谢坤
- 作品数：8 被引量：9H指数：1
- 供职机构：山东省农业科学院更多>>
- 发文基金：山东省农业良种产业化开发项目山东省自然科学基金山东省农业良种工程项目更多>>
- 相关领域：农业科学文化科学自动化与计算机技术金属学及工艺更多>>
- 可调节多功能定量取种装置及使用方法
- 可调节多功能定量取种装置及使用方法，涉及育种研究中取种技术领域，用于解决现有从储种瓶或储存盒内取种时存在的取种效率低下、种子长时间暴露不利储存的问题。包括支架、取样板和限量件，所述支架为U形结构，所述限量件和取样板上下设...
- 杨永义谢坤李娜娜夏晗
- 山东省主要栽培苹果基因组重测序及SNP芯片位点挖掘
- 2021年
- 为促进苹果品种快速鉴定、种质资源评价及选择利用,本研究对山东省31个栽培苹果开展了重测序及SNP位点挖掘研究。样品DNA提取自叶片,并按照Illumina操作手册制备双端文库。经由Hiseq 4000平台对31个苹果基因组进行重测序,共产生了363 Gb的高质量序列,平均每样品12.5 Gb,这代表了苹果基因组大约15.9倍覆盖度。充分满足重测序分析及SNP位点挖掘的需要。错配率比较试验发现随着错配率逐渐升高,比对率逐渐升高至饱和。其中总比对率、成对数据比对率及单端数据比对率与错配率呈现显著相关(P<0.000 1),均符合一元四阶方程(回归系数R^(2)>0.99)。随着错配率提高,比对严谨度降低;基因组覆盖度逐渐升高,杂合位点准确度逐渐提高。采用两种算法所得到的位点,根据‘染色体+位点信息’作为特征值取交集,得到高可靠的单碱基SNP位点数据集:共检测到374 404个变异,平均每隔1 896个位点能够检测到一个变异,桑格验证试验准确度高达98.1%。SNP的功能注释分析结果显示在全部373 763个位点中有143 269个(38.27%)位于基因间区,25 047个(6.7%)位于基因编码区,179 426个(47.92%)位于基因上游-下游的2 kb区域。在所有编码区SNP里,有13 422个是非同义变异位点,11 625个是同义变异位点。两种SNP比率为1.15∶1。进一步利用过滤的4DTV位点,采用邻接算法构建的聚类分析结果符合山东省栽培苹果分类的趋势。
- 段乃彬马玉敏王昆王效睦谢坤白静杨永义蒲艳艳宫永超
- 关键词：栽培苹果基因组
- 豌豆苗定量收割器
- 本发明公开了一种豌豆苗定量收割器，涉及豌豆苗收割技术领域，解决人工收割方式无法定量收割的问题。包括收割器底板和定量组件，所述收割器底板用于与栽种豌豆苗的种植盘上表面贴合，所述收割器底板的一端具有切割刀片，所述收割器底板的...
- 白静李润芳李冠谢坤马玉敏李娜娜
- 豌豆苗收割组件及使用方法
- 豌豆苗收割组件及使用方法，用于解决现有手持剪刀对豌豆苗进行收割时存在的，效率低下、豌豆苗排列不整齐的问题。包括配套使用的分拨切割装置和捆扎装置，分拨切割装置包括机架、分拨单元和切割单元，机架为“U”形结构，分拨单元包括第...
- 白静李冠谢坤李润芳杨永义
- 培育转基因水稻干扰褐飞虱糖运输蛋白基因6的研究
- 2024年
- 褐飞虱是危害水稻的重要害虫,对水稻的生产造成严重破坏。选取对褐飞虱生长发育有重要影响的糖运输蛋白基因6(Nlst6)为靶标基因,构建表达靶标基因的dsRNA的RNAi载体,通过农杆菌侵染转化培育转基因水稻,筛选获得表达靶标基因的dsRNA和siRNA的转基因水稻材料。褐飞虱取食转基因水稻后,体内靶标基因的转录水平显著降低,雌虫生殖力及后代若虫体重均显著降低,但未有致死表型出现。综上,通过培育转基因水稻干扰褐飞虱的生长发育来防治褐飞虱成为可能,为后续转基因抗褐飞虱水稻的培育提供依据。
- 谢坤李娜娜丁汉凤白静丛韫喆李广贤姚方印杨永义
- 关键词：褐飞虱RNAI转基因水稻
- 萝卜叶绿体及线粒体基因组测序与组装被引量：9
- 2015年
- 为从分子水平上探讨萝卜雄性不育机理及育性恢复关系,本研究对4个萝卜雄性不育系及1个雄性不育保持系材料进行了线粒体及叶绿体的基因组测序、组装。测序采用PE90策略,获得Cleandata 1.2 G。通过数据过滤、计算测序深度及Kmer频度分析,确定了组装的mer值及覆盖度参数。我们先用Cleandata组装叶绿体基因组,再用过滤的数据组装线粒体基因组,最后利用Sanger测序填补Gap得到各基因组全长。结果表明参试样品萝卜叶绿体基因组长度在153 352~153 445 bp之间,线粒体基因组长度在239 696~258 853 bp之间,均包括1个LSC,1个SSC及1对反向重复序列。基因注释结果表明叶绿体基因组编码了87个蛋白基因、20个t RNA基因及4个r RNA基因,线粒体基因组则编码了82个蛋白基因,17个t RNA基因及3个r RNA基因。
- 段乃彬王俊峰白静谢坤王效睦
- 关键词：萝卜线粒体叶绿体基因组
- 小型定量取种设备及取种方法
- 小型定量取种设备及取种方法，涉及取种技术领域，用于解决从存种瓶内倒出种子后采用人工数数的方式获取所需数量种子时存在的，人工数数操作不便、存种瓶内种子长时间暴露不利于储存的问题。包括手柄、取种杆和驱动件，所述手柄内具有相互...
- 谢坤李娜娜杨永义夏晗
- 半自动单粒种子磨样设备及磨样方法
- 半自动单粒种子磨样设备及磨样方法，涉及种子研磨加工处理技术领域，用于实现对单粒种子的研磨，解决现有种子研磨方式研磨效率低的问题。磨样设备包括基座、支撑臂、转盘和研磨组件，所述支撑臂和基座上下设置且两者之间具有支撑杆，所述...
- 李娜娜杨永义谢坤夏晗
