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白花泡桐二倍体及四倍体响应盐胁迫的蛋白质组变化的研究被引量：7: 2016年; 为阐明泡桐多倍体响应盐胁迫的分子机制,本试验以白花泡桐为材料,采用同位素相对标记与绝对定量技术(isobaric tags for relative and absolute quantitation,iTRAQ)结合液相色谱与串联质谱(liquid chromatography-tandem mass spectrometry,LC-MS/MS)定量蛋白质组技术,研究盐处理前后白花泡桐四倍体和对应二倍体的蛋白质表达变化。同时,选择6个差异表达蛋白质进行实时荧光定量PCR(qRT-PCR)验证。通过比对分析,共鉴定到2 851个蛋白质,有32个是倍性相关的盐应答差异蛋白质。KEGG pathway分析发现,这些差异蛋白质主要参与光合作用,信号转导,植物病原相互作用及淀粉和糖代谢等。其中,2-酮戊二酸脱氢酶E1、过氧化物酶和氢离子转运ATP合酶表达差异显著,表明这些蛋白质可能是潜在的盐应答蛋白质。QRT-PCR验证结果表明,mRNA与蛋白质表达水平不一致。; 曹亚兵赵振利翟晓巧赵婉邓敏捷董焱鹏范国强; 关键词：白花泡桐盐胁迫蛋白质组 ITRAQ

泡桐新品种‘南四泡桐1号’: 2016年; ‘南四泡桐1号’是以二倍体南方泡桐无菌苗叶片为试验材料,通过秋水仙素诱导结合组织培养和无性系测定获得的泡桐新品种。新品种在生长量、木材性质、自然接干能力和抗逆性等方面均优于南方泡桐,可通过催芽处理、埋根等方法繁殖育苗,适合在南方泡桐的自然分布区和栽培区推广应用。; 曹艳春曹亚兵赵振利翟晓巧范国强; 关键词：泡桐四倍体

盐胁迫对南方泡桐基因表达的影响被引量：2: 2017年; 为阐明泡桐多倍体的耐盐分子机制,以南方泡桐二倍体及对应的四倍体为试验材料,以白花泡桐基因组为参考序列,利用RNA-Seq测序技术,研究了盐处理前后南方泡桐四倍体和对应二倍体的基因表达变化。通过比对分析,共鉴定出与盐胁迫相关的差异表达基因2 940个。对这些差异基因进行GO功能分类,结果显示差异基因共参与了39个分类,集中在细胞、结合、催化等分类功能区的数量最多。KEGG代谢通路分析发现,这些差异表达基因主要参与了Plant hormone signal transduction,Carbon metabolism,Biosynthesis of amino acid等,其中编码MYB、WRKY、bZIP、ATPase等的基因差异表达显著。表明这些基因可能是潜在的盐胁迫响应基因。采用qRTPCR技术验证了随机挑选的9个差异表达基因,结果与转录组测序数据趋势一致。; 李冰冰赵振利邓敏捷曹亚兵董焱鹏范国强; 关键词：盐胁迫差异表达基因转录组

白花泡桐基因组组装及丛枝病发生相关基因PfCYP714A功能研究: 泡桐原产于中国,因其速生、材质好和适应性强等特点,常被作为重要的速生用材和农田防护林树种,在缓解木材短缺、改善生态环境、提高农民收入和保障粮食安全等方面发挥了重要作用。泡桐丛枝病(Paulownia withes’bro...; 曹亚兵; 关键词：白花泡桐丛枝病基因组植株矮化

白花泡桐丛枝病发生与转录组和代谢组关系研究: 泡桐丛枝病(Paulownia Witches Broom,Pa WB)是一类原核生物—植原体(Paulownia Witches Phytoplasma)感染引起的传染性病害,其发病率可高达85%,是泡桐生产中最严重的...; 曹亚兵; 关键词：白花泡桐丛枝病代谢物

泡桐新品种南四泡桐1号: 2016年; 南四泡桐1号为河南农业大学培育的同源四倍体南方泡桐新品种。自2008年以来,组织培养苗通过炼苗、移栽和移栽后管理等措施定植于河南省、山东省、江西省和安徽省等地区,通过不同立地条件的区域试验,经生长量、抗逆性等性状观察测定后筛选出生长特性、材质和抗逆性等指标优良的无性系单株，经育苗造林后，其生物学和生态学等特性表现稳定。; 曹艳春曹亚兵赵振利范国强翟晓巧; 关键词：同源四倍体组织培养苗性状观察育苗造林栽后管理

泡桐丛枝病发生与代谢组变化的关系（英文）被引量：5: 2017年; 【目的】通过对泡桐健康苗和丛枝病苗进行代谢组分析,探讨代谢物变化与泡桐丛枝病发生的关系。【方法】利用非靶标的高效液相色谱-质谱联用技术(HPLC-MS)对长度为1.5 cm的健康和植原体感染的毛泡桐组培苗顶芽进行代谢组分析,将上机检测得到的质谱数据用主成分分析和偏最小二乘判别分析法进行分析得到最终差异的荷质比,并将其比对到KEGG代谢物数据库中,通过分析找到植原体感染的毛泡桐组培苗与健康组培苗之间代谢物含量和种类的差异。【结果】毛泡桐病苗和健康苗中有1 612种代谢物发生变化。与健康苗相比,在病苗中有765种代谢物含量下降,847种代谢物含量增多。KEGG代谢通路分析表明,这些代谢物中有460种代谢物参与111个代谢途径,其中变化显著的3个代谢途径为"异喹啉生物碱合成"、"双萜类生物合成"和"黄酮生物合成"。另外,病苗中参与植物激素信号转导的代谢物也发生明显变化。其中在植原体感染的毛泡桐病苗中玉米素、玉米素核苷、赤霉素、二氢玉米素核苷、花葵素、黄芩素和花青色素等含量发生明显变化,表明这些代谢物含量的变化可能与丛枝病发生有一定关系。【结论】通过比较健康苗和病苗中代谢物含量和种类的变化,找出可能与丛枝病发生密切相关的代谢物及其相应的代谢通路,该结果有助于进一步阐明泡桐和其他植物丛枝病发生分子机制,并为泡桐丛枝病有效防治奠定基础。; 曹亚兵翟晓巧邓敏捷赵振利范国强; 关键词：毛泡桐丛枝病植物激素花青素

丛枝病对白花泡桐环状RNA表达谱变化的影响被引量：5: 2018年; 为了进一步探究泡桐丛枝病发生的分子机制,以白花泡桐健康苗及病苗为试验材料,参考白花泡桐基因组序列,利用高通量测序技术研究白花泡桐circRNAs在丛枝病发病过程中的表达情况。通过进一步分析,本研究共鉴定得到1 009个circRNAs,其中差异表达的为50个。对差异circRNAs的host gene进行GO功能分类和KEGG pathway富集分析。其中,GO功能分类结果表明,这些host gene主要涉及叶绿体、蛋白结合、细胞质方面的功能。KEGG代谢通路分析表明他们参与了Plant-pathogen interaction、Glycine,serine and threonine metabolism等代谢通路。; 李冰冰王哲曹亚兵林丹范国强; 关键词：白花泡桐丛枝病

蛋白质巴豆酰化修饰研究进展被引量：2: 2020年; 赖氨酸巴豆酰化修饰作为蛋白翻译后修饰的一种,在染色质重塑、细胞代谢、细胞周期以及细胞重组中发挥着重要的作用。近年来,关于赖氨酸巴豆酰化修饰的研究越来越受科研工作者青睐。为进一步了解巴豆酰化修饰的生物学意义,就蛋白质巴豆酰化修饰在微生物、动物、人类和植物方面的研究现状进行综述,以期为植物病害的表观遗传学研究提供新的思路。; 曹喜兵赵振利曹亚兵翟晓巧; 关键词：蛋白质

利福平对毛泡桐长链非编码RNA表达谱变化的影响被引量：1: 2017年; 为阐明lncRNAs对泡桐生长发育的调控作用,以利福平处理前后毛泡桐健康苗为试验材料,利用高通量测序技术研究利福平处理前后毛泡桐长链非编码RNA及其靶基因的表达变化情况。共鉴定出129个差异表达的lncRNAs,其中有83个差异lncRNAs对应289个靶基因,对这些靶基因进行GO功能分类,发现这些差异的靶基因共参与9个GO分类,其中细胞过程、代谢过程及涉及单有机体的靶基因数量最多。KEGG代谢通路分析发现,这些差异靶基因参与了植物激素信号转导、次生代谢生物合成等代谢通路。并采用qRT-PCR技术验证了随机挑选的6个差异表达长链非编码RNA及靶基因,结果与高通量测序数据一致。; 李永生李冰冰曹亚兵王哲董焱鹏邓敏捷赵振利范国强; 关键词：毛泡桐长链非编码RNA

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曹亚兵

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