马学平
- 作品数：42 被引量：88H指数：5
- 供职机构：宁夏回族自治区疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：宁夏回族自治区自然科学基金宁夏回族自治区卫生厅科研项目更多>>
- 相关领域：医药卫生农业科学化学工程更多>>
- 宁夏首例猴痘病毒测序及全基因组序列特征分析
- 2024年
- 基于高通量测序技术和生物信息分析方法构建宁夏猴痘病毒分子溯源技术平台,为本地区猴痘疫情防控提供技术支撑。以宁夏首例猴痘病毒核酸阳性样本DNA为模板,超灵敏度猴痘病毒全基因组捕获构建扩增子测序文库,利用Illumina测序平台的Nextseq 2000进行高通量测序,序列拼接后使用在线分析工具Nextclade分析病毒核苷酸变异、基因组谱系分型并进行溯源。生物信息学分析中和抗体A35R蛋白序列及结构。口咽拭子和痘疱液靶基因F3L的Ct值分别为33.6和17.8,痘疱液的病载量高于咽拭子。痘疱液为样本测序后获得有效全基因组序列,测序平均深度为2306×,基因组覆盖率为99.12%,序列属于IIb(西非分支)C.1型,存在84个核苷酸突变位点,引起36个氨基酸突变。系统进化树分析结果显示,与GISAID猴痘病毒数据库中进化关系较近的为云南省提交序列EPI_ISL_18059183(2023⁃06⁃28采样)和日本近期的流行株,其中宁夏序列在共享81个核苷酸突变位点的基础上携带3个独有核苷酸突变位点(C94049T、C142797T、C174897T)。SWISS MODEL同源建模分析A35R蛋白的球状结构域与牛痘病毒A33R蛋白高度相似。成功从痘疱液中获得猴痘病毒全基因组序列,序列全长197209bp,构建了病毒变异和分子溯源技术平台。
- 裴建新吴长城张银豪蒯文和马学平刘翔王文玲吴忠兰
- 关键词：猴痘病毒分子流行病学高通量测序基因特征同源建模
- 人源细粒棘球蚴的RAPD分析体系建立被引量：1
- 2010年
- 目的建立PCR-RAPD反应体系,提升细粒棘球蚴随机扩增多态性DNA(RAPD)遗传多态性研究的稳定性,为研究细粒棘球蚴的分类学以及包虫病的分子流行病学奠定基础。方法采用改进的酚-氯仿抽提法提取细粒棘球蚴基因组DNA,用单因素筛选方法建立PCR-RAPD分析体系。结果采用改进的酚/氯仿抽提方法提取细粒棘球蚴基因组DNA质量高,适用于PCR-RAPD扩增分析;在25μL体系中,RAPD-PCR扩增反应各成分的最佳浓度为:dNTP 0.2-0.3 mmol/L、Taq酶2.5U、随机引物0.8-1.4μmol/L,模板为60ng。PCR扩增最佳条件为:95℃预变性5min;94℃变性30s、32℃退火45s、72℃延伸1min、共35个循环;最后72℃延伸10min;初步从20条引物中筛选出11条带型丰富的随机引物。结论酚-氯仿适用于提取细粒棘球蚴基因组DNA,优化的RAPD反应体系和筛选出的随机引物适合进行细粒棘球蚴RAPD遗传多态性分析。
- 马学平李丽秦迎旭高建炜田涛
- 关键词：基因组DNA提取
- 一种用于收集空气中呼吸道病毒采样装置
- 本实用新型公开了一种用于收集空气中呼吸道病毒采样装置，包括装置主体和设置在装置主体外壁的拆卸机构，所述拆卸机构包括卡合组件，通过设置卡杆，当在通过病毒采样装置对病毒进行采样时，为了提高对不同尺寸粒径的滤网和采集盒进行便捷...
- 马学平蒯文和张银豪吴忠兰詹军裴建新孙晓强杨东智曹慜袁芳李龙山张薇穆婷
- 宁夏2002-2008年布鲁氏菌病门诊血清学结果分析被引量：6
- 2009年
- 目的依据布鲁氏菌病血清学结果分析,提出或建议有关部门加强布鲁氏菌病的有效预防控制措施。方法参照《布鲁氏菌病防治手册》、传染病GB15988-1995国家标准方法进行布鲁氏菌试管凝集试验。结果宁夏疾病预防控制中心2002-2008年共接诊发热患者680例,其中布鲁氏菌试管凝集试验阳性86例,阳性率达12.65%(86/680),并结合流行病学调查均通过传染病网络直报为新发病例,阳性率远高于国家控制区阳性率在1%以下的考核标准。结论宁夏布鲁氏菌病感染率呈逐年上升趋势,与全国布鲁氏菌病疫情上升趋势相符,局部地区潜在暴发流行的可能,应该引起有关部门高度重视。
- 高建炜秦迎旭田涛马学平
- 关键词：布鲁氏菌病试管凝集试验
- 从1例急性弛缓性麻痹患儿分离到的埃可病毒33型全基因组序列分析
- 2023年
- 目的了解2015年宁夏地区埃可病毒33型(echovirus type 33,E33)分离株基因特征,为今后的科学防控提供参考。方法将2015年急性弛缓性麻痹(acute flaccid paralysis,AFP)监测系统中收集到的病例粪便标本和密切接触者粪便标本按照监测方案要求进行处理后,接种于人恶性胚胎横纹肌瘤(human rhabdomyosarcoma,RD)细胞,分离获得病毒后,提取病毒RNA,通过扩增肠道病毒完整VP1区序列鉴定型别,选取2株采用Illumina全基因测序方法进行全基因组序列测定。用MegaX、DNAstar进行遗传进化分析,利用RDP4和SimPlot3.5.1进行重组分析。结果分离的4株毒株均扩增到完整VP1区序列,鉴定为E33病毒,将测序获得的2株全基因组序列与GenBank中下载的E33原型代表株Toluca-3的全基因组序列比较,核苷酸相似性为79.9%,氨基酸同源性为95.7%。基于E33 VP1区843 bp核苷酸序列构建系统进化树,宁夏地区分离到的E33分离株属于C2亚型,与湖南、江苏、新疆等地流行的E33属于同一亚型,氨基酸序列同源性和核苷酸序列相似性较高。基于全基因组序列和P1、P2、P3区序列分别构建系统进化树,结果显示宁夏地区流行的E33在全基因组进化树上与新疆地区流行的EV-B85聚类,未与E33原型株聚类。宁夏地区流行的E33在P1区基因进化树上与E33原型株聚类,在P2、P3区基因进化树与EV-B85聚类。用RDP4和Sim Plot3.5.1软件进行重组分析后证实宁夏地区流行的E33为重组株,在P1区与E33原型株重组,在P3区与EV-B85重组。结论宁夏地区流行的E33为E33原型株和EV-B85重组形成的新的重组病毒,有关该重组株的致病性有待进一步的研究。
- 袁芳周娟曹慜张薇马学旻马江涛魏新峰马学平王青利
- 关键词：急性弛缓性麻痹肠道病毒全基因组遗传进化分析
- 淡色库蚊幼虫对5种杀虫剂的敏感性调查被引量：3
- 2015年
- 目的了解宁夏回族自治区吴忠市淡色库蚊幼虫对5种杀虫剂的敏感性状况。方法采用浸渍法,测定淡色库蚊幼虫现场种群的半数致死浓度(LC50)。结果与文献报道的敏感品系试虫比较,吴忠市淡色库蚊幼虫对高效氯氰菊酯、溴氰菊酯、残杀威、DDT、双硫磷抗性倍数分别为0.053、0.077、0.007、0.003和11.50倍,调查结果显示,吴忠市淡色库蚊幼虫对高效氯氰菊酯、溴氰菊酯、残杀威、DDT这4种杀虫剂均处于敏感水平,对双硫磷具有中等抗性。结论对4种尚未产生抗药性的杀虫剂均可轮换应用于灭蚊工作中。
- 韩坤詹军张术斌高建炜马学平
- 关键词：淡色库蚊浸渍法敏感性杀虫剂
- 一种快速鉴别新型冠状病毒型别的试剂盒及方法
- 本发明公开了一种快速鉴别新型冠状病毒型别的试剂盒及方法，该试剂盒包括荧光标记探针和引物对：引物对包括用于扩增与新冠病毒ORF1ab区互补的cDNA的引物对1和用于扩增与新冠病毒ORF8区互补的cDNA的引物对2；荧光标记...
- 马江涛蒯文和张银豪赵建华马学平袁芳曹慜马学旻高建炜刘翔赵军李海军
- 2021年宁夏回族自治区银川市流感样病例人鼻病毒感染情况及基因分型研究被引量：1
- 2023年
- 目的了解2021年宁夏回族自治区银川市流感样病例人鼻病毒(HRV)感染情况及基因型别,为呼吸道感染有关疾病防治及控制提供依据。方法选取2021年1—12月银川市2家国家流感监测哨点医院具有呼吸道感染症状的鼻咽拭子样本,通过实时荧光定量反转录聚合酶链式反应法检测,对筛选的HRV阳性样本VP4/VP2区基因扩增测序,使用Mafft软件进行序列比对,MEGA 11.0软件构建亲缘关系进化树,DNA Star软件分析核苷酸和氨基酸同源性。结果1100份样本中,HRV的总检出率为8.00%(88/1100),其中单一HRV感染阳性率为7.64%(84/1100),合并其他病毒感染阳性率为0.36%(4/1100)。对扩增的57例VP4/VP2基因序列分析,其中A种40例、B种4例、C种13例,涉及28个血清型,A16血清型感染病例最多。HRV-A序列之间的核苷酸(氨基酸)同源性为73.10%~100.00%(78.40%~100.00%),HRV-B为78.50%~98.30%(89.20%~100.00%),HRV-C为68.90%~100.00%(76.10%~100.00%)。结论HRV是引起2021年银川市急性上呼吸道感染患者主要的病毒性病原之一,感染率较高,呈现以HRV-A感染为主,HRV-C次之的多个血清型共流行特点。
- 苏艳艳王新宁曹慜李龙山司冰倩裴建新吴忠兰马学平张银豪
- 关键词：血清型
- 一种便携式呼吸道传染病标本采集防护装置
- 本实用新型公开了一种便携式呼吸道传染病标本采集防护装置，涉及医疗器械技术领域。包括，透明面罩,所述透明面罩的边缘处固定连接有固定圈，所述固定圈的两侧均固定连接有两个弹力带，两个所述弹力带的另一端固定连接有三角连接片，一侧...
- 马学平赵建华蒯文和张银豪吴忠兰裴建新马江涛杨东智曹慜李龙山孙晓强袁芳穆婷詹军
- 宁夏布鲁氏菌Omp31基因序列特征分析被引量：1
- 2015年
- 目的目的对宁夏布鲁氏菌Omp31基因序列进行分析,为菌株种型鉴定和试剂研究奠定基础。方法根据Genebank公布Omp31基因序列设计引物,采用PCR扩增、电泳检测、胶回收、纯化、送基因公司双向测序,用Contig Express软件对测序结果拼接,用DNAstar软件进行结果分析。结果经PCR扩增测序得到Omp31基因全长序列大小为723 bp,编码240个氨基酸,与Genebank上羊种布鲁氏菌Omp31基因同源性达99.9%,氨基酸序列的同源性100%。通过遗传分析,分离株与参考菌亲缘关系相近,与羊种布鲁氏菌处在同一分枝。结论宁夏布鲁氏菌Omp31序列与发布的参考序列之间的同源性很高,而且与羊种布鲁氏菌处在同一分支。
- 高建炜马学平王志翔韩坤张术斌巨艳陈丽莉詹军
