金红 作品数:17 被引量:64 H指数:5 供职机构: 复旦大学化学系 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家教育部博士点基金 国家高技术研究发展计划 更多>> 相关领域: 医药卫生 生物学 文化科学 理学 更多>>
小鼠晶体蛋白质组的双向电泳和质谱鉴定研究 被引量:1 2008年 目的应用双向电泳和质谱技术研究5周龄小鼠晶体蛋白质组。方法提取小鼠晶体总蛋白,进行固相pH梯度(IPG)等电聚焦双向电泳,胶体考马斯亮蓝R-250染色,使用PDQuest7.30图像分析软件分析电泳图像。选择主要蛋白点胶上酶解,应用基质辅助激光解析电离飞行时间/飞行时间(MALDI—TOF/TOF)仪器进行串联质谱(MS/MS)鉴定。结果上样量为882μg和190μg时,分别检测370±41蛋白点(n=3)和57±5个蛋白点(n=3)。高上样量能够较好地分离晶体低丰度蛋白,如念珠状纤维结构蛋白BFSP;低上样量可很好地分离高丰度蛋白-晶体蛋白(包括αA、αB;βA1~βA4;βB1~βB3;γA~γF和γS等)。质谱鉴定得到1种细胞骨架蛋白和16种高丰度晶体蛋白。结论双向电泳和质谱技术有效考察了晶体总蛋白质,为分析白内障形成过程中蛋白质的表达改变提供了新的方法和途径。 季樱红 卢奕 李娜 金红 杨芃原关键词:蛋白质组 双向凝胶电泳 质谱 胰腺癌组织中差异表达蛋白的筛选与鉴定 被引量:5 2007年 目的:筛选并鉴定胰腺癌组织中的差异表达蛋白,并探讨其临床意义。方法:应用双向凝胶电泳技术对12对胰腺癌组织和癌旁组织样品进行分析,筛选出差异表达蛋白质;应用MALDI-TOF-MS/MS技术对差异表达蛋白质进行鉴定。结果:优化的胰腺组织双向凝胶电泳技术具有良好的分辨率和可重复性;应用双向凝胶电泳技术筛选出胰腺癌组织中30个差异表达蛋白质;应用MALDI-TOF-MS/MS技术鉴定了胰石蛋白、钙囊素、热休克蛋白B6等24个蛋白质,其中15个蛋白质在胰腺癌组织中表达上调,9个蛋白质表达下调。结论:双向凝胶电泳、生物质谱等蛋白质组学技术在胰腺癌的基础研究中有重要价值和应用前景,有助于筛选蛋白标志物和阐明分子发病机制。胰腺癌组织中有多个异常表达蛋白质,这些蛋白质与胰腺癌的发生相关,可能成为胰腺癌蛋白标志物和药物治疗的靶蛋白。 狄扬 陈耀辉 龙江 金红 金忱 虞先浚 傅德良 倪泉兴关键词:胰腺肿瘤 蛋白质类 血清蛋白质组分析技术筛选肝癌自发抗体 被引量:17 2005年 目的采用血清蛋白质组分析技术(SERPA)筛选、鉴定肝癌自发抗体。方法双向电泳分离肝癌细胞系HCCLM3的总蛋白后将其转膜,肝癌、肝炎和正常组血清各8份与膜免疫印迹,图像分析确定不同血清免疫印迹图谱间的差异点及其与双向电泳图谱的对应关系,最后用基质辅助激光解吸飞行时间质谱进行鉴定。结果建立了高重复性HCCLM3的双向电泳图谱及其肝癌、肝炎及正常组血清的免疫印迹图谱,图谱均点数分别为603、70.75±24.25、68.50±23.44和41.38±15.05,肝癌、肝炎组图谱点数明显多于正常组,但肝癌与肝炎组差异无统计学意义。质谱鉴定确定了核蛋白、细胞骨架、代谢酶及热休克蛋白等五类肝癌自发抗体。结论SERPA是一种高通量筛选、鉴定肿瘤自发抗体的新技术,大量肝癌自发抗体的发现为肝癌进一步的免疫诊断及治疗奠定了基础。 冯钜涛 刘银坤 代智 周海军 宋海燕 钦伦秀 金红 陆豪杰 汤钊猷关键词:肝细胞 自身抗体 蛋白质组 肝癌细胞系 蛋白质组分析 高通量筛选 抗体 生物质谱技术在生命科学研究中的应用 被引量:2 2016年 叙述生物质谱的原理及其在生命科学各领域中的应用。阐述了生物质谱在组蛋白翻译后修饰定量研究中的应用及其在表观遗传及精准医学研究中发挥的重要作用。 高兴 胡亚君 陈佳佳 金红关键词:生物质谱 生命科学 表观遗传 蛋白质组学 扶正化瘀方干预肝硬化大鼠血浆蛋白质组的初步研究 被引量:6 2007年 目的利用蛋白质组技术比较 CCl_4诱导肝硬化大鼠血浆蛋白质变化并研究扶正化瘀方对肝硬化大鼠血浆蛋白质的影响。方法将雄性 SD 大鼠随机分为3组,分别给予 CCl_1(CCl_4/橄榄油:1体积比=1:1)腹腔注射、CCl_4腹腔注射+扶正化瘀方灌胃、橄榄油腹腔注射,8周后通过Masson 三色染色法用图像分析仪自动分析肝脏胶原面积。应用双向凝胶电泳技术经银染显色和PDQuest7.3软件分析凝胶图像,对在三组中表达均有差异的蛋白质点用基质辅助激光解吸电离飞行时间串连质谱进行鉴定。结果扶正化瘀方干预组肝纤维化程度明显轻于模型组,胶原纤维面积在肝内沉积少(8.9%±3.7%vs 12.4%±4.7%,P<0.05)。实验去除血浆中的高丰度蛋白质可获得重复性较好的血浆蛋白质图谱。实验共鉴定出10个明显差异表达的蛋白质。在这些蛋白质中,血浆谷胱甘肽过氧化物酶及其前体、前白蛋白、结合珠蛋白、载脂蛋白 A-IV 前体、补体4、α抑制剂重链4和微管相关调节激酶1在肝硬化大鼠血浆中表达减少,扶正化瘀方干预组表达增加,肝脏再生相关蛋白和波形纤维蛋白在肝硬化大鼠血浆中表达增加,扶正化瘀方干预组表达减少。结论 CCl_4诱导肝硬化大鼠血浆中与氧化应激、细胞增值和转化相关蛋白质表达明显改变。扶正化瘀方可通过促进蛋白质合成、抗氧化、调控细胞增值和转化等多方面发挥抗纤维化的作用。 刘杰 王吉耀 魏黎明 陆晔 金红关键词:肝硬化 蛋白质组 扶正化瘀方 复旦大学蛋白质组学研究中心技术平台的建设和管理 2010年 生物医学研究院的蛋白质组学研究中心的技术平台是一个创新的技术平台,对学校有关院系的科研工作是强有力的技术支撑,目前实行的共享政策、网上预约、培训上岗、库邦制度等,使仪器的共享率有很大的提高,使技术平台能更有活力为科研人员服务。 金红 周悠悠 陶蓓蕾 魏勋斌 杨芃原关键词:蛋白质组 创新管理 具核梭杆菌具核亚种蛋白质组及其在癌症pH环境下的差异蛋白质组分析 被引量:5 2015年 利用LC-MS/MS对F.nucleatum的蛋白质表达谱进行了深入研究,共鉴定到1198个蛋白质的表达,占基因组58%的编码基因.通过在p H 6.5(癌症组织p H环境)和p H 7.5(正常组织p H环境)两种条件下F.nucleatum蛋白质表达的定量蛋白质组学分析,发现处于癌症微环境p H条件下蛋白质表达的变化明显集中于金属离子转运,硫胺素代谢,糖代谢等过程和功能.产丁酸发酵的能量代谢通路中的七个代谢酶在蛋白质组数据中找到,其中有五个在癌症p H条件下显著下调,这五个酶包含了丁酸盐代谢的整个过程,这为结直肠癌患者肠道丁酸盐含量降低提供了新的证明.此外,癌症p H条件下F.nucleatum的丁酸代谢受到抑制,造成产丁酸能力下降,可能是其促进结直肠癌发展在代谢水平上的原因之一. 殷薛飞 刘晓慧 申华莉 申华莉 杨芃原关键词:具核梭杆菌 蛋白质组 乳腺良恶性钙化的血清比较蛋白质组学分析 被引量:1 2011年 目的 分析乳腺良恶性钙化患者血清蛋白质表达谱,比较不同性质钙化的血清蛋白质差异.方法 钙化型乳腺癌、良性钙化患者血清各10例,经双向凝胶电泳、基质辅助激光解析离子化-飞行时间质谱等对差异蛋白进行分析鉴定和验证.结果 良恶性钙化组比较发现钙化型乳腺癌组血清中特异性的蛋白质2种,上调的蛋白质8种,下调的蛋白质7种.钙化型乳腺癌组触珠蛋白表达高于良性钙化组.结论 乳腺的恶性钙化和良性钙化患者的血清中某些蛋白存在着差异表达,有可能作为鉴别乳腺钙化病变良恶性质的标志物分子. 王红 秦新裕 张宏伟 陈君雪 宋陆军 金红关键词:乳腺癌 钙化 蛋白质 人胰腺导管腺癌组织及癌旁组织双向电泳图谱的差异分析 被引量:3 2007年 目的探讨人胰腺导管腺癌组织和癌旁组织之间差异的表达蛋白。方法利用双向凝胶电泳(2-DE)对8例胰腺导管腺癌组织和癌旁组织的总蛋白进行分离,并用质谱仪对两组间差异蛋白质点进行肽指纹谱和串联质谱鉴定。利用蛋白质印迹分析和免疫组化法检测差异蛋白在胰腺癌和癌旁组织的表达。结果2-DE显示,肿瘤组织中有28个蛋白质点表达上调,17个表达下调。上述蛋白质点经质谱鉴定得到30个蛋白质,包括酶类、抗氧化蛋白、信号转导蛋白、钙结合蛋白、结构蛋白及分子伴侣等。Western blot和免疫组化结果显示差异表达蛋白annexin II在胰腺癌组织中表达上调,与2-DE结果一致。结论以2-DE为基础的蛋白质组学技术是研究肿瘤的一种重要手段。本实验所得的annexin II等差异表达蛋白可能成为潜在的诊断胰腺癌的分子标志或控制肿瘤生长的治疗靶点。 田锐 魏黎明 李延 秦仁义 杜志勇 夏维 金红关键词:腺癌 蛋白质组 双向电泳 14-3-3tau蛋白通过ERK信号通路调控BeWo细胞的侵袭功能 被引量:1 2010年 目的:探讨14-3-3tau蛋白对滋养细胞侵袭功能的影响及可能机制。方法:免疫组化法检测人早孕期绒毛、蜕膜以及人绒癌滋养细胞株BeWo中14-3-3tau的表达。RNA干扰方法下调BeWo细胞14-3-3tau的表达,RT-PCR和Western blotting方法检测E钙黏附素及转录因子snail的表达变化,Transwell小室方法检测侵袭细胞数目的变化。用U0126特异性阻断胞外信号调节蛋白激酶1/2(ERK1/2)信号通路,观察下调14-3-3tau对BeWo细胞侵袭能力的变化。结果:(1)14-3-3tau在早孕期绒毛外细胞滋养细胞和侵袭入蜕膜组织的游离型滋养细胞以及BeWo细胞中均有表达。(2)下调BeWo细胞14-3-3tau表达后,E钙黏附素表达下降,Snail表达增加,穿过Transwell小室的细胞数增加(P<0.05)。(3)U0126阻断14-3-3tau下调引起的BeWo细胞侵袭增加(P<0.05)。结论:14-3-3tau通过ERK1/2信号通路抑制滋养细胞的侵袭能力。 程琰 胡蓉 金红 马开东 李笑天关键词:滋养细胞 BEWO细胞 ERK1/2信号通路