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人类免疫缺陷病毒-1 CRF01_AE毒株在我国的分子传播网络分析被引量：7: 2016年; 目的构建我国HIV-1 CRF01_AE毒株分子传播网络，并分析网络特征。方法从洛斯阿拉莫斯国家实验室HIV基因数据库（Los Alamos database）下载中国地区的CRF01_AE pol区基因序列并进行人口学信息核对。通过构建系统进化树、提取传播簇、最小基因距离选择及传播网络可视化4个步骤构建传播网络。运用卡方检验分析不同人群参与网络形成的比例和网络中度的分布。描述性分析不同人群和不同地区之间的传播关联。结果2 419条序列共形成250个大小介于2～25的传播网络，包括847个节点和610条边。度≥2的个体虽然只占网络中个体总数的26.4%（224/847），但与66.5%（563/847）的个体存在关联。男男同性性行为者（MSM）、男性异性性行为者、静脉药瘾者（IDUs）及女性异性性行为者参与网络形成的比例分别为37.6%（669/1 781）、28.4%（102/359）、16.1%（10/62）和30.4%（66/217），差异有统计学意义（χ^2＝23.774，P〈0.001）。MSM人群中度≥2的比例（10.8%，193/1 781）显著高于男性异性性行为者（5.6%，20/359）和女性异性性行为者（4.6%，10/217）（P值分别为0.002和0.004）。网络中绝大多数（95.5%，639/669）MSM与其他MSM之间存在传播关联，仅有2.4%（16/669）的个体与女性异性性行为者之间存在传播关联，但有15.1%（10/66）的女性异性性行为者与MSM之间存在传播关联。男性异性性行为者与女性异性性行为者之间存在传播关联的比例为35.3%（36/102），与MSM之间具有传播关联的比例为9.8%（10/102）。网络中20.9%（177/847）的个体与其他省份之间存在传播关联。结论较少比例的超级传播者在CRF01_AE毒株的分子传播网络形成中起到了核心作用，不同人群和不同地区之间的毒株进行着活跃的传播。; 李小杉钟平李伟杜国平方坤宋玥朱可心郭艳高蓉颜文娟宣杨卫平民; 关键词：分子流行病学传播网络系统进化分析

人类免疫缺陷病毒-1CRF01_AE毒株在我国的分子流行特征分析被引量：7: 2015年; 目的了解HIV-1CRF01_AE毒株在我国的分子流行特征。方法计算机检索相关数据库并结合文献追溯的方法提取数据，按地区和研究人群分组进行Meta分析，计算HIV-1CRF01_AE感染者占不同高危人群的比例。从美国洛斯阿拉莫斯国家实验室HIV基因数据库（LosAlamosdatabase）中下载中国地区的CRF01_AEpol区基因序列，利用FastTree2．1构建系统进化树进行成簇分析。根据BEASTV1．6．2和Spread计算贝叶斯因子分析空间地理传播关联。结果HIV-1CRF01_AE毒株在我国6个地区的MSM人群中所占比例均〉45．0％；在东部、北部、西南和中南地区的异性性行为人群中所占比例均〉30．0％；在中南地区的静脉药瘾人群中所占比例最高，为57．3％（95％CI：35．1％～79．6％）；而输血传播人群仅在中南地区占有较低的比例，为10．6％（95％CI：6．2％～14．9％）。系统进化分析表明，该毒株在我国形成7个独立的传播簇，其中簇1、3、5主要流行于异性性行为感染人群中，簇2及簇6主要流行于MSM人群中，簇4主要流行于性行为感染人群中。簇1～5均在西南地区流行，中南地区主要流行簇7和簇1，北部地区主要流行簇2和簇6，东部地区主要流行簇2和簇4，东北地区主要流行簇6。贝叶斯因子分析结果显示，该毒株在我国东部、中南部、西南部、北部及东北部的省份之间传播关系错综复杂。结论CRF01_AE毒株活跃在我国各个地区的多个高危人群中，不同地区之间的传播关联错综复杂。; 朱可心庄勋周元高蓉卫平民钟平陈颖李春建李小杉; 关键词：META分析系统进化分析贝叶斯定理

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朱可心

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