廖凤
- 作品数：5 被引量：20H指数：2
- 供职机构：云南省第一人民医院更多>>
- 发文基金：国家科技重大专项更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- 云南省四株霍乱弧菌全基因组测序分析
- 2016年
- 目的选取云南省具有代表性的霍乱弧菌四株,进行了全基因组测序分析,为云南省霍乱弧菌的基因组学研究提供资料。方法根据对云南省历年霍乱菌株资料的分析,结合菌株特征和脉冲场凝胶电泳带型特点等,选取了四株代表性霍乱弧菌,采用WGS Illumina Hi Seq2500进行paired-end测序。对测序结果进行拼接、组装以及注释等。结果基因预测和功能注释结果显示,所有四株霍乱弧菌(YN2011004、YN98296、YN97083和YN89004)均显示携带有2个染色体,同时YN2011004,YN98296和YN89004各自携带有一个质粒。YN2011004的1号染色体具有2 727个基因,2号染色体具有958个基因;YN98296 1号染色体具有2 825个基因,2号染色体具有969个基因;YN97083 1号染色体具有1 948个基因,2号染色体具有955个基因;YN89004 1号染色体具有2 653个基因,2号染色体具有907个基因。所有预测的基因功能主要涉及细菌生理代谢、信号储存和处理以及信号转导等各个方面。结论云南省的四株代表性霍乱菌株均具有两个染色体,其中三个菌株还各自含有1个质粒。
- 廖凤尹杰尹建雯周永明徐闻伏晓庆赵世文古文鹏
- 关键词：霍乱弧菌全基因组序列
- 咔哒唑胺与利奈唑胺对艰难梭菌的敏感性实验被引量：2
- 2017年
- 目的比较咔哒唑胺与利奈唑胺对不同基因和毒素型别的艰难梭菌的抑菌效果,以及咔哒唑胺对艰难梭菌芽孢形成的影响。方法采用咔哒唑胺与利奈唑胺对10株不同基因型别的艰难梭菌、1株产气荚膜梭菌和1株脆弱拟杆菌进行药物敏感性实验,获得各菌株测试药物对应的最低抑菌浓度(MIC)值。选取其中1株艰难梭菌ATCC BAA-1803,核糖体027型高毒株,试验咔哒唑胺对菌株芽孢形成的影响,从而对药物进行评价。结果艰难梭菌咔哒唑胺MIC为0.25μg/ml(0.03~0.25μg/ml),利奈唑胺MIC为4.0μg/ml(0.5~16.0μg/ml),艰难梭菌咔哒唑胺MIC值低于利奈唑胺16倍。2种抗生素对不同基因型别与毒素型别的艰难梭菌均具有良好抑菌效果,同时对产气荚膜梭菌也具有抑菌效果。咔哒唑胺对脆弱拟杆菌不产生抑菌效果,利奈唑胺对其有抑菌效果。咔哒唑胺能抑制艰难梭菌芽孢形成。结论临床常见的不同基因型和毒素型别的艰难梭菌对咔哒唑胺敏感,咔哒唑胺可用于治疗艰难梭菌感染。
- 刘笑舒廖凤于栓宝李文革陈小萍吴媛卢金星
- 关键词：艰难梭菌利奈唑胺药敏芽孢
- 云南省非O1/O139群霍乱弧菌分子特征分析被引量：12
- 2017年
- 目的非O1/O139群霍乱弧菌能够引起人类急性腹泻性疾病,但与O1群和O139群相比,人们往往容易忽视其危害性。因此,我们对分离于云南省的31株非O1/O139群霍乱弧菌开展了分子特征分析。方法采用纸片法(K-B)开展抗生素敏感试验;多聚酶链反应(PCR)扩增检测毒力基因;同时,我们对菌株进行了脉冲场凝胶电泳(PFGE)和多位点序列分析(MLST)分子分型研究。结果药敏实验结果显示,67.74%的菌株对利福平耐药,对萘啶酸和复方新诺明的耐药率为29.03%,所有的菌株对庆大霉素和环丙沙星敏感;PCR结果显示,所有菌株的ompW基因为阳性,87.10%的菌株hly基因为阳性,25.81%的菌株rstREl tor为阳性,16.13%的菌株rstRClassical和tcpAEl tor为阳性,而CT、rfbO1和rfbO139基因全为阴性;PFGE结果显示,31株非O1/O139群霍乱弧菌呈现出高度的离散趋势,几乎没有相同带型的菌株出现;在MLST结果分析中,发现了1个gyrB新的等位基因,mdh基因发现了4个新的等位基因,metE基因发现了6个新的等位基因,pntA中发现了2个新的等位基因,purM中发现了3个新等位基因,pyrC中发现了4个新等位基因。经过排列组合后,共发现了17个新的霍乱弧菌ST型别(ST273-ST289)。结论非O1/O139群霍乱弧菌呈现出高度的多样性特征,同时,云南省的非O1/O139群霍乱弧菌具有一定的地域特点,丰富了现有的霍乱弧菌分子分型数据库。
- 廖凤古文鹏徐闻伏晓庆
- 关键词：脉冲场凝胶电泳
- 艰难梭菌五种实验室检测方法的评价被引量：4
- 2017年
- 目的比较5种艰难梭菌检测方法并进行评价。方法包括tcdB基因PCR检测、tcdB基因Real-time PCR检测、酶联免疫法、酶联免疫层析法以及环丝氨酸-头孢西丁-果糖琼脂(CCFA)常规培养法。以CCFA培养的检测结果作为参考,对以上几种方法进行评价。结果得到上述检测方法的敏感度、特异度、阳性预测值和阴性预测值结果以及其与参考方法的Kappa值。在125例样本中,CCFA培养法检出阳性标本11份,tcdB基因普通PCR检测、tcdB基因Real-time PCR检测、酶联免疫法、酶联免疫层析法分别检出阳性12、12、50和25例,4种方法间检出阳性率差异有统计学意义(χ~2=61.452,P<0.000 1),敏感度分别为63.64%、63.64%、63.64%和54.55%,差异无统计学意义(χ~2=0.288,P=0.962);特异度为95.61%、95.61%、62.28%和83.33%,差异有统计学意义(χ~2=63.597,P<0.000 1)。结论 PCR方法敏感度、特异度最高,成本较低,适用于有实验条件的流行病学调查和临床诊断,两种免疫方法试剂盒适用于临床先期筛查以及辅助诊断。
- 刘笑舒廖凤李文革古文鹏张文竹陈小萍吴媛卢金星
- 关键词：艰难梭菌敏感度特异度
- 红嘴鸥中分离的非伤寒沙门菌分子特征分析被引量：2
- 2016年
- 目的非伤寒沙门菌是一类肠道病原体,能引起人的腹泻性疾病。特从每年飞抵云南省昆明市的红嘴鸥中分离的非伤寒沙门菌,作分子分型研究,以反映红嘴鸥对于人群健康的潜在影响。方法从2013年11月-2014年1月间,分3次分别采集500份红嘴鸥粪便样本,进行沙门菌的分离培养。得到菌株之后开展药敏试验和脉冲场凝胶电泳(PFGE)分析。结果500份粪便样品分离到78株非伤寒沙门菌,其中鼠伤寒沙门菌75株(96.15%),韦尔克斯沙门菌1株,印第安纳沙门菌2株。药敏试验显示,所有非伤寒沙门菌对于利福平的耐药率高达97.44%,其次为萘啶酸(28.21%)和复方新诺明(25.64%);而对庆大霉素和环丙沙星则完全敏感。PFGE结果显示,75株鼠伤寒沙门菌形成了3个带型,并且带型之间的同源性关系均大于95%,66株表现为完全一致的带型特征。与分离自病人的鼠伤寒沙门菌比较后发现,红嘴鸥中分离的鼠伤寒沙门菌与病人分离的菌株的PFGE带型被区分成了两个聚类群。结论红嘴鸥有很高的非伤寒沙门菌携带率,以鼠伤寒沙门菌为主;PFGE结果表明,红嘴鸥携带的非伤寒沙门菌可能与其生活环境和食物构成等因素密切相关,但尚未发现这些菌株与人群患病的相关性。
- 廖凤梁俊容肖玉春段然王鑫景怀琦古文鹏
- 关键词：红嘴鸥非伤寒沙门菌脉冲场凝胶电泳
