廖映辉
- 作品数：4 被引量：19H指数：3
- 供职机构：海南大学园艺园林学院更多>>
- 发文基金：海南省自然科学基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 广西大明山变色杜鹃根部真菌检测
- 2016年
- 采集广西大明山的变色杜鹃,用分子检测技术对其根部真菌的r DNA-ITS序列进行扩增、克隆、测序,以及序列分析,共检测到6种真菌,包括子囊菌门(Ascomycota)5种。6种真菌分别为:锤舌菌纲(Leotiomycetes)1种、粪壳菌纲(Sordariomycetes)2种、座囊菌纲(Dothideomycetes)1种和1种未知的子囊菌;担子菌门(Basidiomycota)1种,为伞菌纲(Agaricomycetes)的蜡壳耳目(Sebacinales)。Dothideomycetes sp.和Sebacinaceae sp.的多度较高,分别占所有序列的33%和22%。6种真菌OTU的NCBI序列号为KX022391-KX022396。该研究揭示自然生境中杜鹃花根部真菌物种组成,为进一步筛选适合野生杜鹃引种、栽培的高效优质共生菌株提供物种信息,对杜鹃花引种栽培中共生真菌的应用有理论与实践意义。
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- 关键词：谱系ITS区杜鹃花属
- 凉山州龙肘山锈红杜鹃与薄叶马银花根部真菌分子检测被引量：10
- 2017年
- 【目的】为检验直接分子检测法用于揭示杜鹃花属(Rhododendron)植物根部真菌(Root-associated fungi,RAF)组成的有效性。【方法】采用不依赖于培养的分子检测技术直接从锈红杜鹃(R.bureavii)与薄叶马银花(R.leptothrium)的发根(Hair root)提取DNA,用真菌特异性引物扩增r DNA-ITS区、经克隆后测序,对获得的ITS序列进行分析;通过收集NCBI中与本研究的RAF相似性97%以上的所有序列对应的真菌来源(土壤或根系的身份)数据,分析真菌的生态学特性,并用FUNGuild软件提供的方法划分真菌的生态类型。【结果】从两种杜鹃花根部共检测到15种真菌,其中担子菌门(Basdiomycota)真菌3种,子囊菌门(Ascomycota)真菌12种。柔膜菌目(Helotiales)真菌在两种杜鹃花RAF群落中占据优势,并且在两种杜鹃花根系中均检测到该类真菌。此外,两种杜鹃花根部有多种生态类型的RAF共存,包括曾被频繁报道的杜鹃花类菌根菌Oidiodendron sp.和Rhizoscyphus sp.、内生真菌Phialocephala fortinii、共生一致病过渡型真菌Pezoloma ericae、外生菌根共生菌Meliniomyces sp.,以及腐生型真菌Myceana sp.、Lachnum virgineum、Herpotrichia sp.。【结论】直接分子检测法从两种杜鹃花属植物根部检测到的真菌谱系多样性较高、生态类型复杂,这一方法能较为全面地反映杜鹃花属植物RAF多样性。
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- 关键词：杜鹃花属
- 海南霸王岭毛棉杜鹃根部真菌的多样性被引量：5
- 2016年
- 以生长于海南岛霸王岭的毛棉杜鹃(Rhododendron moulmainense)为材料,用分子检测技术对其根部真菌的r DNA-ITS序列进行扩增、克隆、测序,以及序列分析,共检测出28种真菌,其中子囊菌门(Ascomycota)19种,担子菌门(Basidiomycota)8种,接合菌门(Zygomycota)1种,其中物种最丰富的真菌类群为子囊菌门锤舌菌纲的柔膜菌目。采用Bootstrap法估算真菌的物种丰富度,表明霸王岭地区毛棉杜鹃的根系真菌至少有37种,并且物种累积曲线显示:随着根系真菌的宿主植物个体数增加,Shannon-weiner多样性指数和物种丰富度增大,且物种数增加的潜力仍然较大。研究结果表明,毛棉杜鹃根部真菌种类极丰富,有必要全面开展杜鹃花属植物根部真菌分子检测,并从中筛选出对杜鹃花属植物生长有良好效应的真菌。全面揭示杜鹃花属植物的根部共生真菌多样性必将有助于杜鹃花属植物的保育与引种栽培。
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- 关键词：杜鹃花属菌根多样性
- 两种混合样品策略对揭示杜鹃花根部真菌多样性的影响被引量：4
- 2017年
- 由于土壤微生物群落物种组成的高度空间异质性,混合样品(sample pooling)被广泛应用于微生物多样性与群落结构研究。在根部真菌的分子检测中,样品混合策略以及测序的克隆数或序列数均对揭示真菌群落结构的准确性有影响。【目的】为建立一套能快速准确地反映杜鹃花属植物根部真菌的物种组成与群落结构的分子检测技术平台,【方法】本研究采集锈红杜鹃和亮鳞杜鹃多份根系样品分别提取DNA,比较PCR扩增前和扩增后混合策略构建的克隆文库中真菌物种组成的差异。【结果】在2种宿主植物根系中,多份样品在PCR扩增后混合构建的克隆文库检测到的根部真菌物种丰富度、真菌群落的Shannon-Wiener多样性指数均高于扩增前混合的克隆文库。高频度的根部真菌在2种克隆文库中均检测到,但低频度的真菌物种组成在2种克隆文库中完全不同。更重要的是,当采用广泛应用的真菌通用引物ITS1f和ITS4扩增根部真菌ITS序列时,PCR扩增后混合的方法能有效地减轻杜鹃花属植物ITS序列被优先扩增的现象。真菌物种累积曲线显示,当测序的真菌ITS片段克隆数达到50个左右,即能较全面地反映2种杜鹃花根部真菌物种组成。【结论】独立扩增多份根系样品DNA,再将PCR产物混合构建克隆文库的方法能更全面地揭示杜鹃花属植物根部真菌物种丰富度与物种组成。
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- 关键词：杜鹃花分子检测物种多样性
