李东锋
- 作品数：4 被引量：10H指数：2
- 供职机构：河北农业大学动物科技学院更多>>
- 发文基金：“十一五”国家科技支撑计划国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 无角山羊间性综合征缺失片段的序列特征被引量：3
- 2008年
- 一段长约11.7 kb的片段缺失导致山羊无角和间性突变,称为无角间性综合征（Polled Intersex Syndrome,PIS）。通过对该缺失片段（AF404302）内4个重复序列（1~3120 bp,3988~4565 bp,4989~7088 bp,7875~9135 bp）的结构分析,发现其右侧一段属于LINE-1家族的L1M3分支（7875~9135 bp）,另3段均属于RTE家族的BDDF分支。以缺失片段内两段逆转录酶结构域的全长蛋白序列为参考对NCBI网站牛基因组数据库进行tblastn,并与得到的56条共有序列构建进化树,以此树为基础推断PIS缺失区域大约形成于（22.5~30）百万年前,正好是牛科动物分化趋异的年代,结合其他证据认为该调控方式可能只存在于牛科动物中。该发现也为PIS区域作用机理和non-LTR的竞争学说提供了证据。
- 李东锋周荣艳李祥龙李兰会冯付军徐厚刚
- 关键词：RTE
- 无角山羊间性综合征缺失片段及猪牛基因组中长散布元件的序列分析
- 一段长约11.7kb的片段缺失导致山羊无角和间性突变，称为无角间性综合征（Polled InterseXSyndrome，PIS）。通过对该缺失片段（AF404302）内四段重复序列（1-3120bp,3988-4565...
- 李东锋
- 关键词：基因组
- 文献传递
- 猪牛基因组中长散布元件研究被引量：1
- 2010年
- 本研究旨在探索L1(Long Interspersed Nucleotide Element 1)和RTE(Retrotransposable Element)在牛和猪基因组中的分布、起源及传递方式和相互间作用。使用软件Repeat Masker和Censor探测了牛和猪基因组中L1和RTE的含量及在各条染色体上的分布。结果,L1在牛和猪基因组中的平均含量分别为7.89%和10.64%,平均长度分别为529和608 bp;RTE在牛基因组中的平均含量为11.83%,平均长度为433 bp。猪基因组未发现RTE序列。牛和猪基因组中的L1共有序列各自分为6个家族和14个亚族。牛和猪基因组中的L1含量均随着染色体GC含量的升高而降低,牛基因组中的RTE含量也呈此变化趋势。牛基因组中RTE序列不是从祖先物种纵向传递而来,而是通过横向传递来源于其它未知物种。牛和猪的L1内部、牛RTE内部以及牛基因组中L1和RTE之间存在选择性进化现象。
- 李东锋李祥龙周荣艳李兰会
- 关键词：L1RTE
- 山羊Agouti基因第1内含子T128缺失在中国主要地方山羊品种中的变异被引量：6
- 2009年
- Agouti基因在哺乳动物毛色形成过程中扮演着很重要的角色,通过对山羊Agouti基因序列测定发现第1内含子T128缺失位点,利用PCR-RFLP技术检测该位点在国内10个山羊品种中的多态性,并将其与毛色进行相关性分析。结果表明,T128位点存在2个等位基因A(不缺失)和B(缺失),产生3种基因型AA、AB和BB,其中AB基因型在白色山羊品种中占优势(76.14%),AA基因型在棕褐色山羊品种中频率较高(77.41%),BB基因型是黑色山羊品种的优势基因型(87.92%),推测该位点可能在山羊毛色形成过程中发挥一定作用。T128缺失位点在10个山羊品种的平均期望杂合度仅为0.471 8,基因流为0.319 0,遗传分化系数为0.439 3,表明这10个山羊群体间遗传分化程度较低,遗传多样性相对贫乏。
- 唐春娟李祥龙周荣艳李兰会冯付军李东锋王建涛
- 关键词：山羊AGOUTI毛色
