陈新华
- 作品数:23 被引量:140H指数:7
- 供职机构:国家海洋局第三海洋研究所更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家高技术研究发展计划国家海洋公益性行业科研专项更多>>
- 相关领域:生物学农业科学天文地球医药卫生更多>>
- 一种简便、快速从病毒感染鱼、虾组织中制备PCR模板的方法被引量:8
- 2003年
- 以虹彩病毒 (iridovirus)感染大黄鱼的脾组织、对虾白斑杆状病毒 (whitespotsyndromebaculovirus,WSBV)感染中国对虾的肌肉组织为材料 ,采用一种简便、快速的方法获得了可满足病毒PCR检测的高质量模板DNA ,分别以针对虹彩病毒、WSBV的特异性引物进行PCR扩增 ,均能有效扩增出预期的条带。与常规DNA病毒模板制备方法相比 ,具有简便、快速、提取率高、无污染等优点 ,尤其适用于水产动物病毒PCR检测试剂盒的商品化开发及生产实际应用。
- 陈新华王小文吴文忠
- 关键词:病毒PCR模板虹彩病毒对虾白斑杆状病毒
- 鱼类趋化因子的研究进展被引量:8
- 2006年
- 趋化因子(Chemokine)是由多种细胞在致病因子刺激后分泌的一类低分子量的细胞因子,它们都具有激活和趋化白细胞的作用。趋化因子从结构上可分为四类:CC型、CXC型、CX3C型和C型;从功能上可分为两种类型:一类主要诱导白细胞到炎症部位;另一类主要是对肌体起免疫监控作用。目前,有关鱼类趋化因子的研究主要集中于CXC型和CC型两类,以及其在非特异性免疫中的作用。
- 张金洲陈新华
- 关键词:鱼类趋化因子非特异性免疫
- 深海热液喷口微生物群落研究进展被引量:8
- 2012年
- 1977年在太平洋上的加拉帕戈斯群岛附近深2500m的深海热液区首次发现了独立的生命体系,它被认为是海洋生物学研究领域中最为重大的发现之一。自此,对深海热液喷口生物群落的调查研究吸引了无数科学家的眼球,成为了海洋生物学研究领域的热点之一。30余年来,随着海洋生物学研究技术方法的进步,大量的深海热液喷口生物群落被相继发现,越来越多的喷口生物物种被分离鉴定出来,从而改变了人们对深海热液环境的认识,极大的拓展了人们的海洋生物学知识。
- 魏曼曼陈新华周洪波
- 关键词:微生物群落热液喷口海洋生物学加拉帕戈斯群岛生物学知识生命体系
- 几种分子生物学方法在菌种鉴定中的应用被引量:53
- 2004年
- REP -PCR指纹法、PCR -RFLP分析法、16SrDNA序列分析法在生物多样性研究、菌种鉴定、及微生物资源的开发应用中得到了广泛的应用 ,但最高分辨能力及适用性各不相同。该文采用上述方法对从厦门温泉分离到的嗜热菌进行了鉴定分析 ,并对GeneBank数据库中的同源性较近的细菌 16SrDNA序列进行比较 ,结果发现 :在这三种鉴定方法中 ,REP -PCR法最简单 ,分辨能力最强 ,可鉴别 16SrDNA序列同源性大于 99.5 %甚至完全相同的不同菌株 ;16SrDNA分析能快速准确地对微生物进行分类鉴定 ,它在分类学中的核心地位不可替代 ,但当 16SrDNA序列同源性大于 99.5 %时难以获得准确的鉴定结果 ;PCR -RFLP法分辨力弱 ,可用于种到属水平的研究 ,16SrDNA序列相似性在 96 %以上 ,酶切图谱就难以区分了 。
- 周贤轩杨波陈新华
- 关键词:REP-PCRPCR-RFLP嗜热菌
- 大黄鱼白细胞介素17受体E-like的分子特征及进化分析被引量:3
- 2016年
- 白细胞介素17受体(Interleukin 17 receptor,IL-17R)家族与IL-17细胞因子家族介导的各类反应有着密切联系.IL-17RE-like(IL-17REL)是一类最新发现的IL-17受体,其结构与IL-17RE相似,但尚未发现其配体.本研究克隆得到大黄鱼(Larimichthys crocea)IL-17REL(Lyc IL-17REL)的全长c DNA,其开放阅读框全长1 659个核苷酸,推断可编码一个由552个氨基酸组成的蛋白,含有信号肽、胞外段、跨膜区和胞内段.与其他物种的IL-17REL相似,Lyc IL-17REL蛋白的胞外段具有一个保守的FN I-like结构域,而胞内段缺少IL-17受体家族保守的SEFIR(SEF and IL-17R)结构域.多序列比对分析表明Lyc IL-17REL与日本河豚(Takifugu rubripes)IL-17REL的氨基酸序列同源性最高,序列一致性可达57.0%.系统进化分析表明,脊椎动物的IL-17受体家族可分为2类,IL-17RA/RB/RD为一类,IL-17RC/RE/REL为一类.其中鱼类及高等脊椎动物的IL-17REL与IL-17RE亲缘关系最近,并且推测二者可能是由同一基因从硬骨鱼类之前的物种中分化而来.组织分布表明Lyc IL-17REL在所有被检测的组织中为组成型表达,在黏膜相关组织如小肠和鳃中的表达量最高.大黄鱼受嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)诱导刺激后,Lyc IL-17REL在其头肾及鳃中的基因转录水平均显著上调.这表明Lyc IL-17REL可能在细菌感染引起的免疫反应中起着重要作用.
- 丁扬敖敬群艾春香陈新华
- 关键词:海洋生物学大黄鱼
- 大黄鱼EBI3基因的克隆与表达分析被引量:3
- 2017年
- 通过克隆大黄鱼(Larimichthys crocea)的EBI3(Epstein-Barr virus-induced gene 3)基因并对其进行了序列分析.大黄鱼EBI3(Lyc EBI3)基因开放阅读框长747bp,编码248个氨基酸,存在1个信号肽序列和2个FN3结构域(37~130,145~230).多序列比对发现Lyc EBI3分子与其他已知EBI3氨基酸水平一致性为27.68%~57.53%.Real-time PCR结果表明,Lyc EBI3基因在脾脏和血液中表达量最高,且溶藻弧菌(Vibrio alginolyticus)刺激后,大黄鱼头肾和脾脏中Lyc EBI3基因的转录水平会显著升高,说明Lyc EBI3基因可能参与了抑制由细菌引起的炎症反应.
- 霍洁颖刘小玲林蠡陈新华
- 关键词:海洋生物学大黄鱼分子克隆PCR
- 细胞凋亡信号途径与免疫系统之间的串流被引量:2
- 2008年
- 细胞凋亡作为一种生命体的主要细胞死亡方式,在清除多余或受感染细胞中发挥重要作用。尽管在组织或胚胎正常发育过程中,细胞凋亡诱导免疫反应比较温和,但在病毒感染或者对死亡受体(death receptor,DR)进行刺激时凋亡可以触发强烈的天然和获得性免疫反应。凋亡信号途径中的分子与免疫系统有着复杂的相互作用。本文综述了有关凋亡性死亡在诱导炎症,维持免疫系统动态平衡,促进免疫应答以及凋亡信号途径和免疫系统抗病毒机制相互关系等方面的研究成果,分析细胞凋亡所诱发免疫效应的机制。
- 肖小强陈新华
- 关键词:细胞凋亡免疫系统胱天蛋白酶
- 大黄鱼虹彩病毒PCR快速检测试剂盒的研制被引量:7
- 2005年
- 针对近年来由虹彩病毒所引起的海水养殖鱼类疾病呈日趋严重的态势,该文在证实了引发我国大黄鱼大规模流行病的病原为一种虹彩病毒及测定病毒全基因组序列(111,760bp;GenBankaccessionnumber:AY779031)的基础上,通过与已报道虹彩病毒核酸序列进行分析比较,结合生物信息学手段,确定了以虹彩病毒ATPase基因保守区序列(295bp)作为扩增靶序列,设计合成了一对特异性引物,通过改进PCR模板的制备方法和优化扩增条件,建立了大黄鱼虹彩病毒PCR快速检测技术,并开发成简便、快速、实用的检测试剂盒,该试剂盒的检测灵敏度相当于30个病毒粒子,模板制备时间约30min、回收率为52%、半个工作日即可得到准确的结果,无非特异性扩增带,适用于大黄鱼虹彩病毒病的早期快速诊断、苗种的检疫及水质环境的监测,目前正在推广应用。
- 陈新华董燕红
- 关键词:大黄鱼虹彩病毒PCR检测
- 4株不同来源的嗜酸氧化亚铁硫杆菌某些生理特征的比较研究被引量:2
- 2007年
- 嗜酸氧化亚铁硫杆菌(Acidithiobacillus ferrooxidans,简称A.f)是一种能够以亚铁、单质硫、以及硫化物作为能量来源的化能自养菌,因为此特性,其是生物湿法冶金中主要浸矿菌种之一.本试验中,通过从4个不同来源样品中分离到了4株A.f菌,然后通过改变影响其生长的因素来比较其氧化亚铁以及硫的活性.试验中使用了6种不同条件,其中每个条件下仅改变一个影响因子,这些影响因子包括温度、离子强度、pH、重金属离子浓度、外加离子浓度、硫培养、浸矿培养.通过比较结果,发现不同条件下,4株菌表现均不一样,而活力最强的菌株也不一样.例如,A.f.3菌株在以亚铁为能量来源的时候,一般是活性最强的菌株,而A.f.2一般是活性最差的菌株;但是在用硫和黄铁矿为能量来源的时候,A.f.2的活性不再是最差的,硫培养时,A.f.2是活性最强的菌株.通过比较,人们可以筛选得到一个高活性以及工业应用价值更高的菌株.
- 陈红陈新华
- 关键词:ACIDITHIOBACILLUS
- 氧化亚铁硫杆菌亚铁氧化系统的研究进展被引量:6
- 2009年
- 氧化亚铁硫杆菌(Acidithiobacillus ferrooxidans)为无机化能自养菌,革兰氏阴性,能在极端酸性环境中生长。由于在生物冶金中的应用及特殊的生理学效应,该菌受到研究者的广泛关注。A.ferrooxidans能氧化亚铁、元素硫及还原态硫化物获得电子,并通过一系列电子载体将电子传递给氧生成水,同时释放能量供生命活动需要。目前对A.ferrooxidans电子传递系统的研究主要集中于亚铁氧化电子传递系统,已发现多种与亚铁氧化电子传递相关电子载体和操纵子,如电子载体铜蓝蛋白(Rustocyanin,Rus)、细胞色素C(Cytochrome C,Cyc)、细胞色素C氧化酶(Cytochrome Coxidase,Cox)、亚铁氧化酶(Iro)、细胞色素bc1复合物(cytochrome bc1 complex,bc1)等,以及rus操纵子和pet操纵子。综述了近年来有关A.ferrooxidans亚铁氧化电子传递链相关蛋白载体,rus和pet操纵子结构与功能及表达调控等方面的研究进展。
- 欧阳建平陈新华
- 关键词:氧化亚铁硫杆菌电子传递链