何侃
- 作品数：11 被引量：23H指数：3
- 供职机构：上海交通大学农业与生物学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 微阵列数据的元分析及其在猪重要经济性状遗传机制研究中的应用
- 猪的肉质、胴体与繁殖性状都是重要的经济性状，但由于其测量难度大或遗传力较低等因素，现有之QTL定位和候选基因法研究进展缓慢。目前，微阵列技术已成为在基因组水平研究基因表达的最有力工具之一，与之相对应的微阵列数据库也逐步建...
- 何侃
- 关键词：微阵列胴体PPARΑ早期胚胎发育
- 文献传递
- 基因表达谱分析牛早期胚胎发育过程的调控机理被引量：2
- 2010年
- 早期胚胎的死亡会给畜牧业的发展带来巨大的经济损失,特别是对于母牛生产来说更是如此,因此研究早期胚胎发育过程具有极为重要的价值。文章从公共数据库GEO中选取了关于牛早期胚胎发育过程的一套基因表达谱数据,通过显著性分析及聚类分析来研究牛早期胚胎发育过程中不同时期的基因组表达模式。结果表明:整个牛早期胚胎发育过程大致可划分为3组不同的基因组表达模式阶段;同时,差显基因在不同时期表达量的波动情况表明8-细胞期和16-细胞期在牛的整个早期胚胎发育过程的重要性。另外,通过进一步的功能注释和通路分析表明在牛胚胎早期发育不同阶段时期存在着一些重要因子及相关通路。
- 何侃赵洪波白春艳王起山潘玉春
- 关键词：早期胚胎基因表达谱
- 芯片元分析识别复杂疾病关键基因及通路研究
- 复杂性疾病是由多个基因及环境因素相互作用所致。随着微阵列芯片技术的发展及其越来越多的应用于动物复杂性疾病分子机制的研究,尤其是以人、小鼠、大鼠等为模式动物在动物癌症方面的研究,已经产生了很多高度复杂的数据集。如何从这些海...
- 何侃
- 关键词：复杂性疾病共表达
- 文献传递
- 基于芯片数据分析关于SREBP-1c调控脂肪代谢过程作用机理的研究被引量：2
- 2010年
- 为了研究SREBP—1c作为脂肪代谢过程中重要的核转录因子参与调控动物脂肪代谢过程作用的机理，试验采用显著性差异表达分析及其通路分析在基因表达谱数据库（GEO）中收集到的转录因子SREBP—1c相关的小鼠脂肪组织的转录本芯片数据。结果表明：SREBP—1c是通过一系列的与细胞分化作用相关的靶基因及其通路参与调控脂肪代谢过程的。
- 何侃蒋越王起山俞沛初潘玉春
- 关键词：脂肪代谢转录因子靶基因
- 子宫内膜异位症芯片的元分析研究
- 2009年
- 为了更加系统地研究子宫内膜异位症的发病机制,本文利用在基因表达谱数据库(GEO)中寻找到的与子宫内膜异位症相关的两套芯片数据,运用非参数的基于不同数据源的有序基因列表秩积算法及R程序包进行了元分析,并将其与单个芯片t检验分析结果进行了比较,发现与子宫内膜异位症存在显著性相关的两个重要基因THBS1和THBS2及其参与的细胞外基质受体互作通路。
- 何侃赵洪波潘玉春
- 关键词：子宫内膜异位症芯片通路
- SREBP1及其靶基因在胆固醇生物合成过程中作用机理的研究
- 本文通过荧光定量PCR方法对不同蛋白质营养水平下宁乡猪和杜长大猪7个组织中的基因表达进行检测,分析了SREBP1基因及其三个在胆固醇生物合成通路中的靶基因HMGCR、IDI1和SC4MOL的表达情况。结果表明:①猪群因素...
- 蒋越何侃高运臻王起山俞沛初潘玉春
- 文献传递
- 丙酸通路基因多态性与猪肉质及胴体性状的关联分析被引量：7
- 2012年
- 为了挖掘新的猪肉品质及胴体性状的候选基因,揭示猪肉质及胴体性状的遗传机制,文章将丙酸代谢通路作为候选通路,将通路内基因与猪肉质及胴体性状进行关联分析。实验采用37头三元杂交商品猪作为研究对象,首次针对丙酸通路中7个基因的36个SNP位点利用SNaPshot方法进行基因分型,分别用最小二乘模型及MB-MDR模型与肉质及胴体性状进行关联分析。结果发现,基因PCCB、MUT、MCEE及ACSS2上的4个SNP位点分别与肌内脂肪含量、背膘厚等性状显著相关(P<0.05),ACSS2与猪脂肪含量显著相关;MCEE及MUT与猪的背膘厚显著相关;PCCB基因与脂重显著相关。通过MB-MDR方法检测到多个SNP位点具有互作效应,并与背膘厚、水分含量、脂肪含量显著相关(P<0.05)。另外,丙酸代谢通路中的基因间的互作效应对猪肉品质有显著影响。
- 杨帆王琼萍何侃王明辉潘玉春
- 关键词：多态性肉质品质SNAPSHOT
- 基于小鼠表达谱芯片和比较基因组学分析猪生长发育相关候选基因集
- 2012年
- 为了在更宽、更深的层面上研究猪生长发育机制,得到以通路为单位的候选基因集以克服传统单基因分析方法的缺点。试验利用模式生物小鼠中的芯片技术,通过基因集富集分析方法(GSEA法)分析基因芯片,确定候选通路。对候选通路成员与猪生长发育相关的数量性状基因座(QTL)数据库进行映射,缩小其作用跨度区域,找出作用的关键基因集。结果表明:得到了56个与猪生长发育相关的候选基因集。
- 王琼萍杨帆王明辉何侃俞沛初潘玉春
- 关键词：生长发育性状
- SREBP1及其靶基因在胆固醇生物合成过程中作用机理的研究
- 本文通过荧光定量PCR方法对不同蛋白质营养水平下宁乡猪和杜长大猪7个组织中的基因表达进行检测,分析了SREBP1基因及其三个在胆固醇生物合成通路中的靶基因HMGCR、IDI1和SC4MOL的表达情况.结果表明：①猪群因素...
- 蒋越何侃高运臻王起山俞沛初潘玉春
- 影响梅山猪繁殖性能的生理结构及遗传因素研究进展被引量：9
- 2012年
- 梅山猪是太湖猪的一个类群,以繁殖力高闻名于世。本文通过对梅山猪高产仔数性状的生理结构、遗传因素等加以综述,主要阐述了梅山猪的子宫、胎盘对高产的作用、影响多产仔性能QTL的精细定位、主效基因的多态性与高产仔数之间的关系及早期胚胎特有的发育机能对高产的影响。探讨了如何从基因组水平研究梅山猪高产的成因,以期为深入地解析梅山猪高产的分子遗传机制提供一些参考。
- 颉孝贤王起山何侃陈振亮马育芳潘玉春
- 关键词：梅山猪繁殖性能胚胎基因
