林伟
- 作品数:2 被引量:2H指数:1
- 供职机构:天津医科大学总医院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金天津市科委重点资助项目更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- MeDIP-Seq检测大鼠不同状态雪旺细胞基因甲基化水平
- 2017年
- 目的探寻大鼠正常态雪旺细胞(NSCs)和激活态雪旺细胞(ASCs)差异甲基化基因。方法成年Wistar大鼠结扎坐骨神经,饲养7 d后分别从坐骨神经和臂丛神经提取ASCs和NSCs。S-100抗体免疫荧光染色鉴定细胞,CCK-8法测定细胞生长情况。甲基化免疫共沉淀测序(Me DIP-Seq)技术筛选出ASCs和NSCs的差异性甲基化区域;分析与轴突再生相关的差异甲基化基因在染色体的分布情况,并进行基因本体(GO)和信号通路(PATHWAY)分析。结果成功获得了高纯度的ASCs和NSCs,两者S-100均表达阳性。在相同培养条件下,ASCs生长速度更快。Me DIP-Seq共发现177 176个差异性甲基化区域,其中位于启动子(≤1 kb)内1 097个、启动子(1~2 kb)内1 136个,Cp G岛内567个。共获得214个与轴突再生相关的差异甲基化基因,与NSCs相比,ASCs高甲基化基因191个,低甲基化基因23个。这些基因位于各个染色体上,以12号染色体上最多(22个),M染色体最少(2个)。GO分析结果显示差异甲基化基因涉及了轴突生长、轴突形成、轴突延伸和轴突导向等过程;并且与MAPK、细胞黏附分子和Ras等信号通路有关。结论 ASCs和NSCs的甲基化水平存在明显的差异,可能与轴突再生有关。
- 林伟樊保佑冯世庆任一鸣周先虎
- 关键词:轴突计算生物学激活态雪旺细胞
- 肘管综合征中弓状韧带小分子RNA的生物信息学分析被引量:2
- 2016年
- 弓状韧带肥厚增生引起尺神经卡压磨损,是肘管综合征(CuTS)最常见的病因[1],但具体机制不明.本研究旨在探讨CuTS中弓状韧带小分子RNA(miRNA,rnjR)的生物信息学分析。
- 任一鸣周先虎魏志坚樊保佑林伟刘燊郝岩冯世庆
- 关键词:小分子RNA肘管综合征生物信息学分尺神经卡压CUTS