接研究
- 2013年
- 本文通过序列分析获得了铁皮石斛甘露糖结合凝聚素(Dendrobium officinale mannose-binding lectin,DOL)成熟肽和甘露糖结合位点(50-58AA,81-89AA,116-124AA)。通过同源建模建立了DOL三维结构模型,DOL呈中空的三棱柱结构,三棱柱的三个侧面主要由β折叠构成,三个侧面各有一个甘露糖结合部位。甘露糖与DOL的分子对接和动力学分析表明,结合位点50-58AA和81-89AA对甘露糖的结合要强于116-124AA,在与甘露糖结合的过程中发挥关键作用的氨基酸残基为Gln81,Asp83,Asn85和Tyr89。研究结果有助于进一步开展凝集素抗病机理及凝集素相关药物研究。
- 朱梦丽朱乾坤邹嘉欣冯沛春范高韬王万军
- 关键词:甘露糖结合凝集素铁皮石斛同源建模分子对接
- 山慈菇(杜鹃兰)快速繁殖技术优化及铁皮石斛叶cDNA PCR文库的构建
- 山慈菇是常用的名贵中药材,具有清热解毒、化痰散结等功效,临床上常用作抗肿瘤药物。《中华人民共和国药典》(国家药典委员会,1995,2000,2005)记载:山慈菇为兰科(Orchidaceae)植物杜鹃兰(Cremast...
- 冯沛春
- 关键词:快速繁殖
- 通过RACE技术构建铁皮石斛叶mRNA的cDNA PCR文库
- 2014年
- 基于RACE技术,以铁皮石斛叶片总RNA为起始材料,通过逆转录和末端转移构建出两端含有特定序列的cDNA。然后以连接有特定序列的引物进行cDNA的PCR扩增,从而构建出mRNA的cDNA PCR文库。结果表明:cDNA PCR文库的PCR效果明显高于逆转录产物的PCR效果,该方法构建的cDNA PCR文库能使cDNA放大100倍以上;以5pg的总RNA为起始材料构建cDNA PCR文库仍可得到良好的PCR扩增效果;该研究的cDNA PCR文库构建方法费用较低,操作简单,为克隆微量表达的基因提供了技术基础。
- 冯沛春崔毅慧张子凤朱乾坤王万军
- 关键词:CDNARACE逆转录PCR
- 细胞周期蛋白家族的生物信息学分析被引量:3
- 2012年
- [目的]对细胞周期蛋白家族的序列进行生物信息学分析,从而研究物种间细胞周期蛋白的分类体系。[方法]选取已完成基因组测序的10个物种的细胞周期蛋白,按细胞周期蛋白中周期蛋白框结构域的序列完整性及结构域的数目进行分类,并进行多次筛选比对,分别构建具完整单周期蛋白框结构域和完整双周期蛋白框结构域细胞周期蛋白的系统发育树。[结果]随物种进化,细胞周期蛋白的序列类型和序列数量显著增加。对完整单域和完整双域细胞周期蛋白的聚类分析结果显示,原核生物的细胞周期蛋白、单细胞真核生物的PHO80与PCL、植物的P和U、动物的Y组成原核型细胞周期蛋白,并进化形成真核型细胞周期蛋白,真核型细胞周期蛋白的进化趋势是增加类型和数量,动物以增加细胞周期蛋白的类型为主,而植物则是以增加细胞周期蛋白类型中的成员为主;另一进化趋势是由单域向双域发展,物种进化程度越高,所具有的双域细胞周期蛋白的类型就越多。[结论]为物种间细胞周期蛋白的分子进化研究提供了参考。
- 万晶冯沛春王万军
- 关键词:细胞周期蛋白结构域进化分析