周婷婷
- 作品数:4 被引量:12H指数:3
- 供职机构:国防科学技术大学计算机学院并行与分布处理国家重点实验室更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家重点实验室开放基金更多>>
- 相关领域:自动化与计算机技术更多>>
- 代谢网络结构特征的生物信息学研究被引量:3
- 2010年
- 作为生物信息学的重要研究内容,近年来代谢网络结构特征方面的研究取得了许多成果。回顾了代谢网络的重构和表示方法,重点综述了代谢网络宏观结构特征所蕴含的生物学意义,以及拓扑特征所揭示的网络演化过程和网络稳健性信息,提出了目前研究中仍然存在的问题及可能的解决思路,并对将来的研究趋势进行了阐述。
- 王正华周婷婷
- 关键词:生物信息学代谢网络网络重构拓扑特征网络演化
- 一种基于KEGG数据库重构代谢网络的新方法被引量:6
- 2010年
- 从代谢物、酶和生化反应信息重新构建正确的代谢网络是各项代谢网络相关研究非常关键的第一步。针对以往重构方法存在的数据难以及时更新、数据有冗余、获取数据慢等问题,本文采用分而治之的递归策略,提出了一种基于KEGG数据库自下而上重构全物种代谢网络的新方法。与以前的方法相比,本方法的优点在于:使用KEGG的Web服务获取数据,以保证数据的准确性和及时更新;依靠KEGG/PATHWAY库的数据选择机制选取数据,以保证构建网络的数据无冗余;整个方法基于Java实现,保证程序的跨平台通用性;通过构建MySQL本地数据库将远程数据本地化,大大降低数据读取的时耗。评估结果显示,该方法不仅能够保证重建网络数据的准确性和及时更新,而且有效地提高了多物种多次重构情况下的网络重构效率。
- 周婷婷容健锋王正华董蕴源王勇献朱云平
- 关键词:代谢网络网络构建WEB服务MYSQL
- 大规模代谢网络分解的生物信息学研究被引量:3
- 2008年
- 随着大规模分子相互作用数据的不断涌现,生物学网络方面的研究正日益得到重视。代谢网络处于生物体的功能执行阶段,其结构组成方式不仅反映了生物体的功能构成,也直接影响代谢工程中的途径分析和研究。作为代谢网络研究的重要环节,实现网络的合理分解不仅对于基因组范围内分子网络的结构和功能研究具有重要意义,也是代谢工程的途径分析和优化得以顺利进行的前提之一。在回顾代谢网络宏观结构和拓扑特征研究成果的基础上,通过对现有分解方法的深入分析,指出缺乏合理且有针对性的模型评估准则是目前网络分解研究中亟待解决的问题之一。今后的研究趋势在于如何整合更多的信息和发展更先进的分析方法,建立更合理的模型,并进一步拓展网络分解的应用范围。
- 王正华周婷婷
- 关键词:生物信息学代谢网络
- 基于SH窗的分帧伪倒谱相减语音增强算法
- 2007年
- 本文基于短时傅立叶变换,用分帧伪倒谱相减100算法使语音和噪声在伪倒谱域中得到更好的分离。文章给出了算法原理与实现过程,并就其中帧分割与重构、窗函数选择与构造(SH窗)等部分详细论述。实验结果表明了该算法的合理性。
- 周婷婷刘慧敏周杰
- 关键词:语音增强