周建 作品数:5 被引量:2 H指数:1 供职机构: 首都医科大学附属北京朝阳医院 更多>> 发文基金: 北京市教委科技计划面上项目 更多>> 相关领域: 医药卫生 文化科学 更多>>
Human atrium transcripts analysis of permanent atrial fibrillation Background Atrial fibrillation (AF) is the most common sustained cardiac arrhythmia with increased risks of st... 周建 高杰 刘岩 顾松 张希涛 苏丕雄永久性心房颤动患者心房组织相关微小核糖核酸调控网络研究 2016年 目的:寻找永久性心房颤动(p AF)发病相关的关键微小核糖核酸(miRNA)及其调控靶基因。方法:表达谱芯片比较pAF患者(n=7)和窦性心律健康成人(n=4)的左心房组织的转录组,miRNA芯片筛选pAF相关差异表达miRNA,进行靶基因预测,与表达谱芯片的筛选结果进行负相关分析后的基因集合进行显著性功能分析(GO-Analysis),得到显著性、低误判率、靶向性的功能以及对应的靶基因;利用miRNA与靶基因之间的靶向调控关系,构建差异miRNA与分析后得到的显著性GO所属交集靶基因的调控网络(miRNA-Gene-Network),得到网络中起核心调控作用的miRNA和被miRNA调控的关键靶基因;采用qRT-PCR方法检验另一组pAF患者(n=5)和窦性心律健康成人(n=4)的左心房组织标本,验证所寻找的miRNA和被调控的关键靶基因。结果:26个差异表达的miRNA(16个上调、10个下调)和610个靶基因有显著性改变(fold change>2,P<0.05),与miRNAs芯片预测靶基因负相关后建立miRNA-靶基因调节网络发现与pAF显著相关的20个miRNA和107个靶基因,相关度最高的是miR-144、miR-1284、miR-1827、miR-1、miR-3613-3p及miR-101;其调控的重要靶基因包括PTEN、TAOK1、RUNX1及TPM3等,参与心房电生理改变、成纤维细胞及胎儿基因表达等心房重构机制。qRT-PCR验证结果提示,这些主要的miRNA和靶基因与pAF发生密切相关。结论:通过表达谱基因芯片与miRNA芯片联合分析pAF左心房组织标本,构建miRNA-靶基因调控网络,是发现pAF相关关键miRNA及其调控靶基因一种方法。 高杰 周建 顾松 刘岩 安向光 张希涛 苏丕雄关键词:永久性心房颤动 微小核糖核酸 信使核糖核酸 网络调控 永久性心房颤动患者左心房差异基因表达谱的建立与分析 2017年 目的:探讨与永久性心房颤动(p AF)发生、发展相关的基因和信号通路,为研究p AF发生的分子机制提供基础。方法:用Agilent 4x44K基因芯片分析p AF患者(n=7例)与窦性心律健康者(n=4例)的左心房组织m RNA,寻找差异表达的基因。以Gene Ontology(GO)和KEGG、Biocarta数据库为基础,分析差异表达基因参与的功能和信号通路。选取差异显著的部分基因应用实时定量-聚合酶链式反应(q RT-PCR)在5例p AF患者与5例窦性心律健康者标本进行验证。结果:表达谱结果显示,共有987个差异表达基因,其中567个基因表达下调,420个基因表达上调。选取9个差异显著的基因在新一组的病例标本上应用q RT-PCR验证,结果显示均有统计学差异,且改变与芯片结果一致。这些基因通过参与左心房组织纤维化、电重构、炎症、细胞应激、代谢调节、转录调节等与p AF的发生密切相关。GO和Pathway分析表明下调的基因主要参与调节代谢,表达上调的基因影响细胞应激反应、免疫应答、血小板活化等过程。结论:通过基因芯片技术发现与p AF发生相关的重要基因,通过影响细胞代谢、炎症、免疫应答、血栓形成等参与左心房的结构、功能重构。 高杰 周建 苏丕雄 刘岩 顾松 张希涛 安向光关键词:心房颤动 基因表达谱 永久性房颤的转录组分析及miRNA调控网络的建立 被引量:2 2016年 目的探索永久性房颤(p AF)发病相关的关键miRNAs及其调控的靶基因。方法联合应用表达谱芯片和miRNA芯片分析p AF患者(n=7)和健康成人(n=4)的左房组织,筛选p AF相关差异表达的miRNAs,进行靶基因预测后,与表达谱芯片的筛选结果进行负相关分析后的基因集合进行显著性功能分析(GO-analysis);利用miRNA与靶基因之间的靶向调控关系,构建差异miRNA与交集靶基因的调控网络(miRNA-gene-network),得到网络中起核心调控作用的miRNA和被调控的关键靶基因;采用RT-q PCR方法检验另一组p AF患者(n=5)和健康成人(n=4)的左房组织标本。结果表达谱基因芯片发现610个mRNA有显著性改变(fold change>2,P<0.05),miRNA-靶基因调节网络发现与p AF显著相关的20个miRNAs和107个靶基因,相关度最高的是miR-144、miR-1284、miR-1827、miR-1、miR-3613-3p和miR-101;其调控的重要靶基因包括CACNB2、EFNB1、PTEN、TAOK1、RUNX1和TPM3等;RT-q PCR验证结果显示这些miRNAs和靶基因密切相关。结论通过表达谱基因芯片与miRNAs芯片联合分析p AF左房组织标本,构建miRNA调控网络,发现p AF重要的miRNA-靶基因调控及功能,结果更加准确。 高杰 周建 顾松 刘岩 安向光 张希涛 苏丕雄关键词:永久性房颤 MICRORNA MRNA 靶基因 网络调控 线上线下微课程教学模式在心外科临床实习教学中的应用 2024年 目的探讨成果导向型教育(outcome based education,OBE)教育理念联合案例教学法(case-based learning,CBL)的线上线下微课程教学模式在心外科临床实习教学中的效果。方法选取首都医科大学附属北京朝阳医院2021年9月—2022年5月的60名心外科临床实习生为研究对象,随机分为OBE+CBL线上线下微课程教学模式组和传统临床教师带教组,每组30名。传统临床教师带教组采用传统的实习教学模式,OBE+CBL线上线下微课程教学模式组给予OBE+CBL线上线下微课程教学模式。比较2组的随堂测试成绩和出科考试成绩、实习生满意度。结果OBE+CBL线上线下微课程教学模式组的随堂测试成绩为(96.2±5.8)分,高于传统临床教师带教组的(92.3±4.6)分,差异有统计学意义(P<0.05)。2组的出科考试成绩比较,差异无统计学意义(P>0.05)。30名实习生对心外科OBE+CBL线上线下微课程教学模式的满意度较高,认为该模式能提高自己的自学能力、学习兴趣,对掌握教学内容有帮助,能满足教学需求、提高自我能力,且没有实习生对该教学模式持不满意及一般态度。结论OBE+CBL线上线下微课程教学模式能增强实习生获取知识的能力和临床实习技能,临床实习生满意度较高。 高杰 郭玉林 贾彦雄 魏昌伟 周建关键词:CBL 实习教学 在线课堂 教学模式