张克山 作品数:26 被引量:38 H指数:3 供职机构: 重庆市畜牧科学院 更多>> 发文基金: 国家现代农业产业技术体系建设项目 重庆市自然科学基金 国家自然科学基金 更多>> 相关领域: 农业科学 医药卫生 轻工技术与工程 更多>>
全基因组关联分析筛选鹅蛋品质相关分子标记 2023年 【目的】通过筛选与鹅蛋品质性状相关的分子标记和候选基因,为解析蛋品质性状的遗传机制及分子标记辅助选择提供理论支撑。【方法】采用同批次健康四川白鹅群体(209只)作为研究对象。收集了每只鹅在产蛋高峰期连续生产的5枚蛋,并测定了蛋重、蛋形指数、蛋壳强度、蛋壳厚度、蛋壳重和蛋黄重量等6个蛋品质性状。基于前期209只四川白鹅(母鹅)2.896 Tb全基因组重测序数据(12.44×/个体),采用全基因组关联分析的方法,筛选与蛋品质性状相关的SNP位点和重要候选基因,并通过核酸飞行时间质谱方法检测了这些SNP位点的基因型频率。【结果】经过筛选过滤,共有9279339个SNPs和209个个体用于后续研究。GWAS研究发现,48个SNP位点与6个鹅蛋品质性状显著或建议性显著相关(阈值分别为5.43×10-9和1.09×10-7),并注释出27个蛋品质性状相关的候选基因,包括妊娠相关血浆蛋白A(pappalysin1,PAPPA)、蛋白丝氨酸/苏氨酸磷酸酶调节亚基2基因(serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2,PP4R2)、乙醇胺磷酸转移酶1(ethanolamine phosphotransferase 1,EPT1)和离子型谷氨酸受体K2(glutamate receptor ionotropic,kainate 2,GRIK2)等,其中候选基因PAPPA参与蛋白质代谢,促进生长因子IGF生成,在PP4R2的11bp范围内存在5个SNPs与蛋壳厚度显著相关,另外在GRIK2上有6个SNPs与蛋黄重量显著相关,GRIK2和PP4R2分别与机体血钙维持功能以及胆固醇代谢相关。功能富集研究发现,候选基因主要参与了response to growth factor(GO:0070848)、intracellular chemical homeostasis(GO:0055082)、response to hormone(GO:0009725)和regulation of the monoatomic ion transport(GO:43269)等代谢通路。【结论】经GWAS方法筛选出PAPPA、GRIK2、ASCC3和EPT1分别作为蛋重、蛋黄重、蛋壳强度等蛋品质性状潜在功能基因,为鹅蛋品质性状的改良提供了分子遗传标记的理论参考。 高广亮 张克山 张克山 许国洋 赵献芝 周莉 张昌莲 谢友慧关键词:全基因组关联分析 分子标记辅助选择 蛋品质性状 一种肉鹅配套系中母本品系选育方法 本发明公开了一种肉鹅配套系中母本品系选育方法,属于家禽选育技术领域。本发明主要针对肉鹅配套系中母本品系的选育提供了新的选择方法,采用一年一个世代、优秀种鹅利用两年的原则,每个世代组建的新家系一部分由上一世代中完成全程产蛋... 赵献芝 李静 王启贵 张克山 高广亮 莫诗勇文献传递 四川白鹅个体产蛋规律研究 被引量:8 2018年 研究对四川白鹅的个体产蛋规律进行了初步研究和分析,结果发现,统计期内母鹅平均产蛋数(12.4±7.8)个,最高个体产蛋27个,个体差异大;高产群体和低产群体的蛋重、蛋形指数差异均不显著(P>0.05);大多数母鹅在上午产蛋,产蛋数占全天产蛋数的71%;本群体母鹅平均产蛋间隔(2.35±0.51)d。经相关性分析,母鹅产蛋数与连产次数呈极显著正相关(P<0.01),与产蛋间隔呈极显著负相关(P<0.01)。研究结果可为四川白鹅的开发和利用提供基础数据。 赵献芝 高广亮 张克山 王启贵关键词:产蛋规律 产蛋数 家禽胚蛋雌雄鉴别方法的研究进展 2023年 雌雄鉴别方法可以提前筛选特定性别的家禽,降低饲养成本,提高养殖效益,在家禽养殖业中具有重要作用。本文概述了当前几种鉴别家禽胚蛋雌雄的方法,为下一步研究和优化鹅胚蛋雌雄鉴别方法提供理论依据和参考。 钟航 张克山 罗艺 黄晓凤 汪超关键词:家禽 胚蛋 鹅胚 雌雄鉴别 不同剩余采食量渝州白鹅生长性能、屠宰性能及肉品质的比较研究 2024年 本试验旨在比较不同剩余采食量(RFI)渝州白鹅在生长性能、屠宰性能和肉品质方面的差异以及RFI与上述性状之间的关系。选用236只渝州白鹅Ⅲ系公鹅进行单笼个体饲养,试验鹅3周龄末上笼至10周龄末结束,试验期50 d。分别测定试验鹅3、4、6、8、10周龄末的加料量、剩料量和体重,获得各阶段的平均日增重(ADG)、平均日采食量(ADFI)、饲料转化比(FCR)和RFI。试验鹅在10周龄末屠宰后进行屠宰性能和肉品质测定。依据3~10周龄RFI数据,筛选出38只RFI最低、38只RFI最高和115只RFI居中的试验鹅分别作为低RFI组(L-RFI组)、高RFI组(H-RFI)和中RFI组(M-RFI组,作为对照),对3组试验鹅的生长性能、屠宰性能和肉品质性状进行分析。结果显示:不同RFI对试验鹅3~4周龄、4~6周龄、3~10周龄FCR以及各阶段ADFI有显著或极显著影响(P<0.05或P<0.01),且均以L-RFI组最低。不同RFI组各阶段体重和ADG无显著差异(P>0.05)。RFI与FCR、ADFI普遍存在显著正相关(P<0.05),与体重、ADG基本无相关性(P>0.05)。L-RFI组皮脂率、腹脂率极显著低于M-RFI组和H-RFI组(P<0.01),皮脂厚极显著低于H-RFI组(P<0.01),全净膛率、翅膀率、脚率显著或极显著高于H-RFI组(P<0.05或P<0.01),腿比率、腿肌率极显著高于M-RFI组和H-RFI组(P<0.01)。RFI与上述脂肪沉积性状呈显著正相关(P<0.05),与上述主要屠宰性能性状呈不同程度的负相关。不同RFI组肌肉pH、蒸煮损失和剪切力差异不显著(P>0.05),RFI与肉品质性状间基本不相关(P>0.05)。上述结果表明,RFI对渝州白鹅体重、增重和肉品质无显著影响;与M-RFI组和H-RFI组相比,L-RFI组渝州白鹅的饲料效率更高、屠宰性能更优、脂肪沉积更少。这提示,对RFI性状的负向选择有望提高肉鹅的饲料效率和屠宰性能且不会影响体重和增重,不会引起肉品质性状的改变。 李琴 王郁石 赵献芝 赵献芝 王丽辉 陈主平 谢友慧 王丽辉 王启贵关键词:饲料效率 屠宰性能 肉品质 一种检测鹅种蛋合格率的分子标记方法 本发明涉及SNP分子标记技术领域,提供一种检测鹅种蛋合格率的分子标记方法,包括通过比对全基因组重测序数据到鹅参考基因组序列获得全基因组SNP位点,通过全基因组关联分析的方法获得鹅种蛋合格率性状的7个候选SNP分子标记;利... 高广亮 赵献芝 王誉杰 王丽辉 吴睿 张克山 王海威 王启贵 卢茵 谢友慧 王珍 李静 尹春辉 汪超文献传递 卵母细胞发育过程中的质量控制机制研究进展 2016年 物种种群的遗传稳定与其生殖细胞质量的精准选择密切相关。细胞凋亡是机体清除体内多余或受损细胞的重要途径,卵母细胞适当的凋亡对于确保物种的生殖质量,维持遗传资源的稳定性有着重要作用,而卵母细胞在不同时期的质量控制是一个复杂过程,受多种调控因子与调控元件的控制。对卵母细胞发育过程中的几个重要时期,精准调控卵母细胞质量的分子机理作了一些梳理和总结。 张克山 谢友慧 粟剑 王启贵关键词:卵母细胞 GnRH基因SNPs与鹅体组成和蛋品质性状的关联分析 2020年 本实验旨在研究GnRH基因SNP位点对鹅体组成和蛋品质性状的影响,选择208只四川白鹅(母鹅),采用直接测序法检测SNP和个体基因型,并利用滑动窗口构建单倍型;分别将SNP和单倍型与体组成和蛋品质性状进行关联分析。结果表明:共获得46个SNP位点并构建44个滑动窗口;GnRH基因的SNP位点与鹅初生重、体斜长、胫长、龙骨长、胫围、蛋壳强度、蛋壳重和蛋壳厚度等性状显著或极显著相关(P<0.05或P<0.01),而与半潜水长、骨盆宽、胫围、蛋形指数、蛋比重、蛋黄颜色和蛋黄重等蛋品质性状无显著相关。可见,GnRH基因的SNP位点可作为鹅初生重、体斜长、胫长、龙骨长、胫围、蛋壳强度、蛋壳重和蛋壳厚度等性状的分子标记之一。 霍子东 高广亮 张克山 张克山 赵献芝关键词:SNPS 体组成 蛋品质 分子标记辅助选择 渝州白鹅剩余采食量测定及其与饲料利用效率相关性状的相关分析 被引量:1 2022年 本试验旨在研究肉鹅剩余采食量(RFI)及其与体重(BW)、采食量(FI)、平均日增重(ADG)、饲料转化率(FCR)的关系。采用单笼饲养方法,在饲粮代谢能水平为12.13 MJ/kg、粗蛋白质含量为17.25%的营养水平下,测定240只渝州白鹅Ⅲ系公鹅3、4、6、8、10周龄的FI和BW,获得了3~4周龄、4~6周龄、6~8周龄、8~10周龄、3~6周龄、4~8周龄、3~8周龄、3~10周龄试验鹅的RFI、FI、ADG、FCR及各性状间的相关系数。结果显示:在各测定阶段,试验鹅RFI变异大,其中4~8周龄RFI最高为2157.02 g,最低为-2482.46 g,3~8周龄RFI最高为2675.55 g,最低为-2476.00 g,3~10周龄RFI最高为1845.27 g,最低为-2488.97 g,表明RFI的选择空间大;试验鹅各阶段RFI与FI几乎均呈正相关,其中3~10周龄RFI与FI的相关系数为0.689(P<0.01),提示RFI的选择可影响FI;试验鹅各阶段RFI与FCR呈正相关,其中3~6周龄、4~8周龄、3~8周龄、3~10周龄试验鹅RFI与FCR间的相关系数分别为0.701、0.604、0.651和0.572(P<0.01),表明RFI可以有效反映鹅的饲料利用效率;4~8周龄、3~8周龄试验鹅RFI与全期(3~10周龄)FCR的相关系数分别为0.422、0.525(P<0.01),表明4~8周龄、3~8周龄试验鹅RFI能够较好反映全期的FCR。试验鹅各阶段RFI与BW、ADG不存在显著相关(P>0.05)或存在较低的显著或极显著负相关(P<0.05或P<0.01),表明RFI的选择基本不受BW或ADG的影响。由此得出,在饲粮代谢能水平为12.13 MJ/kg、粗蛋白质含量为17.25%的营养水平下,各阶段试验鹅RFI变异大,与FI、FCR呈正相关,与BW、ADG不存在显著相关或存在较低的负相关,对RFI进行选择可影响FI而不影响BW或增重,可有效改善渝州白鹅的饲料利用效率。 李琴 赵献芝 赵献芝 张克山 王丽辉 李静 张克山关键词:肉鹅 饲料利用效率 GnIH基因多态性与鹅产蛋和体组成性状的关联分析 被引量:3 2021年 为研究促性腺激素抑制激素基因(GnIH)的系列特征,以及其SNP多态性位点对四川白鹅产蛋和体组成等性状的影响,克隆了GnIH基因DNA序列,并与哺乳动物和其他禽类进行生物信息学分析;该基因DNA序列比对到鹅参考基因组序列筛选SNP位点,随后采用Sanger方法直接测序PCR产物的方法,检测四川白鹅群体(208个体)中该基因序列,该序列包含3个外显子和2个内含子,CDS区长522 bp,173个氨基酸的前体蛋白GnIH氨基酸序。通过多重比对分析后,统计该基因在四川白鹅群体中SNP位点的基因型及其频率,进而与鹅产蛋和体组成等11个重要经济性状进行关联分析。获得了3735 bp的GnIH基因DNA序列,遗传进化分析显示,四川白鹅GnIH基因与绿头鸭的序列相似度最高(99%);序列比对到鹅参考基因组序列发现该基存在26个SNP位点;SNP位点基因型频率与性状关联分析结果表明:该基因11个SNP位点(g.811T>C、g.1892T>C、g.1320G>A、g.1809G>T、g.2164C>G、g.1708A>G、g.2164C>G、g.1809G>T、g.1892T>C、g.1929C>A和g.2164C>G)与初产蛋质量、体斜长、颈长、胸宽和胫围等性状显著或极显著相关(P<0.05或P<0.01),所有SNP位点而与48周产蛋数、64周产蛋数、出生质量、半潜水长、龙骨长、骨盆宽等无显著相关(P>0.05)。四川白鹅GnIH基因序列与绿头鸭亲缘关系最相近;本研究克隆的3735 bp的DNA序列中存在26个SNP位点,其中11个SNP位点可作为四川白鹅初产蛋质量、体斜长、颈长、胸宽和胫围等经济性状的潜在的分子标记之一。 高广亮 张克山 张克山 赵献芝 陈主平 赵献芝 王启贵关键词:SNPS 产蛋性状 体组成性状 分子标记辅助选择