闫亚飞
- 作品数：5 被引量：25H指数：3
- 供职机构：安徽医科大学第一附属医院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 胃癌化疗抵抗基因PMP22下游的生物信息学机制被引量：6
- 2019年
- 目的探寻外周髓磷脂蛋白22(PMP22)的下游关联基因及其通路,为揭示胃癌化疗(CTx)抵抗的分子机制提供基础。方法基因表达数据库(GEO)获取短发夹核糖核酸敲减和未敲减PMP22的数据库系列(GSE)数据GSE94714,数据库R语言(GEO2R)分析差异表达基因,筛选后行富集和通路分析,互作基因检索工具(STRING)数据库建立蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,细胞图景(Cytoscape)的分子复合物探测(MCODE)模块分析,细胞核心插件(CytoHubba)筛选网络中的关键基因,癌症药物敏感性基因组学(GDSC)数据库分析基因与药物敏感性的关系。结果 PMP22下游10倍变化的差异基因314个,上调283个,下调31个,主要富集于细胞黏着连接、细胞-细胞黏附、多聚腺嘌呤核糖核苷酸结合和细胞周期通路。PPI中4个亚模块主要与剪接体、泛素介导的蛋白水解通路(P<0.01)和3个反应组学(REACTOME)通路(P<0.05)关联,最大集团中心性(MCC)算法得到包括肽基脯氨酰异构酶E(PPIE)、核内不均一性核糖核蛋白A1(HNRNPA1)、Y框结合蛋白1(YBX1)的关键基因10个,富含腺嘌呤胸腺嘧啶(AT)蛋白质1A交互域(ARID1A)、死亡盒(DExH)解旋酶9(DHX9)与癌细胞对顺铂的敏感性有关。结论 PMP22主要通过多种细胞组分、分子功能、生物过程和通路参与胃癌CTx抵抗,ARID1A等关键基因和细胞周期、剪接体、泛素介导的蛋白水解通路是治疗胃癌PMP22相关CTx抵抗的潜在靶点。
- 汪圣毅张永红闫亚飞李旭升程彦李永翔
- 关键词：胃癌化疗抵抗生物信息学分析关键基因
- 胃癌患者术前中性粒细胞/淋巴细胞比值与临床病理特征的关系被引量：6
- 2019年
- 目的探讨胃癌患者术前中性粒细胞/淋巴细胞比值(NLR)分布与临床病理特征等相关因素的关系。方法选取2016年8月—2017年12月在安徽医科大学第一附属医院行胃癌根治术患者706例。根据NLR 值将患者分为高NLR 组和低NLR 组。收集患者入院第1 次血常规检验结果,包括中性粒细胞计数、淋巴细胞计数。记录患者性别、年龄、体重指数(BMI)、肿瘤浸润深度、淋巴结转移程度分期、远处转移、临床病理分期、组织分化类型、组织分化程度、肿瘤位置、检出淋巴结个数、转移淋巴结个数、肿瘤最大径及CEA 等相关数据。采用单因素或多因素分析胃癌患者NLR 分布的影响因素。结果男女性NLR 分布比较,差异无统计学意义(P >0.05)。23~ 44岁、45 ~ 59岁、60 ~ 85岁患者NLR 分布比较,差异无统计学意义(P >0.05)。两组BMI、浸润深度、淋巴结转移程度分期、临床病理分期及肿瘤最大径比较,差异有统计学意义(P <0.05)。多因素Logistic 回归分析结果显示,肿瘤最大径是NLR 的独立影响因素[OR=1.790,95% CI(1.094,2.928)],高NLR 组的患病风险是低NLR 组的1.790 倍(95% CI :1.094,2.928)。结论术前NLR对肿瘤浸润深度及淋巴结转移分期有提示作用,NLR 同时受BMI 的影响,肿瘤最大径可作为影响NLR 的独立影响因素。
- 闫亚飞汪圣毅李旭升程彦
- 关键词：淋巴细胞胃肿瘤
- 胃癌顺铂抵抗相关免疫标记基因的富集分析被引量：2
- 2020年
- 目的采用基因集富集分析(GSEA)方法寻找胃癌抵抗顺铂的免疫标记基因(ISGs)。方法用GEO数据库的GSE94714数据集,GEO2R分析差异基因,观察条件筛选对基因数的作用,GSEA纳入耐药、未耐药组胃癌细胞的全部差异表达基因,与分子标签数据库比较,获取ISGs,交集筛选,Kaplan Meier Plotter分析交集基因对胃癌预后的影响。结果差异表达基因共34183个,其中上调12452个、下调17381个,筛选差异倍数的增加使排除基因数增加。GSEA富集到标准化富集评分(NES)排序前6的条目(P<0.01),其中的交集基因包括线粒体核糖体蛋白L12、富含脯氨酸蛋白13、毛状蛋白样F-肌动蛋白结合蛋白1、聚(RC)结合蛋白1、艾杜糖2-硫酸酯酶、LIM结构域2、富含嘌呤元素结合蛋白A、小视觉叶同源物、CCR 4-非转录复合物亚单位3、转化生长因子β1、二酰甘油激酶ζ、接头蛋白2,12个基因与胃癌的总生存时间有关,均具有统计学意义(P<0.05)。结论GSEA方法可有效获取胃癌顺铂抵抗的ISGs,新发现的基因作为潜在靶点,可促进胃癌化疗抵抗机制的研究。
- 汪圣毅程彦李旭升闫亚飞张尚鑫闫强李永翔
- 关键词：胃癌化疗抵抗
- 薄芝糖肽孵育的PBMC抑制胃癌细胞AGS的增殖迁移被引量：3
- 2018年
- 探讨薄芝糖肽预孵育的胃癌患者外周血单个核细胞（PBMC）对胃癌细胞AGS形态特征、增殖、迁移的影响,为胃癌治疗新方法的研究提供基础。采用薄芝糖肽注射液预孵育PBMC,去除薄芝糖肽继续培养的PBMC,其培养上清液作为实验因素,未用薄芝糖肽预处理PBMC的上清液作为对照,作用于胃癌细胞AGS及其迁移模型,IPP软件测量AGS的形态学参数、迁移平均宽度,计算迁移率。薄芝糖肽预处理及未预处理的PBMC与AGS混合培养,MTT检测AGS的增殖活性。分析发现,实验组AGS的核浆比、梭形细胞面积、Feret最小值、Feret最大值、Feret平均值均显著低于对照组（p〈0.01）;实验组的划痕宽度显著增加（F=11.277,p〈0.05）;实验组AGS的迁移率显著低于对照组（F=12.96,p〈0.01）。结果表明,薄芝糖肽可以调节胃癌患者PBMC的功能,使PBMC减小胃癌细胞AGS的核浆比和直径,抑制其增殖和迁移。
- 张涛闫亚飞汪圣毅李旭升程彦陈志武刘弋
- 关键词：薄芝糖肽外周血单个核细胞增殖迁移
- JMP定制实验设计优化胃癌患者PBMC分离方案被引量：8
- 2017年
- 为探索胃癌患者外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cell,PBMC)分离的优化条件,本研究用JMP10.0软件定制设计方法,研究离心时间、离心速度对PBMC离心厚度的影响,建立模型、刻画最优参数,验证并用台盼蓝染色观察优化条件下离心的PBMC细胞存活率。结果表明,离心时间、离心速度与PBMC厚度存在曲线关系,离心时间与离心速度的交互作用无统计学意义。预测模型的决定系数R2=0.88,预测值与实际值的一致性较好。刻画最优离心时间=10 min,离心速度=2 307 r/min,PBMC厚度预测值=2.596 923 mm,95%CI(2.342 13,2.851 71),验证离心的PBMC厚度=2.7 mm,细胞存活率=95%。本研究采用JMP定制设计方法优化PBMC离心条件,可为标准操作程序的建立提供基础。
- 雷伟汪圣毅张涛闫亚飞陈志武刘弋
- 关键词：PBMC胃癌
