袁永娜
- 作品数:14 被引量:4H指数:1
- 供职机构:兰州大学更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:自动化与计算机技术理学医药卫生生物学更多>>
- ARDGPR模型预测RNA中原子多极距的计算方法
- 本发明涉及基于ARDGPR模型预测RNA中原子高阶多极距的计算方法:通过量子力学计算软件Gaussian09优化所有RNA分子小片段的结构,并通过AIMALL软件积分计算分子中原子的高阶多极距;对每一种小分子片段,选择部...
- 袁永娜刘振宇
- 文献传递
- 基于并行式深层细粒度模型预测药物靶标结合性的方法
- 本发明公开基于并行式深层细粒度模型预测药物靶标结合性的方法,包括:获取药物、蛋白质、疾病的数据集,基于数据集,通过并行计算训练预测模型,并对训练好的预测模型进行验证;获取药物靶标数据,通过验证后的预测模型对药物靶标数据进...
- 袁永娜张宇豪孟祥博刘振宇
- 基于GECo模型预测化合物-蛋白质亲和力的计算方法
- 本申请公开了基于GECo模型预测化合物‑蛋白质亲和力的计算方法,包括以下步骤:获取数据集中的化合物‑蛋白质对数据;对所述化合物‑蛋白质对分别进行处理,分别得到化合物分子特征和蛋白质分子特征;将所述化合物分子特征和所述蛋白...
- 袁永娜王欣刘振宇
- 改进分子力场中静电能项的精确度:通过多极距计算RNA中原子间静电相互作用能
- RNA性质的计算研究一般是通过分子力学方法来定义分子势能。用于RNA模拟的分子力场通常是通过点电荷来计算原子间静电作用能,而这并不符合原子的电子云分布的实际情况。事实上,原子的电子云分布是随着分子结构不同变化的,而并不是...
- 袁永娜张壮壮Matthew J.L. Mills
- 关键词:RNA
- 文献传递
- 一种基于Wfold模型的RNA二级结构预测方法
- 本发明公开了一种基于Wfold模型的RNA二级结构预测方法,包括以下步骤:从数据库中选取已知的RNA二级结构数据并进行预处理和划分,获得训练数据集和测试数据集;构建Wfold神经网络模型,将训练数据集作为输入对模型进行训...
- 袁永娜杨恩杰
- QSPR/QSAR在化学、药物化学和环境科学中的应用研究
- 定量结构-性质/活性关系(Quantitative Structure-Property/ActivityRelationship,QSPR/QSAR)方法是目前非常热门的研究领域之一,它主要应用各种统计学方法和分子结构...
- 袁永娜
- 关键词:化学信息学最小二乘支持向量机药物化学环境科学
- 文献传递
- 基于启发式方法和支持向量机定量研究药物的血脑屏障通透性被引量:1
- 2007年
- 构建55个药物分子与其血脑屏障通透性(log B)之间的定量结构—性质关系模型,探讨影响药物血脑屏障通透性的结构因素.应用CODESSA软件计算55个化合物的组成、拓扑、几何、静电和量子化学等结构参数,通过启发式方法筛选得到最佳的结构参数,并建立线性回归模型;用所选的4个结构参数作为支持向量机的输入,建立非线性的支持向量机回归模型.预测结果表明:支持向量机回归模型性能(R^2=0.89,MSE=0.06)要优于启发式回归模型的性能(R^2=0.82,MSE=0.11).描述符HASA2,NO,FPSA3和E(CH)都是影响log B的主要结构因素.支持向量机模型简单快速,在药物设计中可以用来预测候选药物的log B值。
- 阮晓芳张瑞生胡荣静袁永娜刘满仓范波涛
- 关键词:血脑屏障支持向量机定量结构-性质关系
- 基于联合式跨域注意力模型预测药物靶标结合性的方法
- 本发明公开了一种基于联合式跨域注意力模型预测药物靶标结合性的方法,包括,从药物、蛋白质数据库中提取生物分子化学结构信息和药物‑靶标作用的文本语义信息作为原始数据,构建数据集;基于端到端的联合式架构的耦合神经网络,构建用于...
- 袁永娜张宇豪孟祥博单爽王圣珂
- 一种基于预训练模型的汉语到盲文的自动转换方法及系统
- 本申请公开了一种基于预训练模型的汉语到盲文的自动转换方法及系统,其中方法包括以下步骤:构建预训练语料库、汉盲平行语料库和机器翻译模型;对所述预训练语料库和所述汉盲平行语料库进行编码,得到编码后预训练语料库和编码后汉盲平行...
- 苏伟于海龙袁永娜许存禄
- 基于并行式深层细粒度模型预测药物靶标结合性的方法
- 本发明公开基于并行式深层细粒度模型预测药物靶标结合性的方法,包括:获取药物、蛋白质、疾病的数据集,基于数据集,通过并行计算训练预测模型,并对训练好的预测模型进行验证;获取药物靶标数据,通过验证后的预测模型对药物靶标数据进...
- 袁永娜张宇豪孟祥博刘振宇