顾晓燕
- 作品数：4 被引量：41H指数：3
- 供职机构：四川农业大学动物科技学院草业科学系更多>>
- 发文基金：国家科技支撑计划四川省科技支撑计划国家自然科学基金更多>>
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- 基于ISAP标记分析西南扁穗牛鞭草无性系种质遗传多样性和亲缘关系被引量：4
- 2015年
- 利用ISAP标记对来自中国西南地区的44份扁穗牛鞭草（Hemarthria compressa）无性系材料的遗传多样性和群体遗传变异进行了分析研究.结果表明：从72对引物中筛选出19对扩增条带清晰、稳定性好的引物,共扩增出432条带,其中有316条带具有多态性,多态性条带比例（PPB）达73.15％,多态性信息量（PIC）在0.161～0.312之间,平均值为0.269,Shannon多样性指数（H）平均值为0.399,标记指数（MI）平均值为4.584,分辨率（RP）平均值为9.419,基因型指数（GI）平均值为0.937.各无性系间的遗传相似性系数（GS）在0.464～0.908之间,平均值为0.614.UPGMA聚类分析与基于模型的STRUCTURE分析结果相似,显示供试材料间的遗传关系与其地理来源无明显的相关性,采用AMOVA分析对2种方法划分的类群发现大部分变异来自于群体内部.表明ISAP标记能有效地用于扁穗牛鞭草遗传多样性以及基因型鉴定,同时为扁穗牛鞭草无性系的保存、鉴定和新品种选育提供理论依据.
- 郭志慧张新全马啸周朝杰汪霞黄琳凯闫艳红程亚娟顾晓燕刘新
- 关键词：扁穗牛鞭草遗传分化
- 短芒披碱草SRAP-PCR体系的建立和优化被引量：2
- 2014年
- 通过单因子和正交设计两种试验方法,对短芒披碱草SRAP-PCR体系进行优化,得到短芒披碱草20μL SRAP-PCR最优反应体系为:Mg2+2.00 mmol/L、引物0.40μmol/L、Taq DNA聚合酶1.0 U、d NTPs250μmol/L、DNA 30 ng和10×buffer 2μL;各因素水平变化对PCR反应影响从大到小依次是:Mg2+、引物、Taq酶、d NTPs和模板DNA。运用该优化体系对6份短芒披碱草材料进行验证,电泳结果显示扩增条带多态性高,清晰无杂带。该优化体系的建立有助于将SRAP标记技术用于短芒披碱草的遗传育种等研究。
- 顾晓燕郭智慧张新全刘新周朝杰马啸
- 关键词：SRAP-PCR单因子试验正交设计
- 老芒麦种质资源遗传多样性的SRAP分析被引量：19
- 2014年
- 利用SRAP标记,对来自亚洲的84份老芒麦种质的遗传多样性和遗传关系进行了分析.23个引物组合共产生337条扩增带,其中203条为多态性带,多态性比率为60.24％.各种质间遗传相似系数的变幅为0.783～0.965,平均值为0.865.来自于青藏高原和蒙古的种质间的平均遗传相似性（GS）值最小（0.830）,而来自于俄罗斯和蒙古的种质问的平均GS值最大（0.897）.对84份种质的聚类分析表明,供试种质可以划分成2大类,而且聚类结果与原始相似性矩阵间具有很高的吻合度（r=0.88）.同时,主向量分析（PCoA）也得到了与聚类分析类似的结果.方差分析（AMOVA）表明在总的遗传变异中有79.62％发生在地理类群内,有20.38％发生在类群间（ΦST=0.204）,类群间和类群内的变异均为极显著（P＜0.0001）.基于各地理类群间ΦsT值进行的聚类分析也表明青藏高原类群明显区别于其他地理类群.这种聚类模式可能依赖于种质地理来源赋予其的特殊生态地理适应性.本研究结果对于今后老芒麦种质的利用和品种选育提供了有益信息.
- 顾晓燕郭志慧张新全周永红白史且张昌兵蒋忠荣刘新周朝杰马啸
- 关键词：老芒麦种质资源SRAP
- 短芒披碱草异位保护群体的表型多样性研究被引量：16
- 2015年
- 为揭示采集自川西北高原的短芒披碱草野生异位保存群体的表型变异规律,采用变异系数、巢式方差分析、主成分分析、聚类等方法,对川西北短芒披碱草种质资源共7个居群84个单株的32种表型性状进行多样性分析。结果表明,短芒披碱草表型性状在种群间和种群内存在极其丰富的多样性,种群间表型分化系数均值为41.66%,小于种群内变异(58.33%);茎秆、叶片、花序、小穗、颖片和内外稃的表型分化系数均值分别为55.92%,63.18%,38.62%,43.73%,31.45%和33.08%。穗部性状的稳定性较高。除第一颖长和外稃脉数外,其余性状与各地理生态因子间的相关性均不显著。利用群体间欧氏距离进行的UPGMA聚类分析结果表明,7个短芒披碱草野生群体可以划分为4类。Mantel相关分析表明地理距离与种群表型距离(欧氏距离)间相关不显著(r=0.334,P=0.083)。
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- 关键词：川西北高原表型多样性
