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李云辉
作品数:
1
被引量:1
H指数:1
供职机构:
上海海事大学信息工程学院
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发文基金:
国家自然科学基金
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相关领域:
生物学
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合作作者
邓伟
上海海事大学文理学院数学系
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邓伟
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李云辉
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数学的实践与...
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2016
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基于Hash建立索引和Kmp快速匹配算法的DNA序列查找方法
被引量:1
2016年
研究了DNA序列片段的查找问题,针对DNA数据量大和DNA序列碱基排列的特点提出了DNA序列检索的问题.在对DNA序列检索中,基于Hash建立了索引表以提高在大数据中检索的速度和效率,同时在平衡树的数据存储模型上使用了改进的Kmp快速匹配算法,提高了在索引上的检索效率.介绍了Hash索引的建立、Kmp的优化以及平衡树的再平衡.利用软件评估实验得出的实验结果表明了该算法的有效性.
李云辉
邓伟
关键词:
平衡树
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