段红
- 作品数：2 被引量：2H指数：1
- 供职机构：中南大学资源加工与生物工程学院更多>>
- 发文基金：国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- RAPD用于20株嗜酸氧化亚铁硫杆菌菌株亲缘性研究被引量：1
- 2014年
- 为研究中国20株嗜酸氧化亚铁硫杆菌菌株的基因多样性,以及基因指纹技术分类与嗜酸氧化亚铁硫杆菌生理生化特性的相关性,使用20种随机引物,通过PCR扩增20株菌株的基因组DNA,并分析凝胶电泳条带的有无,使用Jaccard系数和UPGMA分析菌株间相关性。20种引物产生的条带将20株菌株分成了5组,菌株间相关性系数最小为35.1%(YTW与DXS),而相似系数最大为96.9%(BY-0502与DXS,DY26与DY30)。结果表明:20株来自不同地区的嗜酸氧化亚铁硫杆菌株具有较高的多样性,并且亲缘性分类与各菌株取样地以及最大铜离子耐受能力分类,有较高的分类相似性,说明RAPD技术拥有在嗜酸氧化亚铁硫杆菌内分类鉴定菌株的能力。
- 吴学玲范宏伟段红张真真刘莉莉刘新星
- 关键词：嗜酸氧化亚铁硫杆菌RAPD多样性
- 嗜酸氧化亚铁硫杆菌中金属转运基因的克隆与差异表达被引量：1
- 2013年
- 嗜酸氧化亚铁硫杆菌(Acidithiobacillus ferrooxidans,At.ferrooxidans)广泛应用于铜、锌、锰和镉等金属离子的生物浸出,浸出液中含有大量的金属离子。研究At.ferrooxidans DC菌株在金属离子胁迫下金属转运基因的相对表达,测定At.ferrooxidans DC对Mn2+、Zn2+和Cd2+的最大耐受浓度。应用RT-qPCR技术分析At.ferrooxidans DC中4个金属转运基因(afe_0671、afe_0674、afe_1143和afe_1144)在Mn2+、Zn2+和Cd2+胁迫下的差异表达。利用BLAST等生物学软件对各基因及其编码的蛋白进行生物信息学分析。结果表明:At.ferrooxidans DC菌株对Mn2+、Zn2+和Cd2+的最大耐受浓度分别是0.38、0.18和0.08 mol/L;在Mn2+、Zn2+和Cd2+胁迫下,目标基因的表达均上调,且随着金属离子浓度的增加,上调倍数升高;生物信息学分析表明目标基因编码为与金属转运相关的膜蛋白;在At.ferrooxidans DC中,目标基因编码的蛋白与Mn2+、Zn2+和Cd2+的转运密切相关。
- 吴学玲张云静刘代刚段红范宏伟刘学端
- 关键词：嗜酸氧化亚铁硫杆菌RT-QPCR
