王弋 作品数:6 被引量:10 H指数:2 供职机构: 浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室 更多>> 发文基金: 浙江省科技攻关计划 浙江省科技厅项目 更多>> 相关领域: 农业科学 更多>>
紫竹PPO基因的生物信息学及表达分析 2013年 以紫竹(Phyllostachys nigra)一年紫嫩叶的cDNA为材料获得一个多酚氧化酶基因(命名为PnPPO1)片段,测序显示,该序列长438 bp,该片段编码有146个氨基酸残基组成的多酚氧化酶保守区,该区域包含CuB结合区,其编码的蛋白属于酪氨酸酶(tyrosinase)。Blastp分析显示,该氨基酸序列与小麦(Triticum aestiv)、水稻(Oryza sativa)中的多酚氧化酶有很高的同源性。该蛋白片段分子量约为36.2 kD,pI为5.03。比对一年紫和台湾紫中该基因的序列发现,两者同源性为84.45%,两者间还存在明显的SNP位点会导致酶切点位发生变化和新酶切位点的产生。RT-PCR分析结果表明,PnPPO1基因在叶芽中表达最高,鞭根中微量表达,其余供试组织中未检测到其表达。 关鹰 王弋 郭小勤 林新春 方伟关键词:多酚氧化酶 单核苷酸多态性 雷竹中PvFT同源基因的克隆及表达特性分析 本论文通过同源克隆方法克隆了雷竹(Phyllostachys violascens)中FT的同源基因,获得了FT同源基因PvFT-2的编码区序列。基因组DNA序列与cDNA序列比对表明,该基因含4个外显子和3个内含子,该... 王弋 关鹰 郭小勤 林新春 方伟关键词:雷竹 成花机理 同源基因 克隆表达 文献传递 紫竹多酚氧化酶基因克隆及其表达 被引量:7 2010年 为研究紫竹Phyllostachys nigra多酚氧化酶基因(PPO)表达与紫竹组培苗褐化之间的关系,采用同源克隆方法获得紫竹PPO基因的cDNA与DNA片段,将它命名为PnPPO。随后,研究了该基因在不同褐化程度紫竹组培苗中的表达情况。序列分析显示该基因所编码蛋白为酪氨酸酶(tyrosinase),其序列与小麦Triticum aestivum和水稻Oryza sativa中PPO基因同源性很高,是PPO的同源序列。RT-PCR分析显示,在褐化严重的组培苗中PnPPO的表达量也较高。这说明PnPPO基因的表达与紫竹组培苗褐化存在紧密的联系。 王弋 郭小勤 娄永峰 杨海芸 林新春 方伟关键词:森林生物学 多酚氧化酶 紫竹不同栽培类型PPO基因片段克隆及其序列分析 根据已报道的禾本科植物PPO基因的保守序列(CuA和CuB区)设计一对引物,分别从紫竹不同栽培变型中克隆到PPO基因片段。对这些片段的序列进行了分析,9个序列彼此之间的同源性均达到92%以上,氨基酸序列分析显示,不同栽培... 王弋 娄永峰 林新春 郭小勤 方伟关键词:栽培类型 基因克隆 文献传递 紫竹不同栽培类型PPO基因片段克隆及其SNP分析 根据已报道的禾本科植物PPO基因的保守序列(CuA和CuB区)设计一对引物,分别从紫竹9个不同栽培变型中克隆到PPO基因片段.序列分析显示,9个序列彼此间核苷酸水平上一致性达到92.35%,氨基酸水平上的一致性达到81.... 肖国辉 王弋 娄永峰 林新春 郭小勤 方伟关键词:SNP 紫竹不同栽培类型PPO基因片段克隆及其SNP分析 被引量:3 2013年 根据已报道的禾本科Poaceae植物PPO基因的保守序列(CuA和CuB区)设计1对引物,分别从紫竹Phyl-lostachys nigra 9个不同栽培变型中克隆到PPO基因片段。序列分析显示:9个序列彼此间核苷酸水平上一致性达到92.35%,氨基酸水平上的一致性达到81.83%。在某些栽培类型,一年紫和沟槽紫,该基因存在提前终止的现象。所获得的9条序列间存在明显的单核苷酸多态性(SNP)位点,多数位点引起非同义突变。根据所测得的序列对紫竹不同栽培类型的亲缘关系进行了遗传多样性分析。 肖国辉 王弋 娄永峰 林新春 郭小勤 方伟关键词:植物学