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RNA 5mC重亚硫酸盐测序的文库构建方法及其应用: 本发明涉及对RNA分子上的5‑甲基胞嘧啶(5‑methylcytosine，5mC)修饰重亚硫酸盐测序的文库构建方法、测序方法和甲基化检测方法。通过设计和使用只含有ACT的三碱基随机六聚引物，显著提高经过重亚硫酸盐处理后...; 杨运桂杨莹孙宝发杨鑫孙慧颖孙敏张兵黄春敏; 文献传递

RNA甲基化修饰调控和规律被引量：16: 2018年; 表观遗传学修饰包括DNA、RNA和蛋白质的化学修饰,基于非序列改变所致基因表达和功能水平变化。近年来,在DNA和蛋白质修饰基础上,可逆RNA甲基化修饰研究引领了第3次表观遗传学修饰研究的浪潮。RNA存在100余种化学修饰,甲基化是最主要的修饰形式。鉴定RNA甲基化修饰酶及研发其转录组水平高通量检测技术,是揭示RNA化学修饰调控基因表达和功能规律的基础。本文主要总结了近年来本课题组与合作团队及国内外同行在RNA甲基化表观转录组学研究中取得的主要前沿进展,包括发现了RNA去甲基酶、甲基转移酶和结合蛋白,揭示RNA甲基化修饰调控RNA加工代谢,及其调控正常生理和异常病理等重要生命进程。这些系列研究成果证明RNA甲基化修饰类似于DNA甲基化,具有可逆性,拓展了RNA甲基化表观转录组学研究新领域,完善了中心法则表观遗传学规律。; 杨莹杨莹孙宝发杨运桂

动态RNA甲基化修饰及其调控机制研究进展被引量：7: 2016年; RNA可以被100余种化学修饰所修饰。这些化学修饰以甲基化为主,广泛分布于各种类型的RNA中,如r RNA、t RNA、sn RNA、sno RNA和m RNA等,其中针对m RNA内部修饰丰度最高的6-甲基腺嘌呤(m^6A)的研究最为深入。m^6A修饰酶(甲基转移酶METTL3/METTL14/WTAP和去甲基化酶ALKBH5与FTO)和结合蛋白YTHDF2、YTHDF1与YTHDC1的发现,证明了RNA甲基化修饰同DNA甲基化修饰一样是动态可逆的,从而将RNA甲基化修饰由微调控机制提升到表观转录组新层次。而候选m^5C修饰甲基转移酶NSUN家族蛋白和去甲基化酶TET蛋白的初步鉴定,丰富了RNA甲基化修饰表观转录组研究内涵。RNA甲基化介导的表观转录组学调控和作用已成为RNA生物学新研究领域。现重点回顾和展望RNA的m^6A和m^5C甲基化修饰特征及其潜在生物学功能。; 孙慧颖郝亚娟平晓丽黄春敏杨莹孙宝发杨运桂; 关键词：非编码RNA 甲基转移酶

RNA修饰类型及调控蛋白被引量：2: 2018年; RNA修饰是指发生在RNA上的各种修饰形式。自然界中的RNA修饰广泛存在于A、U、C、G四类核苷酸上,此外,极少的RNA修饰发生在次黄嘌呤核苷(I)上。目前已经在古细菌、细菌、病毒和真核生物中发现超过140种的RNA转录后修饰形式。在各种类型的RNA修饰中,甲基化修饰占到了三分之二,这些修饰广泛存在于各种RNA类型中,包括信使RNA(mRNA)、转运RNA(tRNA)、核糖体RNA(rRNA)、核内小RNA(snRNA)、核仁小RNA(sno RNA)、微小RNA(miRNA)、小干扰RNA(siRNA)、piwi蛋白相互作用的RNA(piRNA)和长非编码RNA(lncRNA)等。现介绍主要的RNA修饰类型,并对其调控蛋白进行归纳总结。; 陈宇晟杨莹; 关键词：甲基转移酶结合蛋白

RNA 5mC重亚硫酸盐测序的文库构建方法及其应用: 本发明涉及对RNA分子上的5-甲基胞嘧啶(5-methylcytosine，5mC)修饰重亚硫酸盐测序的文库构建方法、测序方法和甲基化检测方法。通过设计和使用只含有ACT的三碱基随机六聚引物，显著提高经过重亚硫酸盐处理后...; 杨运桂杨莹孙宝发杨鑫孙慧颖孙敏张兵黄春敏; 文献传递

RNA 6-甲基腺嘌呤(m6A)修饰MeRIP研究技巧经验谈: MeRIP是一种研究含有甲基化修饰RNA序列的方法,其主要原理是利用甲基化修饰的特异性抗体对含有甲基化修饰的RNA序列进行富集,并通过高通量测序和结合生物信息学方法对所富集的RNA进行分析和功能注释.本MeRIP研究技巧...; 杨莹赵旭平晓丽郝亚娟杨运桂

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杨莹