汤晓芒
- 作品数：2 被引量：2H指数：1
- 供职机构：华东理工大学更多>>
- 发文基金：国家重点实验室开放基金国家自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：理学更多>>
- 通过分析来自Pyrococcus abyssi的腈水解酶中带电基团位置变化探讨蛋白耐热机制被引量：1
- 2012年
- 蛋白含带电侧链基团的氨基酸的位置对蛋白质的热稳定性有很大的影响,目前,往往采用蛋白质结构模型"静态"分析这一影响。本文以1株耐热的腈水解酶作为研究对象,构建并异源表达了该酶,对其酶学性质进行初步分析。利用Discovery Studio对该酶进行同源建模,得到空间结构。将此空间结构利用Gromacs软件在不同温度下进行分子动力学(MD)模拟,使用Macrodox软件计算蛋白质所有带电氨基酸残基的包埋率与溶剂可接触性面积(SA),发现在不同温度下,部分氨基酸带电基团的SA值会发生显著变化。说明通过静态分析并不一定能够得到非常准确的结果,而应进行动态分析。
- 汤晓芒张鲁嘉崔东冰姚志强王学东魏东芝
- 关键词：同源建模分子动力学腈水解酶热稳定性
- 通过优化蛋白表面的电荷分布来对腈水解酶的热稳定性进行理性设计
- 本文旨在通过计算学手段来探索蛋白质表面的静电分布对蛋白质热稳定性的贡献,提出优化表面的静电作用将有利于蛋白质的热稳定性这一假设,并通过设计突变来证明我们的结论。 文中以一株腈水解酶(NCBI编号,AJ248287)作为研...
- 汤晓芒
- 关键词：腈水解酶热稳定性
- 文献传递
