李家丽
- 作品数：4 被引量：8H指数：2
- 供职机构：山东农业大学资源与环境学院土肥资源高效利用国家工程实验室更多>>
- 发文基金：山东省高等学校科技计划项目国家自然科学基金中国博士后科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 高羊茅EST-SSR标记开发及遗传多样性分析被引量：7
- 2016年
- 采用从其他作物转移与利用自身EST序列设计两种方法为高羊茅(Festuca arundinacea L.)开发EST-SSR分子标记,并利用所开发标记对高羊茅品种(系)进行遗传多样性分析。利用来自小麦、大麦、玉米、高粱和水稻的732对EST-SSR在高羊茅上进行通用性分析,得到406个有效的扩增引物对(55.46%)。利用高羊茅EST数据库(Gen Bank/db EST)中63 853条EST序列进行微卫星序列的查找,共发现包含微卫星的EST序列420条,占整个EST总数的0.658%。其中三核苷酸基序出现频率最高(43.33%),次之为二核苷酸基序(33.57%)。二核苷酸基序以CT/GA出现频率最高(16.90%),三核苷酸基序以CAG/GTC出现的频率最高(10.63%)。进一步运用Primer 5.0软件设计了108个引物对,并交上海桑尼公司合成。PCR检测表明,92个引物对(85.19%)在高羊茅中均可以扩增出稳定清晰的带型。从498对(其中5种作物的406对,高羊茅的92对)有效扩增的EST-SSR引物中随机选取81对引物,对12个高羊茅品种(系)进行扩增。79个引物对显示出多态性(97.53%)。共检测到133个等位变异,平均每对引物有1.68个等位变异;多态性信息含量(PIC)值最高为0.66,最低为0.14,平均为0.48。聚类分析结果表明,12份材料在相似系数为0.61处可分为5大类:第Ⅰ类为‘爆发力’和‘法思’;第Ⅱ类为‘强劲’、‘家园’和‘翠碧A’;第Ⅲ类为‘可其思3号’和‘凌志’;第Ⅳ类为‘雅典娜2号’、‘美洲虎3号’、‘火凤凰’和‘TF160’;‘球道’单独为第Ⅴ类。
- 李家丽高雪王秀华石香雪于鸿翔赵岩
- 关键词：高羊茅EST-SSR
- 不同浓度硫处理小麦RIL群体苗期性状的表型变异及相关分析
- 2016年
- 本试验以"川35050×山农483"组合衍生的小麦重组自交系(recombinant inbred lines,RIL)群体及其亲本为材料,采用水培法,对低、中、高浓度硫处理下小麦RIL群体的苗高、最大根长、分蘖数、根条数、根干重、苗干重、总干重、根冠比、根S积累量、苗S积累量、总S积累量、根S利用效率、苗S利用效率和总S利用效率共14个性状进行了测量,并进行了变异分析和相关分析。结果表明,在不同浓度硫处理下,苗期性状的变异都较大。随S浓度增加,根干重、根冠比、根S利用效率、苗S利用效率和总S利用效率5个性状均呈降低趋势,而其余9个性状均呈升高趋势,表明适当提高硫浓度可促进小麦生长,但硫利用效率降低。变异分析表明,在同一环境下双亲各性状的表型值大都表现出较大差异;在RIL群体中,家系间变异系数在不同硫处理下的平均值以S积累量(根S积累量、苗S积累量、总S积累量)的最大,以根条数、根冠比和苗高性状的最小。相关分析表明,干重和S积累量、S利用效率呈极显著正相关,说明可以用干重性状来表征S积累量及S利用效率。
- 李家丽蒲艳艳于鸿翔赵岩
- 关键词：小麦苗期
- 利用EST-SSR通用性和EST数据库筛选三叶草EST-SSR分子标记
- 2016年
- 为加速分子标记在三叶草中的应用,利用三叶草EST数据库（GenBank/dbEST）和EST-SSR的通用性,开展了三叶草EST-SSR分子标记筛选及利用研究。从五种作物和三叶草的EST数据中共筛选出445对EST-SSR引物,挑选107对引物用于5个三叶草品种的遗传多样性分析,其中表现多态性的引物为103对（96.3%）,检测到的等位变异为293个,每对引物的等位变异数目为1-6（平均2.8）,PIC值最高、最低、平均分别为0.79、0.28和0.55。聚类分析表明,在相似系数0.618水平可分为三大类,类Ⅰ由海发、瑞文德和碧盛组成,类Ⅱ为杂三叶,类Ⅲ为红三叶。
- 高雪王秀华石香雪李家丽赵岩
- 关键词：三叶草EST-SSR
- 黑麦草EST-SSR分子标记开发及生物信息学分析被引量：2
- 2016年
- 为加速分子标记在黑麦草中的应用,利用黑麦草EST数据库(Gen Bank/db EST)开展了黑麦草EST-SSR信息分析、标记开发和EST功能分析研究。在25 752条黑麦草EST序列中,共发现346条SSR序列,占整个EST总数的1.344%。其中,三核苷酸基序最多(39.60%),次之为二核苷酸基序(31.79%)。三核苷酸基序以GGC/CCG出现频率最高,为8.38%,其次是CGC/GCG(7.51%)、GCC/CGG(4.05%)和ATG/TAC(2.02%),二核苷酸基序以CT/GA出现频率最高(14.45%),其次是GA/CT(10.98%)。根据这些含有SSR的EST序列,利用Primer Premier 5.0软件,对346条EST-SSR序列进行引物设计,共设计引物193对,其中分值在90分以上的有113对(32.66%)。利用Gen Bank的Blast N和Blast X程序对相应113条EST进行功能分析,72条EST序列与51种具有生物学功能的蛋白质同源。
- 王秀华李家丽蒲艳艳丛晓翔林雪婷于鸿翔赵岩
- 关键词：黑麦草EST-SSR引物设计功能分析
