郭玉燕 作品数:3 被引量:16 H指数:2 供职机构: 南方医科大学公共卫生学院病原生物学系 更多>> 发文基金: 广东省科技计划工业攻关项目 广东省自然科学基金 国家自然科学基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 更多>>
我国部分地区28种蚊虫的线粒体COⅠ基因序列分析 被引量:8 2017年 目的分析我国部分地区28种蚊虫的线粒体细胞色素c氧化酶亚基Ⅰ(mitochondrion cytochrome c oxidase subunitⅠ,COⅠ)基因序列,探讨其作为蚊虫分子标记的应用潜力。方法 2015年3月至2016年10月在我国海南、广东、广西、云南、福建、浙江、河南、山西、天津、内蒙古、吉林和黑龙江等12省(自治区、直辖市)的蚊虫孳生地采集幼虫,室内饲养至羽化成蚊,在蚊虫栖息地和蚊虫监测点,采用灯诱法和人诱法采集成蚊。所有成蚊经形态学鉴定后,提取单只蚊虫基因组DNA,采用国际双翅目通用引物PCR扩增并克隆线粒体COⅠ基因5′端片段,并进行测序。所得COⅠ基因序列上传Gen Bank获取登录号。序列通过Clustal1.83和MEGA5.05软件进行多序列比对,用DNAMAN9.0软件分析同源性。采用Mega5.05软件进行序列特征分析、计算遗传距离。每种蚊虫随机选择1~4条线粒体COⅠ基因序列,采用邻接法(NJ)构建系统发育进化树。结果共采集3亚科6属28种301只蚊虫,分别为伊蚊属(Aedes)的白纹伊蚊(Ae.albopictus)等5种、按蚊属(Anopheles)的中华按蚊(An.sinensis)等6种(亚种)、库蚊属(Culex)的二带喙库蚊(Cx.bitaeniorhynchus)等14种(亚种)、阿蚊属(Armigeres)的骚扰阿蚊(Ar.subalbatus)、曼蚊属(Mansonia)的常型曼蚊(Ma.uniformis)和巨蚊属(Toxorhynchites)的华丽巨蚊(Tx.splendens)。PCR扩增结果显示,28种蚊虫线粒体COⅠ基因的长度约711 bp,经多序列比对排齐后长度为651 bp。不同种别蚊虫的线粒体COⅠ序列同源性范围为97.85%~99.97%。种内K2P遗传距离为0.15%~2.89%,属内种间遗传距离为0.25%~14.50%。其中,按蚊属6种蚊虫COⅠ序列存在153个变异位点,131个简约信息位点,T+A平均含量为67.70%;编码的217个氨基酸残基中保守氨基酸206个(占94.9%);6种蚊虫的核苷酸同源性为98.31%~99.72%,种内K2P遗传距离为0.41%~1.56%,种间K2P遗传距离为1.07%~14.50%。28种蚊虫(60条)COⅠ序列的系统发育树分 郭玉燕 罗雷 宋璋瑶 郑学礼关键词:蚊虫 分子标记 基于COⅠ基因的我国部分地区蚊种鉴别与白纹伊蚊种群遗传分析 蚊虫在分类上隶属于昆虫纲(Class Insect Linnaeus),双翅目(Diptera),蚊科(Culicidae),分为3个亚科,即按蚊亚科(Anophelinae)、库蚊亚科(Culicinae)和巨蚊亚科(... 郭玉燕关键词:蚊虫 白纹伊蚊 DNA条形码技术在蚊虫分类鉴定中的研究进展 被引量:8 2017年 DNA条形码在物种分类鉴定中具有快速、准确的特点。近年来,基于线粒体细胞色素c氧化酶亚基Ⅰ(cytochrome c oxidase subunitⅠ,COⅠ)基因的DNA条形码技术已成功应用于蚊虫物种水平的鉴定。本文主要对DNA条形码技术及原理,基于COⅠ基因的DNA条形码技术对蚊虫种和种团鉴定的应用及其局限性,以及基于COⅡ、16S RNA、核糖体DNA内转录间隔区(ribosome DNA internal transcribed spacer,r DNA-ITS)中的第一内转录间隔区(the first internal transcribed spacer,ITS1)和第二内转录间隔区(the second internal transcribed spacer,ITS2)等其他分子标记在蚊虫分类鉴定中的应用及其辅助COⅠ基因对蚊虫进行分类鉴定的研究进展进行综述。 郭玉燕 罗雷 郑学礼关键词:DNA条形码 蚊虫 分子标记