程长洪
- 作品数：6 被引量：12H指数：3
- 供职机构：南京农业大学无锡渔业学院更多>>
- 发文基金：公益性行业(农业)科研专项中央级公益性科研院所基本科研业务费专项更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 4个暗纹东方鲀群体的遗传多样性分析被引量：6
- 2012年
- 采用10对暗纹东方鲀(Takifugu obscurus)和16对红鳍东方鲀(Takifugu rubripes)微卫星引物对4个暗纹东方鲀群体(1个长江常熟江段捕捞群体,1个江苏扬中放流群体和2个养殖群体)的遗传多样性进行分析。结果显示,20个微卫星位点能成功扩增出片段并且具有一定的多态性,在4个群体中共检测到113个等位基因。每个群体的平均等位基因数为4.95～5.50,平均观测杂合度为0.686 7～0.761 7,平均期望杂合度为0.653 0～0.700 0,平均多态信息含量为0.601 3～0.638 4。各个群体都有一些微卫星位点偏离Hardy-Wein-berg平衡(P<0.05),主要表现为杂合子不足。群体间遗传分化系数为0.040 6,基因流值为5.905 6,群体间遗传分化程度较小,群体间基因流水平较高。4个群体间的遗传相似系数为0.859 0～0.915 8,遗传距离为0.088 0～0.151 9,采用UPGMA法对4个群体进行聚类,可分2类:上海养殖群体单独为一类,扬中放流群体、常熟江段捕捞群体和南通养殖群体为另一类。
- 程长洪张敏莹徐东坡刘凯段金荣周彦锋施炜纲
- 关键词：暗纹东方鲀微卫星标记
- 利用SRAP标记研究四个暗纹东方鲀群体的遗传多样性被引量：6
- 2012年
- 利用相关序列扩增多态性SRAP(Sequence-related amplified polymorphism)分子标记首次对4个暗纹东方鲀(Takifugu obscurus)群体(1个长江捕捞群体、1个放流群体和2个养殖群体)进行了遗传多样性分析。从49对引物组合中筛选出18对扩增条带清晰、稳定的引物组合对4个群体进行扩增,共获得231个位点,其中多态位点数为156个,总多态位点百分率为67.53%。4个群体内多态位点比例为54.98%—58.87%,群体的Nei’s基因多样性指数(H)为0.1992—0.2005,群体Shannon多样性指数(I)为0.2953—0.3016,群体间基因流(Nm)为4.1291。长江捕捞群体的多态位点比例、基因多样性指数、Shannon多样性指数均略高于其他三个群体。采用UPGMA法对4个群体进行聚类分析显示,上海养殖群体单独聚为一类,其余3个群体聚为另一类。AMOVA结果表明遗传变异主要来源于群体内,占总遗传变异的87.40%。以上结果表明,4个暗纹东方鲀群体具有较高的遗传多样性,群体间相似性较大,并且存在一定的基因交流。
- 程长洪张敏莹刘凯徐东坡段金荣周彦锋施炜纲
- 关键词：暗纹东方鲀相关序列扩增多态性
- 暗纹东方鲀SRAP-PCR体系的建立与优化
- 2011年
- 以暗纹东方鲀基因组DNA为材料,利用正交设计L16(45)对影响暗纹东方鲀SRAP-PCR反应的5个因素(Mg2+、Taq酶、dNTPs、模板DNA、引物)在4个水平上进行正交组合,确立了暗纹东方鲀SRAP反应最佳体系为:20μL的PCR体系中含有Mg2+1.5 mmol·L-1、Taq酶0.5 U、模板DNA 75 ng、dNTPs 0.15 mmol·L-1、引物0.2μmol·L-1。利用30个暗纹东方鲀样本对该体系进行验证,结果表明该体系稳定可靠。
- 程长洪张敏莹刘凯徐东坡段金荣周彦锋施炜纲
- 关键词：暗纹东方鲀SRAP正交设计
- 暗纹东方鲀微卫星筛选和群体遗传多样性分析被引量：4
- 2011年
- 为了解长江野生暗纹东方鲀群体遗传多样性现状,采用已发表的16对红鳍东方鲀微卫星引物对暗纹东方鲀基因组DNA进行PCR扩增,结果有10对微卫星引物(占总数62.5%)能扩增出特异性条带。利用这10对微卫星引物对采自长江常熟江段30尾暗纹东方鲀群体进行扩增分析,共获得51个等位基因,每个位点等位基因数在2到10之间,平均为5.1。10个位点平均观察杂合度(Ho)为0.820 0,平均期望杂合度(He)为0.692 8,平均多态信息含量(PIC)为0.630 0。8个位点表现为高度多态(PIC>0.5),2个位点表现为中度多态(0.25
- 程长洪张敏莹刘凯徐东坡段金荣周彦锋施炜纲
- 关键词：红鳍东方鲀暗纹东方鲀微卫星引物
- 一种秀丽白虾SRAP-PCR体系的建立与优化方法
- 本发明涉及一种秀丽白虾SRAP-PCR体系的建立与优化方法，属于渔业生物技术领域；一种秀丽白虾SRAP-PCR体系的建立与优化方法，其特征在于该方法包括25μL的PCR体系中含有Mg2<Sup>+</Sup>2mmol/...
- 张敏莹施炜纲徐东坡刘凯段金荣程长洪
- 文献传递
- 暗纹东方鲀种群遗传多样性研究
- 暗纹东方纯(Takifugu obscurus)俗称河纯,属硬骨鱼纲(Osteichthyes)鲀形目(Tetraodontiformes)(?)屯科(Tetraodontidae)东方纯属(Fugu),是一种重要的洄游...
- 程长洪
- 关键词：暗纹东方纯微卫星标记
- 文献传递
