潘少坤 作品数:9 被引量:1 H指数:1 供职机构: 复旦大学 更多>> 发文基金: 国家重点基础研究发展计划 更多>> 相关领域: 医药卫生 生物学 更多>>
内源性虎皮鹦鹉嗜肝DNA病毒“化石”的发现及其性质的初步研究 内源性病毒片段是古代病毒感染宿主后遗留在宿主基因组并随之稳定遗传的古代病毒基因组片段。考古病毒学的主要目的是研究古代存活、现在灭绝的病毒对现存宿主基因组的影响。目前在哺乳动物中尚未发现内源性嗜肝DNA病毒片段,但在斑胸草... 潘少坤关键词:虎皮鹦鹉 嗜肝DNA病毒 一种评价人乙型肝炎病毒X蛋白结合分子的方法 本发明属于生物技术及基因工程领域,涉及一种评价人乙型肝炎病毒X蛋白(HBx蛋白)结合分子的方法。本发明方法包括在细胞内表达分泌型的包含HBx蛋白和荧光素酶NanoLuciferase(Nluc)两者的融合蛋白,通过检测分... 谢幼华 谷陈建 刘晶 陶帅 潘少坤乙型肝炎病毒Ⅹ蛋白的优势氨基酸序列与热点突变位点的生物信息学分析 被引量:1 2016年 乙型肝炎病毒X蛋白(hepatitis B virus X protein,HBx)全长154个氨基酸,与肝癌发生密切相关.为确定HBx的优势氨基酸序列和热点突变位点,在GenBank中下载所有HBx的氨基酸序列13950条,剔除插入突变、缺失突变和起始密码子非甲硫氨酸的序列,最后保留7126条.通过分析这7126条序列,计算出HBx每个位点的氨基酸分布情况,出现频率最高的氨基酸为该位点的优势氨基酸,其他氨基酸为突变氨基酸.154个位点的优势氨基酸组成HBx优势氨基酸序列.突变率〉10.0%的热点突变位点有32个.其中第36、42、44、87、88和127位氨基酸有4种(突变率〉1.0%)以上突变形式,具有较高的多态性.与肝癌密切相关的K130M/V131I双突变率为34.7%.通过7126条HBx序列与优势序列的同源性比较,随机选出其中50条序列(2条与优势序列同源性〈75%,48条同源性为76%~99%),与23条参考序列及优势序列共同构建系统发生树.结果显示,HBx优势氨基酸序列属于基因型C,这与基因型C为全球主要流行型一致.本研究首次系统性分析了GenBank中HBx的优势序列,确定了32个HBx热点突变位点和6个多态性较高的位点,为基于HBx突变的基础和应用研究奠定了基础. 王葳 何永刚 浦永兰 潘少坤 谢幼华关键词:乙型肝炎病毒X蛋白 热点突变 原海葱苷A在制备治疗肝细胞肝癌药物中的用途 本发明属生物医药技术领域,涉及原海葱苷A新的制药用途,具体涉及原海葱苷A(Proscillaridin A)(CAS 466‑06‑8)在制备治疗肝癌尤其是肝细胞肝癌(HCC)药物中的用途。本发明经实验显示,原海葱苷A能... 谢幼华 罗萌君 刘晶 刘艳丰 潘少坤文献传递 乙型肝炎病毒(HBV)慢性化小鼠模型的建立方法及用途 本发明属生物医药和基因工程领域,涉及一种乙型肝炎病毒(HBV)慢性化小鼠模型的建立方法与建立该模型所使用的HBV毒株。所述HBV毒株为临床分离株(GenBank No.AF100309.1),其1.3拷贝基因组(核苷酸,... 谢幼华 刘晶 沈忠良 杨慧娟 潘少坤文献传递 一种评价人乙型肝炎病毒X蛋白结合分子的方法 本发明属于生物技术及基因工程领域,涉及一种评价人乙型肝炎病毒X蛋白(HBx蛋白)结合分子的方法。本发明方法包括在细胞内表达分泌型的包含HBx蛋白和荧光素酶NanoLuciferase(Nluc)两者的融合蛋白,通过检测分... 谢幼华 谷陈建 刘晶 陶帅 潘少坤文献传递 乙型肝炎病毒小表面抗原各拓扑区段对其表达和分泌的影响 2016年 乙型肝炎病毒小表面抗原(small hepatitis B virus surface antigen,SHB)在细胞内质网上表达,沿着细胞分泌途径分泌到胞外。为系统分析SHB拓扑结构对SHB表达和分泌的影响,首先通过生物信息学预测临床病毒株HBV C8和8种基因型(A^H)代表株的SHB拓扑结构,发现这些SHB均为四次跨膜蛋白,拥有基本相同的拓扑结构。相对内质网膜而言,SHB的拓扑结构拥有3个内质网腔内区段(Inside1~Inside3)、4个跨膜螺旋区(Tmhelix1~Tmhelix4)和2个内质网膜外区段(Outside1和Outside2)。6种基因型(基因型A、B、C、D、E和G)代表株与病毒株C8的SHB拓扑结构预测结果完全相同,而基因型F和H的SHB有4个区段与C8等不完全一致。通过对C8的SHB拓扑结构各区段进行缺失突变研究,发现Inside1区段不是SHB表达和分泌所必需的;Outside1、Tmhelix2和Inside2区段是SHB表达和分泌所必需的;Tmhelix1和Outside2不是SHB表达所必需的,但为SHB分泌所必需;Tmhelix3和Tmhelix4对SHB表达有重要影响,也是SHB分泌所必需的。进一步对Outside1和Outside2进行小片段(6个氨基酸)的缺失突变研究,发现小片段缺失基本不显著影响SHB的表达,但Outside1的氨基酸55~78及Outside2是SHB分泌所必需的。本研究首次系统性分析了SHB的拓扑结构各区段对SHB表达和分泌的影响,为深入探索SHB结构与功能的关系提供了线索。 沈忠良 饶玉良 王葳 马张妹 刘晶 潘少坤 谢幼华关键词:缺失突变 分泌 喷他嘧啶羟乙基磺酸盐在制备肝癌药物方面的应用 本发明涉及一种喷他嘧啶羟乙基磺酸盐在制备治疗肝癌的药物方面的应用。本发明的发明人偶然发现了喷他嘧啶羟乙基磺酸盐对肝癌细胞具有明显的增殖抑制作用,促进了肝癌细胞凋亡的发生;并由此开发了喷他嘧啶羟乙基磺酸盐在治疗肝癌方面的新... 谢幼华 罗萌君 刘艳丰 刘晶 潘少坤文献传递 识别人乙型肝炎病毒X蛋白的单克隆抗体及用途 本发明涉及生物医药和基因工程领域,公开了一种针对乙型肝炎病毒(HBV)X蛋白(HBx)的单克隆抗体(命名为KY02)及其轻链可变区和重链可变区氨基酸序列,本发明还公开了制备HBx单克隆抗体KY02的方法和可生产KY02抗... 谢幼华 刘晶 潘少坤 陶帅 谷陈建 魏丽丽文献传递