王彦青
- 作品数：7 被引量：78H指数：3
- 供职机构：中国科学院北京基因组研究所更多>>
- 发文基金：中国科学院战略性先导科技专项国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学自动化与计算机技术医药卫生更多>>
- GSA:组学原始数据归档库被引量：10
- 2018年
- 生命科学的发展已进入组学大数据时代,然而我国至今尚未形成公共数据库存储体系。为弥补国内空白,组学原始数据归档库(Genome Sequence Archive, GSA, http://bigd.big.ac.cn/gsa)系统遵循国际核苷酸序列数据联盟(International Nucleotide Sequence Database Collaboration,INSDC)相关数据库建设标准,广泛收集各类生命组学原始数据。自2015年底上线运行以来,已获得了包括Cell、Nature、PNAS、GPB等30余个国内外期刊的认可,收录的数据量呈显著增长趋势,提供的数据服务受到国内外广大科研人员的认可。GSA有效缓解了当前我国生命组学数据汇交、存储与共享困难的问题,为我国国家生物信息中心的建设奠定了坚实基础。本文对目前GSA数据汇交、审核、发布与管理等机制进行了深入阐述,以方便用户了解GSA的各项功能,提供更高效的数据服务。
- 张思思陈婷婷朱军伟周晴陈旭王彦青赵文明
- 关键词：数据汇交数据共享
- GSA-Human:人类遗传资源数据管理的公共系统被引量：9
- 2021年
- GSA-Human是人类遗传资源数据汇交、存储、管理与共享的数据库系统,可提供人类遗传资源数据的上传、下载、浏览、检索等公共服务,并有效支撑了国家重点研发计划科技项目数据的汇交与管理工作。系统具有符合《中华人民共和国人类遗传资源管理条例》数据安全管理策略,提供公开访问和受控访问相结合的数据使用模式。公开访问数据允许用户自由下载与获取;受控访问数据采用申请-审核的模式,即需要通过数据管理委员会(Data Access Committee,DAC)的授权方可获得下载和使用权限。系统自上线以来,截至2021年7月,汇集数据总量已超5.27 PB。
- 张思思张思思陈婷婷陈旭唐碧霞陈婷婷董丽莉朱军伟孙艳玲唐碧霞翟爽孙玉彬陈焕新杜政霖肖景发章张鲍一明王彦青陈焕新
- 关键词：数据汇交数据共享
- 2019新型冠状病毒信息库被引量：60
- 2020年
- 2019年12月在中国武汉开始爆发的新型肺炎已造成全球25个国家/地区的31516人感染、638人死亡(截止2020年2月7日16时),引起该肺炎的病毒被世界卫生组织命名为2019新型冠状病毒(2019-nCoV)。为促进2019-nCoV数据共享应用并及时向全球公众提供病毒的相关信息,国家生物信息中心(CNCB)/国家基因组科学数据中心(NGDC)建立了2019新型冠状病毒信息库(2019nCoVR,https://bigd.big.ac.cn/ncov)。该信息库整合了来自德国全球流感病毒数据库、美国国家生物技术信息中心、深圳(国家)基因库、国家微生物科学数据中心及CNCB/NGDC等机构公开发布的2019-nCoV核苷酸和蛋白质序列数据、元信息、学术文献、新闻动态、科普文章等信息,开展了不同冠状病毒株的基因组序列变异分析并提供可视化展示。同时,2019nCoVR无缝对接CNCB/NGDC的相关数据库,提供新测序病毒株系的基因组原始测序数据、组装后序列的在线汇交、管理与共享、国际数据库同步发布等数据服务。本文对2019nCoVR数据汇交、管理、发布及使用等进行全面阐述,以方便用户了解该信息库各项功能及数据状况,为加速开展病毒的分类溯源、变异演化、快速检测、药物研发以及新型肺炎的精准预防与治疗等研究提供重要基础。
- 赵文明宋述慧宋述慧陈梅丽马利娜马利娜李茹姣李茹姣郝丽丽田东梅田东梅唐碧霞王彦青朱军伟陈焕新章张鲍一明
- 面向生物组学大数据计算的云平台系统及方法
- 本发明公开了一种面向生物组学大数据计算的云平台系统及方法，涉及用于维护或管理的装置技术领域。所述系统包括系统管理模块、数据管理模块、应用程序管理模块、流程管理模块、任务管理模块、数据可视化操作模块以及用户与权限管理模块。...
- 唐碧霞赵文明朱军伟王彦青
- 文献传递
- 系统生物学中多组学综合数据库的设计与实现
- 系统生物学中多组学综合数据库以建立综合型组学数据库为目标，目前集成了水稻、家鸡、家蚕、流感病毒以及人的dbSNP数据供用户访问。本文结合系统生物学中多组学综合数据库系统的建设过程，详细描述了系统架构设计以及数据库结构设计...
- 唐碧霞王彦青陈旭庞博赵文明
- 关键词：系统生物学系统设计功能模块
- 文献传递
- 面向生物组学大数据计算的云平台系统及方法
- 本发明公开了一种面向生物组学大数据计算的云平台系统及方法，涉及用于维护或管理的装置技术领域。所述系统包括系统管理模块、数据管理模块、应用程序管理模块、流程管理模块、任务管理模块、数据可视化操作模块以及用户与权限管理模块。...
- 唐碧霞赵文明朱军伟王彦青
- 基因组可视化工具GBrowse及其应用
- 基因组可视化工具是生物学领域一个比较重要的数据辅助分析工具，到目前为止，己有许多满足各种不同需求的可视化工具被开发出来并被使用。本文介绍了GBrowse的功能、特点，并结合实际给出了GBrowse在水稻基因组浏览器中的简...
- 唐碧霞王彦青陈旭庞博赵文明
- 关键词：基因组可视化工具用户体验
- 文献传递
