胡桓
- 作品数：13 被引量：10H指数：2
- 供职机构：辽宁大学生命科学院更多>>
- 发文基金：辽宁省高校创新团队支持计划辽宁省教育厅基金资助项目辽宁省科技厅基金更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学自动化与计算机技术自然科学总论更多>>
- 《水浒传》人物关系网络的文本挖掘被引量：3
- 2018年
- 本研究以《水浒传》中108个主要人物为研究对象,通过文本挖掘建立人物关系矩阵,利用社会网络方法分析人物的社会网络。研究表明:宋江、吴用、李逵、卢俊义、戴宗、花荣构成的小团体是108将的领导层;108个人物构成的网络可以分成第一集团、第二集团、后勤集团、水军集团、介于第一和第二集团的中间派;《水浒传》人物关系网络结构符合幂律分布的特点。本研究有助于推动文本挖掘在文学作品分析中的应用。
- 唐毅王硕胡桓
- 关键词：社会网络分析幂律分布文本挖掘水浒传
- 基于集成策略预测人类长非编码RNA与蛋白质相互作用关系
- 非编码RNA曾经被认为是无用的。20世纪90年代以来,越来越多新的非编码RNA被发现,科学家们逐渐意识到非编码RNA具有重要的生物学功能。研究非编码RNA与蛋白质相互作用对于理解许多重要的细胞过程至关重要。特别地,长非编...
- 胡桓
- 关键词：蛋白质
- 文献传递
- 半监督分类学习问题在生物信息学中的研究进展——以间谍算法为例被引量：1
- 2019年
- 近年来,随着生命科学研究的不断发展,生物信息学这个利用智能算法处理生物数据的新型交叉学科越来越受到科研工作者的关注.机器学习在智能算法的研究中占据极其重要的地位,而机器学习中的半监督分类学习在生物信息学中有着广泛应用.以半监督分类学习中的间谍算法为例,首先回顾了半监督分类学习的发展历程,分析了该方法的研究现状,然后描述了间谍算法在生物信息学研究中的应用,最后总结了间谍算法的优势和局限性,并且讨论了可以改进的方向和未来的发展.
- 赵琪张越胡桓刘宏生
- 关键词：生物信息学
- 基于标准菌株的微生物系统发育研究系统
- 背景：当前使用最广泛的16S rRNA序列数据库已经收集了比较全面的微生物16S rRNA序列数据，但都缺乏对序列数据的筛选整理。数据库中存在大量非标准菌株的16S rRNA序列数据，而非标准菌株的16S rRNA序列并...
- 胡桓张力刘宏生
- 关键词：标准菌株高通量测序进化树
- 基于随机森林和特征选择方法的蛋白质热稳定性影响因素预测
- 2016年
- 酶的耐热性对其在食品工业中实现应用至关重要。本文以随机森林算法通过蛋白质序列预测酶的热稳定性,并对影响热稳定性的重要特征进行了分析。计算了从Swiss-Prot数据库获得的1600个包含热稳定性信息的酶的430个特征。采用重复欠抽样法处理数据不平衡问题,采用向后递归特征消去法优选出30个最重要的特征。通过交叉验证和独立测试比较以各特征子集构建的模型,发现仅以氨基酸组成为特征集构建的模型获得了最佳预测效果,模型的总体预测准确率为85.83%、敏感性为89.16%、特异性为73.33%、精度为77.00%、F1度量为74.87%。结果表明氨基酸组成对酶热稳定性的影响最大,嗜热酶中含有更多的谷氨酸、异亮氨酸和赖氨酸,而常温酶中含有更多的谷氨酰胺、丝氨酸和苏氨酸。研究为蛋白质工程改造食品工业用酶的热稳定性提供了一定的理论和方法。
- 张力艾海新张吉宽胡桓刘宏生马树才
- 关键词：氨基酸组成
- 基于随机游走算法预测lncRNAs与疾病关系的研究进展
- 2018年
- 近年来,lncRNAs引起了研究者的广泛关注.随着实验技术与智能计算方法的快速发展,lncRNAs已经被证明与人类的许多复杂疾病息息相关.相比一般的实验方法而言,智能算法能够更高效、更便捷的预测与疾病相关的lncRNAs,并且挑选出可能性最高的lncRNAs加以实验验证,从而提高效率增强可靠性.文章以随机游走算法为例,首先综述了lncRNAs与随机游走智能算法的相关概念及随机游走算法的应用范围与局限性,其次在预测lncRNAs与疾病关系中,通过数学模型来说明传统随机游走与改进随机游走的本质区别,最后讨论了其发展趋势.
- 赵琪梁丹胡桓张力刘宏生
- 关键词：疾病随机游走
- 推荐系统算法在生物信息学中应用的研究进展被引量：1
- 2017年
- 推荐系统算法是一种应用非常广泛的智能算法,比如对用户进行商品推荐.应用推荐系统算法,不仅节约时间,还可以节约资源.除了应用在商品推荐方面,推荐系统算法还可应用于生物信息学研究方面,比如预测长非编码RNA与疾病的关系,长非编码RNA与蛋白质的关系等.随着生物技术和医学研究的发展,越来越多的实验结果表明长非编码RNA与蛋白质的关系在疾病的发展过程中愈发重要.另一方面,生物实验研究不仅耗费很多资源,花费的时间也很多,而且准确性不一定高,所以发展节约资源且高效的智能算法是必然趋势.就以智能算法中的推荐系统算法为例,叙述长非编码RNA的概念以及推荐系统算法的概念,推荐系统算法的应用领域,优点与局限性;然后讨论推荐系统算法在生物信息学领域中的应用;接着详述如何用改进的二分投影推荐算法预测长非编码RNA-蛋白质相互作用关系;最后讨论推荐系统算法发展趋势.
- 赵琪于海帆胡桓张力刘宏生
- 关键词：蛋白质
- 深度神经网络的发展现状被引量：3
- 2017年
- 深度神经网络已经在语音、图像、文本等信息处理领域取得了巨大的成果,本文简述其起源及成果,并介绍现代深度神经网络模型的三种基本结构:序列到序列神经网络、卷积神经网络、对抗式生成网络,最后展望了深度神经网络研究领域所面临的挑战。
- 胡聪丛胡桓
- 提高创新实践能力的微生物应用技术教学改革
- 2016年
- 微生物应用技术是学校向应用技术型高校转型的重要专业课程之一,其教学与其他学科显示出明显的不同,教学改革的内容应该着重于提高学生的创新实践能力。微生物应用技术的教学体系的创新主要从教学目标、教学形式、讲授内容、考试制度等几方面进行创新,该文将对其进行详细探索。
- 艾海新蒙新睿胡桓王天琦赵健于开源刘宏生
- 关键词：微生物教学改革
- 纳豆激酶的原核表达、纯化及其特性分析（英文）被引量：2
- 2017年
- 纳豆激酶(Nattokinase)作为一种新型溶解血栓的纤维蛋白溶解酶,有着广阔的市场前景和巨大的产业化潜力。本研究从枯草芽胞杆菌(Bacillus subtilis natto)发酵液中提取、纯化纳豆激酶,依次通过硫酸铵盐析、凝胶过滤层析和疏水层析方法纯化纳豆激酶,纯化倍数为5.2,纯化率为46.3%。纯化后的纳豆激酶经SDS-PAGE电泳显示相对分子量约为28 kD a,纤维蛋白平板法显示活性为4 580 IU/mg。但纳豆激酶在枯草芽胞杆菌发酵液中的含量较低,因此在原核表达载体大肠埃希菌(Escherichia coli)BL21(DE3)中克隆并高效表达了纳豆激酶基因,其纳豆激酶产量显著提高,但酶活相对降低。
- 艾海新张力张新刚陈思瑶胡桓魏洪运蒙新睿王天琦赵健刘宏生
- 关键词：纳豆激酶纯化原核表达
