宋林林
- 作品数：5 被引量：6H指数：1
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- 发文基金：国家科技支撑计划国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 水稻泛素结合酶基因家族的生物信息学与表达分析被引量：5
- 2016年
- 泛素/蛋白酶体系统在植物的生长发育、形态建成和抗病反应等过程中起着重要的作用。近年的研究表明,某些病原菌能够模拟寄主植物泛素/蛋白酶体系统组分,从而达到利用该系统为病原菌服务的目的。泛素结合酶是泛素化反应过程中的第二个酶,对植物泛素/蛋白酶体系统的正常运行不可或缺。已有的研究表明,水稻基因组数据库中存在48个预测的泛素结合酶基因。为了初步揭示这些泛素结合酶基因在植物抗病防御反应中的功能,研究其与植物抗病性的关系。本研究通过生物信息学、RNA-seq和qRT-PCR的方法,分析了水稻泛素结合酶基因家族的特征及其表达模式。系统进化树分析表明,48个水稻泛素结合酶基因可分为3个大组,总共7个亚组。蛋白结构域分析表明,水稻泛素结合酶基因主要由一个泛素结合酶催化结构域组成。电子表达谱分析表明,大多数水稻泛素结合酶基因能被稻瘟病菌诱导表达。启动子区顺式作用元件分析表明,4个抗病相关顺式作用元件和1个过敏性反应相关顺式作用元件在48个水稻泛素结合酶基因的启动子区有很高的分布。稻瘟病菌接种亲和性和非亲和性水稻单基因系的RNA-seq结果表明,处理36h读取到的水稻泛素结合酶基因为44个,其中高表达基因数量超过读取到的泛素结合酶基因总数的50%。qRT-PCR分析结果表明稻瘟病菌的侵染在亲和和非亲和组合中都能诱导部分水稻泛素结合酶基因的表达。在非亲和组合中水稻泛素结合酶基因的表达倾向于受到抑制。
- 刘鑫张恒阚虎飞周立帅黄昊宋林林翟焕趁张君鲁国东
- 关键词：水稻泛素结合酶生物信息学稻瘟病菌RNA-SEQQRT-PCR
- 稻瘟病菌MoRho2基因功能初步分析被引量：1
- 2016年
- 稻瘟病菌(Magnaporthe oryzae)是研究病原真菌生长发育及致病机理的重要模式生物。Rho家族蛋白是一类具有GTP酶活性的GTP结合蛋白,在多种细胞信号转导通路中起着分子开关的作用。通过生物信息学方法分析Mo Rho2的理化性质、蛋白结构域等信息,并推测其潜在功能。为进一步明确Mo Rho2蛋白的功能,利用基因敲除技术获得Mo Rho2基因的敲除突变体。表型分析结果表明,与野生型菌株相比,Mo Rho2敲除突变体的菌丝生长速度、分生孢子形态、附着胞形态、产孢量、对植物的毒力等方面均无明显的差异,但分生孢子萌发和附着胞形成略滞后于野生型菌株。突变体能够产生正常的侵入栓并侵入洋葱表皮。综上所述,Mo Rho2基因可能参与稻瘟病菌分生孢子的萌发和附着胞的形成,结果为进一步揭示基因Mo Rho2的生物学功能奠定基础。
- 杨帆宋林林谢序泽赵臻周立帅叶文雨鲁国东
- 关键词：稻瘟病菌基因敲除功能分析
- 水稻凝集素蛋白OsMBL1互作蛋白的筛选及其功能初探
- 凝集素在植物抗病虫过程中起重要的作用,本实验室在前期研究中发现了一个参与调控水稻PTI免疫反应的凝集素蛋白OsMBL1。基于此,本研究利用酵母双杂交技术在水稻中筛选出了 OsMBL1的互作蛋白OsGDSL1和OsPIP5...
- 宋林林
- 关键词：水稻
- 文献传递
- 水稻基因OsGDSL1及其抗稻瘟病的应用
- 本发明提供了一种水稻基因OsGDSL1及其抗稻瘟病的应用，该基因的开放阅读框长1119bp，编码一种类GDSL脂肪酶，由372个氨基酸组成。本发明通过构建水稻过表达载体pCXUN‑HA‑OsGDSL1，借助农杆菌介导水稻...
- 鲁国东宋林林韩艺娟林娅红王宗华
- 水稻基因OsGDSL1及其抗稻瘟病的应用
- 本发明提供了一种水稻基因OsGDSL1及其抗稻瘟病的应用，该基因的开放阅读框长1119bp，编码一种类GDSL脂肪酶，由372个氨基酸组成。本发明通过构建水稻过表达载体pCXUN‑HA‑OsGDSL1，借助农杆菌介导水稻...
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