张璐
- 作品数：1 被引量：0H指数：0
- 供职机构：同济大学生命科学与技术学院生物信息学系更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生更多>>
- 流感疫苗应答过程中抗体谱发育的生物信息学分析
- 2017年
- 目的 分析流感疫苗应答过程中抗体谱的发育成熟特征,为后续抗体研发提供理论依据.方法 基于三价灭活流感疫苗（trivalent influenza vaccine,TIV）刺激后的时序性抗体重链测序数据,从抗体突变程度、互补决定区3（complementary-determining region 3,CDR3）氨基酸特征、VDJ基因使用方面分析疫苗应答过程中抗体谱的发育成熟特征.结果 疫苗刺激后抗体的突变频率显著提高.CDR3的特征分析显示,带电荷氨基酸和芳香族氨基酸的使用频率较高;原始B细胞（naive B cell）中CDR3长度服从正态分布,而疫苗刺激后,15~18个氨基酸长度的CDR3序列形成主导地位.另外,免疫前后VDJ基因的使用发生明显变化,带有抗体重链胚系基因IGHV3-7的抗体序列对疫苗具有显著应答;免疫后第7天应答最为强烈,随着时间的增加应答强度逐渐减弱.结论 疫苗刺激下,抗体谱动态进化以产生特异性应答的抗体,从序列层面分析应答特征有助于衡量免疫应答的有效性.
- 张璐张清晨裘天颐曹志伟唐凯临
- 关键词：疫苗抗体谱B细胞CDR3REGION
