田雨顺
- 作品数:16 被引量:6H指数:2
- 供职机构:中国科学院南海海洋研究所更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金中国科学院知识创新工程中国科学院战略性先导科技专项更多>>
- 相关领域:农业科学生物学自动化与计算机技术更多>>
- 一种长棘海星亲本长途运输装置及运输方法
- 本发明公开了一种长棘海星亲本长途运输装置,包括运输箱及配套的多个运输框,所述运输箱包括箱体和箱盖,所述箱体通过隔板分割成多个纵向分布相互独立的海星筒、以及位于各海星筒之间的降温池,在各海星筒及降温池的底部均设有排水孔,在...
- 罗鹏于宗赫田雨顺云龙胡超群
- 文献传递
- 噬菌体基因组DNA快速提取方法
- 2017年
- 针对传统噬菌体基因组DNA的提取方法缺乏广泛适用性,并且提取中用到酚/氯仿抽提,操作步骤繁琐,会对操作人员身体造成一定程度的损伤等不足,笔者建立了1种噬菌体基因组DNA快速提取方法。其提取的主要步骤包括宿主核酸降解、噬菌体粒子沉淀、噬菌体DNA释放、杂质去除、DNA吸附、DNA清洗和DNA洗脱等。结果表明,通过此法能快速提取以溶藻弧菌、大肠杆菌和阴沟肠杆菌为宿主菌的多种噬菌体基因组DNA,最快可以在2 h内完成,而且提取的产量和纯度均较高,DNA浓度超过100 ng·μL^(-1),OD_(260/280)达到1.8以上,提取产物不受宿主菌基因组DNA污染,可用于下游的实验分析。
- 刘秋婷田雨顺云龙罗鹏罗鹏
- 关键词:快速提取方法
- 一种凡纳滨对虾L型凝集素及其编码基因和应用
- 本发明公开了一种凡纳滨对虾L型凝集素及其编码基因和应用。本发明首次从凡纳滨对虾鳃组织中克隆出凡纳滨对虾L型凝集素基因lecV,其核苷酸序列如SEQ ID NO.1的第18‑1007位碱基所示。凡纳滨对虾L型凝集素LecV...
- 罗鹏田雨顺陈廷黄文胡超群霍达
- 一种凡纳滨对虾纤维蛋白原LvFREP及其编码基因和应用
- 本发明公开了一种凡纳滨对虾纤维蛋白原LvFREP及其编码基因和应用。所述的凡纳滨对虾纤维蛋白原基因LvfreP的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示,其编码蛋白LvFREP的氨基酸序列如SEQ ID NO.3所示。本发...
- 罗鹏田雨顺陈廷黄文胡超群霍达云龙
- 文献传递
- 溶藻弧菌噬菌体VP670基因组及内溶素/穿孔素基因功能研究
- 溶藻弧菌是多种海水养殖动物的病原菌,本研究从养殖环境中分离出一株致病溶藻弧菌的烈性噬菌体VP670,对VP670进行了全基因组测序,结果表明,VP670全基因组长43121bp,编码49个基因。基因组成为典型的四个模块:...
- 罗鹏刘秋婷田雨顺胡超群
- 关键词:溶藻弧菌噬菌体穿孔素
- 文献传递
- 细菌噬菌体基因组DNA提取试剂盒及方法
- 本发明提供了一种细菌噬菌体基因组DNA提取试剂盒及方法。试剂盒试剂包括:试剂A(氯仿)、试剂B(DNase?I)、试剂C(RNase?A)、试剂D(沉淀缓冲液)、试剂E(裂解缓冲液)、试剂F(主裂解主液)、试剂G(副裂解...
- 罗鹏刘秋婷何香燕胡超群田雨顺
- 文献传递
- 创伤弧菌TF3全基因组包含的CRISPR-Cas系统及MGIVvuTF3基因岛分析被引量:1
- 2018年
- 【目的】分析创伤弧菌(Vibrio vulnificus)全基因组框架序列,挖掘感兴趣的遗传位点,探索其是否具有CRISPR系统及其特征。【方法】在病虾体内分离获得了一株创伤弧菌TF3,通过Illumina Miseq测序得到基因组框架序列。经注释分析发现其基因组中存在一个CRISPR-Cas系统,命名为CRISPR-CasTF3,进一步分析发现CRISPR-CasTF3位于一个基因岛上,将该基因岛命名为MGIVvu TF3。对CRISPR-CasTF3及MGIVvu TF3的特征和来源进行了分析。【结果】CRISPR-CasTF3属于与大肠杆菌类似的Ι-E型CRISPR-Cas系统,CRISPR-CasTF3包括8个cas基因,其排列为cas3-cas8e-cse2-cas6-cas7-cas5-cas1-cas2;具有50个重复序列,每二个重复序列间为一个Spacer序列。MGIVvu TF3具有att L和att R序列,含有位点特异性整合、剪切、转移相关的基因。MGIVvu TF3与霍乱弧菌O395基因组中的一个基因岛MGIVch0395具较高相似性,二者最显著的差别在于Spacer序列完全不同,以及各有几个非保守的预测基因。【结论】MGIVvu TF3及CRISPR-CasTF3极有可能通过基因水平转移获得,并且CRISPR-CasTF3系统可以借助MGIVvu TF3实现水平转移。
- 云龙罗鹏田雨顺丁雄祺胡超群
- 关键词:CRISPR创伤弧菌
- 一种侧拉拱桥式对虾养殖大棚
- 本发明公开了一种侧拉拱桥式对虾养殖大棚,建于土塘或高位池上方,包括拱桥、门支柱、拱支柱、钢索柱、钢索、塑料膜、胶绳。拱桥由两条拱梁及一系列侧梁组成,拱梁的下方焊接有副梁,拱梁的两端下方分别焊接两条门支柱、拱支柱,钢索柱成...
- 罗鹏田雨顺云龙胡超群黄文
- 一种凡纳滨对虾L型凝集素及其编码基因和应用
- 本发明公开了一种凡纳滨对虾L型凝集素及其编码基因和应用。本发明首次从凡纳滨对虾鳃组织中克隆出凡纳滨对虾L型凝集素基因lecV,其核苷酸序列如SEQ ID NO.1的第18‑1007位碱基所示。凡纳滨对虾L型凝集素LecV...
- 罗鹏田雨顺陈廷黄文胡超群霍达
- 文献传递
- 细菌重组系统及其应用研究进展被引量:2
- 2017年
- 利用重组酶和辅助蛋白共同作用于DNA片段上,使不同基因重新组合以完成基因重组的现象在细菌中广泛存在,基因重组对于细菌的遗传多样性、进化等具有重要意义。目前,细菌基因重组主要分为同源重组、位点特异性重组和转座重组3种类型。本文主要对细菌重组系统重组酶的种类、作用机制及其在细菌遗传操作中的应用策略进行阐述。
- 田雨顺罗鹏刘秋婷胡超群
- 关键词:细菌重组酶