丁泽红
- 作品数：31 被引量：62H指数：4
- 供职机构：中国热带农业科学院热带生物技术研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金海南省自然科学基金中央级公益性科研院所基本科研业务费专项更多>>
- 相关领域：农业科学生物学经济管理更多>>
- 木薯MeTPS9基因克隆及表达特性分析被引量：2
- 2017年
- 旨在揭示木薯Me TPS9基因在干旱、低温、遮荫等非生物胁迫应答中的作用。用RT-PCR的方法从木薯叶片中克隆Me TPS9基因(Gen Bank登录号:MF276889),用MEGA软件构建系统进化树,用Dna SP软件分析基因结构变异,用Plant CARE分析启动子元件,用荧光定量PCR技术分析Me TPS9在不同组织中以及响应不同非生物胁迫的表达特性。结果显示,从木薯中克隆了一个TPS基因Me TPS9。该基因具有2 598 bp的开放阅读框,编码865个氨基酸,含有TPS家族保守结构域。系统进化树分析表明,Me TPS9与荠菜花和拟南芥中同源基因的亲缘关系较近,序列相似性分别为76.2%和75.6%。基因结构变异发现,木薯野生种和栽培种之间共有66个突变位点,其中11个为错义突变。启动子元件分析表明,Me TPS9含有干旱相关元件MBS、低温相关元件LTR、热胁迫相关元件HSE、以及ABA相关元件ABRE。实时荧光定量PCR分析表明,Me TPS9的表达量在须根中最高,在叶片中最低。而且,Me TPS9基因的表达能被干旱、低温、和遮荫处理显著诱导。Me TPS9在转录水平对木薯干旱、低温、和遮荫胁迫起调控作用,可作为候选基因进一步研究其在木薯抗逆中的作用。
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- 关键词：木薯海藻糖合成酶非生物胁迫
- 木薯MePIL1基因克隆与表达分析被引量：1
- 2016年
- 旨在克隆木薯Me PIL1基因,揭示其在木薯遮荫等非生物逆境胁迫中的作用。用RT-PCR的方法从木薯栽培种Ku50叶片中克隆Me PIL1基因,对其进行序列比对和系统进化树分析,研究其在木薯野生种和栽培种之间的结构变异,并应用荧光定量PCR技术分析其表达特性。结果显示,克隆获得木薯Me PIL1基因,该基因具有一个1 578 bp的开放阅读框,编码525个氨基酸,含有一个HLH保守结构域。系统进化树分析表明,Me PIL1与其在杨树和杞柳中的同源基因聚在一起,亲缘关系较近。基因结构变异分析显示,Me PIL1在HLH结构域非常保守,其结构变异主要来自于栽培种与野生种之间的差异,且整体上分布比较均匀。表达分析结果显示,Me PIL1在叶片中高表达,而且其表达量受到遮荫和渗透胁迫的诱导。结果表明,成功克隆了木薯Me PIL1基因,并且Me PIL1在转录水平参与木薯对遮荫和渗透胁迫的应答。
- 丁泽红铁韦韦付莉莉颜彦夏志强王文泉胡伟
- 关键词：木薯遮荫基因克隆
- 木薯MePYL8基因克隆及表达分析被引量：15
- 2018年
- 脱落酸介导的核心信号通路在植物应答非生物胁迫的过程中具有重要功能,而PYL蛋白是该信号通路中ABA的受体,因此研究PYL家族基因有助于完善对该信号通路的理解。本研究利用PCR技术从木薯栽培种KU50中克隆得到一个PYL家族基因,命名为MePYL8,该基因的开放阅读框全长为579 bp,编码193个氨基酸。对其进行序列比对表明MePYL8与橡胶树和麻疯树中的氨基酸序列同源性最高,进化树分析显示MePYL8与拟南芥PYL8/RCAR3的亲缘关系最近。此外,利用荧光定量PCR对MePYL8进行多种处理下的表达分析,结果显示:MePYL8在转录水平受到ABA、高盐胁迫和干旱胁迫的诱导作用,同时受到氧化胁迫的抑制作用,表明MePYL8在多种非生物胁迫下的信号转导通路中可能具有重要的功能。本研究为后续深入研究该基因的功能和分子调控机制提供理论依据,为作物抗逆育种提供潜在的资源。
- 颜彦铁韦韦丁泽红吴春来胡伟
- 关键词：木薯基因克隆
- 木薯抗病相关基因MeAHL17及其应用
- 本发明公开了一种木薯抗病相关基因MeAHL17及其应用；所述MeAHL17的CDS核苷酸序列如SEQ ID No.1所示。本发明准确鉴定了MeAHL17在抵抗木薯细菌性枯萎病中的功能，为木薯细菌性枯萎病改良提供了理论依据...
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- 文献传递
- 木薯MeHB2转录因子的克隆与表达分析被引量：3
- 2016年
- 该研究以木薯(Manihot esculenta Crantz)Ku50为实验材料,采用RT-PCR方法从叶片中克隆了1个HD-Zip基因MeHB2。MeHB2基因含有882bp的开放阅读框,编码293个氨基酸。蛋白质保守结构预测显示,MeHB2编码的蛋白含有Homeodomain、Leu zipper和HD-Zip_N等结构域,属于HD-Zip II成员。进化树分析表明,MeHB2与麻疯树、杨树和杞柳中同源基因的亲缘关系较近。实时荧光定量PCR分析表明,低温胁迫、渗透胁迫、ABA和H2O2均可诱导MeHB2基因的表达,而盐胁迫抑制其表达。此外,MeHB2的表达量还受到遮荫胁迫的诱导。研究表明,MeHB2在木薯非生物逆境调控中扮演重要角色。
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- 关键词：木薯HD-ZIP克隆基因表达
- 玉米光合突变体bsd2(bundle sheath defective II)的转录组分析被引量：4
- 2016年
- 玉米是典型的C_4植物,具有独特的花环结构和二氧化碳浓缩机制,因而具有较高的光合效率。BSD2(bundle sheath defective II)基因主要在花环结构的维管束鞘细胞表达,其缺失会造成维管束鞘细胞中的叶绿体发育异常,从而影响叶片的光合作用。本研究对高光和低光下的野生型和bsd2突变体不同发育阶段的叶片进行RNA-seq测序。结果表明,BSD2基因缺失对叶片非光合部位影响较小;对叶片光合部位影响较大。其中,光合作用、淀粉和糖代谢、四吡咯生物合成等相关基因在bsd2突变体中显著下调,而蛋白质合成与折叠、RNA加工与转录调节相关的基因显著上调。
- 江芳丁泽红董雷李平华
- 关键词：玉米RNA-SEQ
- 玉米光合突变体hcf136(high chlorophyll fluorescence 136)的转录组分析被引量：1
- 2018年
- 玉米是典型的C_4作物,其光合作用由花环结构的两种细胞(叶肉细胞和维管束鞘细胞)共同完成。玉米hcf136(high chlorophyll fluorescence 136)突变体叶肉细胞叶绿体不能形成基粒从而丧失了PSII活性,但维管束鞘细胞的叶绿体发育不受影响,是研究玉米C_4光合机理的好材料。本研究利用转录组测序(RNA-Seq)技术,通过对高光和低光下野生型和hcf136突变体不同叶片部位进行转录组分析发现,PSII相关基因的转录未发生明显差异,表明PSII复合体的缺失是非转录水平变化所引起。此外,突变体中淀粉合成受阻,糖降解、糖转运及Cu^(2+)转运等代谢过程加剧,且一些转录因子表达发生显著变化。该结果对进一步深入研究玉米HCF136基因的功能提供了参考。
- 吴庆飞秦磊董雷丁泽红李平华杜柏娟
- 关键词：玉米RNA-SEQ
- 一种嘉宝果的脱毒微繁方法
- 本发明涉及种子种苗、农业生物技术和热带珍稀果树植物种苗繁育领域，公开了一种嘉宝果的脱毒微繁方法，具体是利用植物脱毒微繁殖及组织培养的方法，包括外植体消毒、增殖培养、生根培养、炼苗培养、移栽育苗等过程。本发明的嘉宝果脱毒微...
- 胡伟丁泽红铁韦韦颜彦
- 文献传递
- 木薯MeCIPK1基因克隆及表达分析被引量：1
- 2018年
- CIPK蛋白是一类植物特有的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶,已在多个物种中被证实参与逆境胁迫应答。本研究利用PCR技术从木薯栽培种KU50中克隆得到一个CIPK家族基因,命名为Me CIPK1,该基因的开放阅读框全长为1 137 bp,编码379个氨基酸。生物信息学分析表明Me CIPK1蛋白含有CIPK家族保守的丝氨酸/苏氨酸激酶结构域和NAF结构域,与橡胶树和麻疯树中的氨基酸序列同源性最高。利用荧光定量PCR研究Me CIPK1在多种处理下的表达模式,结果表明Me CIPK1在转录水平受到ABA、高盐胁迫、干旱胁迫和低温的抑制作用,同时受到氧化胁迫的诱导作用,故此推测Me CIPK1在木薯应答多种非生物胁迫的过程中可能会发挥重要作用。本研究结果为后期深入分析木薯Me CIPK1基因的功能提供理论基础。
- 颜彦铁韦韦丁泽红吴春来胡伟
- 关键词：木薯基因克隆
- 一种提高木薯中褪黑素含量的方法
- 本发明公开了一种可以提高木薯营养价值的药剂组合，具体而言是一种可以提高木薯中褪黑素含量的药剂组合。本发明研究发现，CaCl<Sub>2</Sub>处理采收后的木薯块根，不仅可以促进木薯块根中褪黑素含量的增加，还可以诱导褪...
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- 文献传递
