高英
- 作品数:4 被引量:5H指数:1
- 供职机构:西北农林科技大学农学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:农业科学文化科学医药卫生更多>>
- 野生二粒小麦NBS-LRR类抗病基因家族的鉴定及其表达分析被引量:3
- 2021年
- 野生二粒小麦(Triticum dicoccoides L,2n=4x=28,AABB)是普通小麦遗传改良的重要种质和基因库。抗病基因(resistance gene,R基因)是植物体内广泛存在的抗性基因,通常具有NBS(nucleotide-binding site)和LRR(leucine-rich-repeat)结构域,属于NBS-LRR家族,在植物抗病和免疫过程中具有重要作用。为挖掘和利用野生二粒小麦基因组中的R基因,基于最新发布的野生二粒小麦参考基因组数据,利用生物信息分析手段,在全基因组水平上对其NBS-LRR类R基因家族进行鉴定。结果共鉴定到429个可信度较高的NBS-LRR类R基因,其中N亚家族66个,CNL亚家族205个,NL亚家族76个,CN亚家族79个,PN亚家族3个;进一步对NL亚家族R基因进行分析,发现76个NL亚家族基因在所有染色体上均有分布,并且以成簇方式存在,包含20个保守域,且在N端高度保守;表达模式分析发现,它们在花、叶片和根中的表达量较高;最后,随机选择4个NL类R基因,发现在白粉菌诱导后均上调表达。本研究为进一步挖掘和利用野生二粒小麦NBS-LRR类抗病基因奠定了基础。
- 李爽高英杨光聂小军宋卫宁
- 关键词:野生二粒小麦抗病性
- 野生二粒小麦YABBY转录因子家族的鉴定与表达分析被引量:1
- 2023年
- YABBY基因是植物所特有的一类转录因子家族,在植物器官形成、生长发育、信号转导以及胁迫响应等生物学过程发挥着重要调控作用。野生二粒小麦(Triticum dicoccoides)作为普通小麦的四倍体祖先种,一直是小麦遗传改良的重要种质和基因库,但目前有关野生二粒小麦的YABBY基因还未见报道。为了挖掘野生二粒小麦的YABBY基因,本研究利用生物信息学方法对野生二粒小麦YABBY转录因子家族进行了全基因组鉴定和分析,结果在野生二粒小麦基因组中共鉴定到了12个YABBY基因,归属于6个同源基因对且位于5个同源染色体组上。系统进化分析将它们分成YAB1/3、YAB5和CRC 3个亚家族,而且同一亚家族成员间具有相似的结构特征。基于RNA-seq数据的表达特性分析发现,YABBY在野生二粒小麦不同组织中具有特异性表达;同时,还鉴定发现了3个YAB5亚族成员在盐胁迫下发生了差异表达,进一步的qPCR分析验证了它们的表达特性,表明它们可能是盐胁迫响应相关的YABBY转录因子。
- 高英杨光张瑞浦潘文秋聂小军
- 关键词:转录因子野生二粒小麦
- 小麦m6A甲基转移酶关键基因TaMTA的克隆及其表达特性分析
- N6-甲基腺嘌呤(m6A)是发生在腺嘌呤碱基第六位氮原子上的甲基化修饰形式,是mRNA上最重要的修饰类型之一,在基因表达调控中发挥重要调控作用并参与植物的生长发育、非生物胁迫应答等生物学调控过程.m6A由甲基转移酶复合物...
- 潘文秋张若雨高英聂小军
- 关键词:小麦MTA非生物胁迫