方聪燕
- 作品数：2 被引量：0H指数：0
- 供职机构：中国农业科学院作物科学研究所更多>>
- 发文基金：国家科技重大专项更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 一种植物光诱导型基因启动子及其应用
- 本发明属于分子生物学领域，涉及一种植物光诱导型基因启动子及其应用，本发明提供了一种植物光诱导型基因启动子，其核苷酸序列如SEQ ID No.1所示，或该序列经取代、缺失和/或添加一个或几个核苷酸形成的编码同等功能氨基酸序...
- 杨建平苏亮习雨琳郭林孟凡华宋梅芳侯佩方聪燕
- 文献传递
- 水稻OsPP6C基因的克隆、过表达载体构建与生物信息学分析
- 2013年
- 为克隆水稻蛋白磷酸酶6(PP6)催化亚基基因OsPP6C,并构建该基因的过表达载体以及进行生物信息学分析。采用RT-PCR技术从水稻中花11叶片cDNA中扩增OsPP6C基因全长,并构建与GUS融合的pBI121-OsPP6CGUS表达载体。通过生物信息学方法分析了OsPP6C蛋白的理化性质、与拟南芥AtPP6C(即AtFyPP)之间的同源性以及不同物种间的系统发育关系,此外,对OsPP6C基因的启动子进行了顺式作用元件分析。结果表明,该基因转录序列包含一个912 bp的开放阅读框,编码303个氨基酸残基,蛋白的分子量约为3.47 kDa,等电点为5.13;具有疏水性,但不存在信号肽,属于非分泌型蛋白。OsPP6C与拟南芥AtFyPP1和AtFyPP3氨基酸序列一致性分别为93.73%和93.40%,系统进化树显示OsPP6C与小麦TaPP6C的亲缘关系最近,而与其他物种亲缘关系相对较远。对该基因启动子中含有的顺式作用元件分析表明,该启动子中除TATA盒和CAAT盒外,还含有多种参与光应答、激素(ABA、乙烯、生长素、MeJA和赤霉素等)应答以及低温、热激和干旱等非生物胁迫因子应答的调控元件。为进一步研究水稻OsPP6C基因的表达特性和功能奠定了基础。
- 王青云王润青方聪燕侯佩苏亮李建平宋梅芳杨建平李雪梅吴大付
- 关键词：水稻生物信息学分析
