段希洁
- 作品数：4 被引量：7H指数：2
- 供职机构：北京协和医学院更多>>
- 发文基金：艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项国家自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 2012年发现的新冠状病毒分子检测方法的建立与探针优化被引量：3
- 2012年
- 目的建立2012年确定的新冠状病毒的分子检测方法，并筛选优化引物与探针。方法依据最先发表的208bp长的新冠状病毒1b片段核酸序列，比对分析后设计合成常规RT—PCR引物1对及荧光定量RT—PCR引物1对与TaqMan探针2条（TZl，TZ2），同时合成锁核酸修饰的TaqMan探针2条（LNA-TZl，LNA-TZ2）。建立检测新冠状病毒感染的常规RT—PCR方法与4种荧光定量RT—PCR，分析比较其灵敏度与特异性，同时参照欧洲发表的2种荧光定量RT—PCR引物与探针对（upE，ORFlb）建立相应方法，以合成的阳性模板比较6对荧光定量RT—PCR引物与探针的检出灵敏度。结果所合成的常规RT—PCR与荧光定量RT—PCR引物与探针皆有较好特异性，不能扩增其他人冠状病毒模板及常见呼吸道病毒模板，检出下限达50～500拷贝／反应。锁核酸修饰TaqMan探针可改善荧光定量PCR检测方法的反应性能，经锁核酸修饰的TaqMan探针与常规TaqMan探针相比，检出率提高10倍左右，其中LNA—TZl与upE探针对具最佳反应性能。结论本研究所建立的常规RT—PCR与荧光定量RT—PCR可用于新冠状病毒的分子检测，并推荐使用LNA—TZl与upE探针对。本研究为新冠状病毒分子检测方法应用与改进奠定了基础。
- 周为民陆柔剑耿合员李辉段希洁杨扬谭文杰
- 关键词：冠状病毒属分子诊断技术核酸类
- 北京地区成人呼吸道感染患者中HCoV-HKU1感染的初步分析与基因型确定被引量：2
- 2013年
- 目的：对北京地区成人呼吸道感染患者中人冠状病毒（HCoV）HKUl的感染状况进行初步分析，了解其流行分布、临床特点，并确定流行株的基因型别。方法：2011年1月～2012年1月从北京地区成人呼吸道感染患者中收集鼻咽拭子标本559份，利用靶向棘突蛋白S与核心蛋白N的2种巢式PCR方法进行HCoV—HKUl筛查，并对阳性片段进行序列测定，以确定其基因型别；同时，对阳性标本进行常见呼吸道病毒的共感染筛查，进而分析HCoV—HKUl感染的临床表现和流行病学特点。结果：559份鼻咽拭子标本中检出HCoV—HKUl阳性9例（1．61％），其中3例合并HCoV-0C43感染；感染患者临床表现为急性呼吸道症状，以发热（88．9％）、咽痛（66．7％）、寒颤（68％）、流涕（55．6％）和咳嗽（44_4％）为主，其中1例有系统性红斑狼疮史；阳性基因片段系统进化分析发现这9例感染均为HCoV—I-IKUlB型。结论：北京地区近年成人呼吸道感染患者中HCoV—HKUl感染率较低（1．61％）。其流行株基因型为B型。
- 段希洁陆柔剑俞晓燕彭堃王文周为民张陵林王仲谭文杰
- 关键词：人冠状病毒呼吸道感染成人基因型
- 北京地区成人呼吸道感染病人中人偏肺病毒感染情况的初步分析被引量：2
- 2012年
- 目的:了解北京地区成人呼吸道感染患者中人偏肺病毒(hMPV)的感染情况、流行分布和临床表现特点。方法:采集2010年5月至2011年4月北京地区成人呼吸道感染患者鼻咽拭子标本413份,利用巢式PCR法进行hMPV筛查,对PCR阳性片段进行核酸序列测定,确定hMPV感染基因型别;同时,分析hMPV感染的流行病学特点,并对感染阳性患者进行临床表现的初步分析。结果:413份鼻咽拭子标本中检出hMPV阳性4份(0.97%),分别存在于2010年8月、10月和2011年2月、4月,其中1例合并鼻病毒感染;感染患者临床表现主要是发热、鼻塞、流涕、头痛、咳嗽,有1例出现呕吐和腹泻;hMPV阳性片段系统进化分析发现这4例感染中的3例为B2型,1例为A2b型。结论:北京地区成人呼吸道感染患者中存在hMPV感染,其基因型为B2和A2b型。
- 陆柔剑俞晓燕段希洁张陵林王文周为民王仲阮力吕建新谭文杰
- 关键词：人偏肺病毒呼吸道感染成人
- 人冠状病毒HCoV-HKU1流行情况及部分基因序列分析
- 第一部分北京地区部分医院成人急性上呼吸道感染病人中HCoV-HKU1感染情况分析与基因型确定 研究目的: 了解成人上呼吸道感染患者中人冠状病毒HKU1(HCoV-HKU1)的发病率、时间分布、临床特点并确定流行株的基...
- 段希洁
- 关键词：基因序列流行病学呼吸道疾病
- 文献传递
