杜星
- 作品数：17 被引量：21H指数：3
- 供职机构：南京农业大学动物科技学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金江苏省“青蓝工程”基金中国博士后科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学医药卫生更多>>
- NORFA通过TGF-β信号通路调控猪卵泡颗粒细胞凋亡
- 引言长链非编码RNAs (long noncoding RNAs,lncRNAs)是一类长度大于200nt并缺乏编码能力的内源性RNA分子.研究表明lncRNAs能够通过不同作用模式广泛参与多种细胞生物学过程[1].近年...
- 杜星李琦琦李齐发
- TGF-β1基因g.8666_8667delAC位点突变与大白猪繁殖性能的关系被引量：3
- 2022年
- [目的]本文旨在了解大白猪转化生长因子β1(TGF-β1)基因第4内含子序列特征,分析其突变位点多态性与繁殖性能的关系及潜在机制。[方法]利用PCR扩增和测序技术获得大白猪TGF-β1基因第4内含子序列,用生物信息学软件分析序列特征;利用DNA混池测序技术筛选目标序列突变位点,用直接测序法进行基因分型,用SAS软件对突变位点多态性与繁殖性能进行关联性分析;利用克隆测序技术测定不同基因型个体卵巢颗粒细胞中TGF-β1基因编码区序列,分析突变对mRNA剪接的影响。[结果]大白猪TGF-β1基因第4内含子序列全长189 bp,含有1个微卫星(GT)_(6)和多个顺式作用元件结合位点,与杜洛克猪相应序列的一致性为98.94%。在第4内含子63~64核苷酸处(TGF-β1基因的8666~8667核苷酸处)发现一个2 bp序列的插入/缺失突变,命名为g.8666_8667delAC。在大白猪群体中发现3种基因型(ins/ins、ins/del和del/del),其中ins/ins为优势基因型(57.8%)。关联性分析发现,ins/del基因型母猪的初产死胎数(NSB)显著高于另2种基因型(P<0.05);del/del基因型母猪的总产仔数(TNB)比ins/ins基因型和ins/del基因型分别高0.47和0.46头(P>0.05)。克隆并测序后发现ins/ins基因型和ins/del基因型母猪卵巢颗粒细胞中TGF-β1基因编码区序列长度一致。[结论]TGF-β1基因是大白猪繁殖性状的候选基因,g.8666_8667delAC位点del/del基因型是总产仔数(TNB)的有利基因型,ins/del基因型母猪初产死胎数(NSB)较高;g.8666_8667delAC位点突变不是通过影响TGF-β1基因的选择性剪接来影响繁殖性能。
- 王玲芳李尚来李琦琦杜星吴望军宋奔驰李齐发
- 关键词：大白猪TGF-Β1基因多态性繁殖性能
- BRE-AS启动子负调控区变异与启动子活性、母猪繁殖力的关系被引量：1
- 2023年
- [目的]本试验旨在研究BRE反义lncRNA(BRE antisense lncRNA,BRE-AS)基因启动子负调控区(PNRR)序列特征,以及变异位点多态性与母猪繁殖性状、启动子活性的关系。[方法]采用DNA测序法获得大白猪BRE-AS基因PNRR序列;利用池DNA测序筛选大白猪BRE-AS基因PNRR上的变异位点,DNA测序法进行基因分型;利用GLM模型进行变异位点多态性、单倍型与母猪繁殖性状的关联分析;利用荧光素酶报告系统分析变异对BRE-AS基因启动子活性的影响。[结果]大白猪BRE-AS基因的PNRR位于-952~-161 nt,长度792 bp。在大白猪BRE-AS基因PNRR的-794和-756 nt处发现了2个变异位点,分别将其命名为g.-794T>G和g.-756A>C。在大白猪群体中BRE-AS基因g.-794T>G位点有3种基因型,其中TT型为优势基因型(0.752),T为优势等位基因(0.863);在g.-756A>C位点有3种基因型,其中AA型为优势基因型(0.759),A为优势等位基因(0.868);2个变异位点形成3种合并基因型,其中TT/AA型为优势基因型(0.760),T-A为优势单倍型(0.869)。关联分析发现2个位点及其合并基因型均与母猪总产仔数(TNB)、产活仔数(NBA)和健仔数(NSP)等3个繁殖性状间显著(P<0.05)或极显著(P<0.01)关联。荧光素酶活性分析发现G-C单倍型启动子活性极显著高于T-A单倍型(P<0.01)。[结论]BRE-AS是大白猪繁殖性状的候选基因,其PNRR上2个变异位点(g.-794T>G和g.-756A>C)通过影响启动子活性影响其母猪繁殖力。
- 王杨王苗苗单保森吴望军杜星李齐发
- 关键词：大白猪繁殖性状
- miR-181b靶向SMAD7调控猪卵巢颗粒细胞凋亡
- 引言TGF-β信号通路在细胞增殖、分化和凋亡过程中发挥重要作用,是雌性生殖过程中不可或缺的。SMAD7作为抗TGF-β信号通路的抑制型SMAD基因,通过负反馈对TGF-β通路进行调控。在成年哺乳动物中,SMAD7主要在肾...
- 姚望杜星潘增祥李齐发
- 关键词：颗粒细胞SMAD7SMAD3
- 文献传递
- miR-23a-27a-24簇在猪卵巢颗粒细胞凋亡中的作用被引量：2
- 2022年
- 为了解猪miR-23a-27a-24簇的序列及结构特征,分析其在猪卵巢颗粒细胞凋亡中的作用,采用测序技术获得猪miR-23a-27a-24簇前体序列;利用生物信息学方法分析miR-23a-27a-24簇的序列信息、结构和生物学功能;使用双酶切法构建猪miR-23a-27a-24簇的过表达载体,转染至体外培养的猪卵巢颗粒细胞中,qRT-PCR检测过表达效果;通过流式细胞术检测颗粒细胞凋亡率。结果显示:猪miR-23a-27a-24簇前体序列长度为408 bp,核苷酸序列与其他哺乳动物的一致性较高;哺乳动物miR-23a-27a-24簇均位于基因组中ZSWIM和miR-181c基因之间,成员转录顺序相同、间距相近;功能富集分析发现,miR-23a-27a-24簇的靶基因主要富集于RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正调控的生物学过程和PI3K-Akt信号通路中;成功构建猪miR-23a-27a-24簇的过表达载体,且在猪卵巢颗粒细胞中高效表达;流式细胞术分析发现,转染miR-23a-27a-24簇过表达载体能够显著提高颗粒细胞的凋亡率(P<0.05),极显著提高颗粒细胞早期凋亡率(P<0.01)。结果表明miR-23a-27a-24簇能够促进猪卵巢颗粒细胞凋亡。
- 王思琪张卓凡杨柳杜星吴望军李齐发
- 关键词：卵巢颗粒细胞细胞凋亡
- 猪卵泡发育过程中颗粒细胞内参基因表达稳定性分析
- 2024年
- [目的]本研究旨在分析猪卵泡发育不同阶段颗粒细胞中内参基因的表达稳定性,筛选有效内参基因用于鉴定猪卵泡发育关键调控基因及其表达模式。[方法]基于形态学观察与类固醇激素检测分离猪腔前、有腔、成熟和闭锁卵泡,并收集相应颗粒细胞;利用RT-qPCR检测甘油醛3-磷酸脱氢酶(GAPDH)、β-肌动蛋白(ACTB)、ATP合酶F1(ATP5F1)、β2-微球蛋白(B2M)、真核翻译伸长因子1α(EEF1A1)、次黄嘌呤磷酸核糖转移酶1(HPRT1)、核糖体蛋白S3(RPS3)、微管蛋白α-1b(TUBA1B)和泛素C(UBC)等9个候选内参基因在猪卵泡不同发育阶段颗粒细胞中的表达水平;综合ΔCt、geNorm、NormFinder、BestKeeper和RefFinder等算法分析候选内参基因在猪卵泡发育过程中的表达稳定性。[结果]候选内参基因在猪卵巢颗粒细胞中的表达水平存在较大差异,其中EEF1A1和TUBA1B的表达水平较高,而HPRT1和UBC的表达水平较低;不同算法得到的稳定性存在差异,用ΔCt、NormFinder和BestKeeper分析发现RPS3和ATP5F1的稳定性较高,用geNorm分析发现GAPDH和HPRT1的稳定性较高,最终利用RefFinder进行综合权重分析得出候选内参基因的稳定性从高到低依次为RPS3、ATP5F1、HPRT1、EEF1A1、GAPDH、ACTB、TUBA1B、B2M、UBC。进一步以不同表达稳定性内参基因为参照对母猪繁殖力候选基因FSHR和NORFA在卵泡发育过程中的表达模式进行检测,结果表明内参基因稳定性对准确鉴定目的基因表达水平和变化模式至关重要。[结论]RPS3和ATP5F1在猪卵泡发育过程中具有较高的表达稳定性,可作为有效内参基因用于后续猪卵泡发育相关研究,为鉴定猪卵泡发育关键调控基因及其表达模式等相关内参基因研究提供理论依据。
- 霍泱安李小雪孙郴李齐发杜星
- 关键词：卵泡发育卵巢颗粒细胞RT-QPCR内参基因
- miR-34a通过激活lncRNA NORHA转录诱导猪卵巢颗粒细胞早期凋亡
- 2024年
- 【目的】探索miR-34a诱导GCs凋亡的RNA激活机制,为揭示猪卵泡闭锁的分子机理、筛选调控母猪繁殖的小核酸调节物提供依据。【方法】利用生物信息学方法分析猪miR-34a特征及其与潜在靶基因lncRNA NORHA启动子的结合情况。利用核质分离技术分析猪GCs中miR-34a的亚细胞定位。qPCR检测miR-34a对猪GCs中NORHA、凋亡标志基因BCL-2和BAX表达的影响。利用荧光素酶活性分析验证miR-34a对NORHA启动子转录活性的靶向调控关系。利用染色质免疫沉淀(ChIP)检测miR-34a对猪GCs中NORHA启动子miRNA反应元件(MRE)处AGO2和组蛋白修饰因子富集情况。利用western blot和流式细胞术分析miR-34a通过NORHA对下游因子FOXO1的表达和细胞凋亡的调控作用。【结果】猪miR-34a为基因间miRNA,其序列在哺乳动物中具有高度保守性。亚细胞定位分析显示,miR-34a在猪GCs中细胞核与细胞质均有分布。生物信息学分析显示miR-34a的MRE位于NORHA启动子-194 nt至-173 nt处,且两者结合自由能为-23.9 kcal·mol^(-1)。qPCR结果表明miR-34a显著上调猪GCs中NORHA的表达。荧光素酶活性分析显示,miR-34a极显著上调NORHA启动子报告载体活性,而对MRE突变型启动子活性没有显著影响。ChIP试验显示,miR-34a可增加NORHA启动子MRE处RNA诱导转录激活(RITA)复合物核心成员AGO2和转录激活型组蛋白H3K4me3的富集,而减少转录抑制型组蛋白H3K9me3的富集。共转试验显示,敲减NORHA可显著或极显著逆转由miR-34a过表达引起的FOXO1蛋白水平和早期凋亡率的上调,以及BCL-2/BAX比值的下调。【结论】细胞核miR-34a是猪GCs中的内源性小激活RNA(saRNA),通过靶向激活促凋亡lncRNA NORHA的转录,诱导猪GCs早期凋亡(细胞膜完整),可能参与猪卵泡闭锁的启动。
- 王思琪周春雪李玉琦杜星潘增祥李齐发
- 关键词：MIR-34A
- miR-23a/27a/24基因簇g.65307469G>A突变对大白猪产仔数和启动子活性的影响
- 2024年
- [目的]本文旨在研究大白猪miR-23a/27a/24基因簇启动子突变位点多态性与产仔数性状的关系及潜在机制,为母猪繁殖性状的分子育种提供新的潜在遗传标记。[方法]利用混池测序技术筛选猪miR-23a/27a/24基因簇启动子突变位点,直接测序法对大白猪群体(n=345)miR-23a/27a/24基因簇突变位点进行基因分型,计算遗传多样性;用线性模型对突变位点多态性与产仔数性状进行关联性分析;构建不同等位基因类型启动子载体,转染猪卵巢颗粒细胞,通过检测荧光素酶活性分析突变对启动子活性的影响;用生物信息学方法预测不同等位基因类型启动子潜在结合的差异转录因子,用荧光素酶活性分析差异转录因子对不同等位基因类型启动子活性的影响。[结果]在猪miR-23a/27a/24基因簇启动子-648 nt(Chr.2,65307469 nt)处发现1个新的G/A突变,命名为g.65307469G>A。在大白猪群体中发现3种基因型(GG、GA和AA),其中GG为优势基因型(89.57%),G等位基因为优势等位基因(94.64%)。关联性分析发现,GA基因型母猪的总产仔数(TNB)比GG基因型母猪每胎高0.56头(P<0.05)。荧光素酶活性分析结果显示G等位基因类型启动子活性显著高于A等位基因类型(P<0.05)。在不同等位基因类型启动子间发现1个潜在结合的差异转录因子死亡相关蛋白1(THAP1),成功构建猪THAP1基因过表达载体,共转试验结果显示转录因子THAP1对不同等位基因类型启动子活性均无显著影响(P>0.05)。[结论]miR-23a、miR-27a和miR-24是大白猪产仔数性状的候选基因,g.65307469G>A突变抑制miR-23a/27a/24基因簇的启动子活性,但与转录因子THAP1无关。
- 王思琪李玉琦周春雪杨柳杜星吴望军潘增祥李齐发
- 关键词：大白猪变异位点启动子活性
- miR-26b靶向Smad4基因调控猪卵泡颗粒细胞凋亡
- 刘吉英杜星潘增祥谢庄刘红林徐银学李齐发
- 关键词：颗粒细胞凋亡SMAD4
- SMAD4与miR-10b靶向CYP19A1基因调控猪卵泡颗粒细胞凋亡与E2分泌
- 引言雌二醇(Estradiol,E2)主要由卵泡颗粒细胞分泌,对于哺乳动物卵泡生长、发育以及排卵等过程发挥着至关重要的作用.由CYP19A1基因编码的芳香化酶P450arom是E2生物合成过程的关键限速酶.研究表明特异性...
- 李琦琦杜星张立凡潘增祥李齐发
