张玲
- 作品数：5 被引量：3H指数：1
- 供职机构：中国医学科学院北京协和医学院基础医学院基础医学研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金美国中华医学基金国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生更多>>
- 恶性疟原虫带7蛋白家族蛋白cDNA的克隆及表达产物特征分析被引量：2
- 2003年
- 目的 分离、克隆恶性疟原虫带7蛋白家族蛋白编码基因pfstom,并对其功能进行初步研究。方法 根据国际恶性疟研究公共数据库释放的已完成序列数据(CoDing Sequence,CDS数据)设计引物,用RT-PCR方法从恶性疟原虫中国海南株(FCCl/HN)中得到其带7蛋白家族蛋白基因cDNA-pfstom。应用多种软件对其结构功能、基因进化特征以及同源性分析。用pET30a系统表达其具有stomatin样蛋白结构域的C端蛋白,免疫新西兰大白兔并纯化抗体。Western杂交检测其在FCCl/HN表达情况。结果 pfstom基因编码区全长1125 bp,编码374个氨基酸,C端具有和人红细胞整合膜蛋白带7蛋白家族中stomatin样蛋白类似的结构。进化特征分析显示:在带7蛋白家族中,Pfstom蛋白与stomatin样蛋白亲缘关系较近。Western杂交发现Pfstom蛋白在FCCl/HN的滋养体期呈期特异性表达,在与膜相关和与膜不相关的感染红细胞蛋白提取物中都存在。结论Pfstom是带7蛋白家族蛋白,在FCCl/HN红内期的滋养体期呈特异性表达,环状体期不表达,该蛋白是膜相关蛋白。
- 张玲张连惠王海一王恒
- 关键词：恶性疟原核表达
- 鼠约氏疟原虫yoelii株Pydyn基因的内含子序列分析
- 2004年
- 本研究测定并分析鼠约氏疟原虫 (Plasmodiumyoeliiyoelii)动力素蛋白基因 (Pydyn) 3′端内含子序列 ,比较约氏疟原虫yoelii虫株的Pydyn基因与约氏疟原虫 17XNL虫株基因组序列内含子间序列的多态性。方法 :应用PCR技术扩增约氏疟原虫动力素蛋白基因 (Pydyn)基因组 3′端序列 ,将其克隆入pGEM TEasy载体。阳性克隆经酶切和PCR鉴定正确后测序 ,并用分子生物学WINSTAR软件进行基因结构和同源性分析。结果 :用PCR方法成功扩增出约 80 0bp的Pydyn基因特定片段 ,阳性克隆经酶切及PCR扩增确定。基因序列分析表明 ,约氏疟原虫yoelii虫株的Pydyn基因含有 3个内含子 ,并且与约氏疟原虫 17XNL虫株基因组序列在内含子间存在着几个变异。结论 :确定了鼠约氏疟原虫动力素蛋白基因 (Pydyn) 3′端内含子序列 ,其内含子具有序列短且AT含量较高的特点 ,两末端的碱基具有一般真核基因内含子共有的剪接位点。多态性分析表明 ,将约氏疟原虫yoelii虫株的Pydyn基因的 3个内含子与人恶性疟原虫动力素基因Pfdyn内含子保守序列相比 ,Pydyn基因内含子上游下游序列具有一定的同源性。另外 ,约氏疟原虫yoelii虫株与约氏疟原虫 17XNL虫株的内含子间存在着多态性 ,存在着几个变异 。
- 蔺亚晖韩志富李会良张玲王恒
- 关键词：约氏疟原虫内含子恶性疟原虫阳性克隆真核基因剪接位点
- 通过筛选随机多肽文库研究ZO-1中PDZ1结构域的配体结合特点被引量：1
- 2006年
- 选择ZO-1的PDZ1结构域作为研究对象,以酵母双杂交为筛选系统,筛选随机多肽文库和与其它PDZ结构域的配体进行相互作用,阐明ZO-1PDZ1的配体结合特性.ZO-1PDZ1识别配体C末端保守的氨基酸序列通式可以表示为[S/T][F/Y/W][V/I/L/C]-COOH、[S/T][K/R]V-COOH、V[F/Y/W][L/C]-COOH、EYV-COOH.研究发现ZO-1PDZ1的配体同时具有3种传统PDZ结构域配体的特点,不同的是其结合配体-1位对芳香族氨基酸具有强烈的偏好性.并且某些PDZ结构域配体的-1位和-3位对结构域与配体相互作用的特异性和亲和力有重要的作用.随后通过生物信息学的方法在Swiss-Prot数据库找到与此识别规律相符合的天然人类蛋白质.根据蛋白质的功能和细胞定位等性质选择10个配体用酵母双杂交验证相互作用.证实的相互作用配体有4个.本研究希望用这样的研究策略建立一种有效的研究蛋白质相互作用的方法,通过在全蛋白质组规模上对含有结合配体保守氨基酸序列的蛋白质的查询,理论上可以找到现有数据库中所有可能与目的结构域结合的潜在配体蛋白,特别是那些筛选cDNA文库不容易获得的低丰度配体.
- 田瑞李英娜宋婀莉高诗娟黄海明张玲马素参高友鹤
- 关键词：蛋白质相互作用PDZ结构域酵母双杂交
- 机器学习方法预测PDZ结构域的结合蛋白
- PDZ结构域特异地结合配体蛋白C末端的3-7个氨基酸残基。我们收集了613种PDZ(swissprot52.1)和文献报道的105种PDZ的338对相互作用信息,选取了PDZ上23个决定相互作用的位点及配体C末端的8位氨...
- 张玲邵晨高友鹤
- 文献传递
- 基因组范围的蛋白质功能研究方法初探
- 2001年
- 基因组大规模测序的进展使人们获得了大量新基因数据 ,对这些数据进行基因组范围的规模化功能分析的新方法应运而生 .对其中的结构域融合分析法、系统进化特征法、簇分析法 ,结构分析法 。
- 张玲林澄涛王恒
- 关键词：基因组蛋白质功能研究方法
