目的基于网络药理学方法探讨行气活血通络方治疗神经根型颈椎病的作用机制。方法通过TCMSP(中药系统药理学数据库分析平台)、BATMAN-TCM(中药分子机制的生物信息学分析工具)数据库,对行气活血通络方所含活性成分进行筛选并预测作用靶点,利用GeneCards、OMIM(在线人类孟德尔遗传)和DisGeNET(疾病相关的基因与突变位点数据库)数据库检索神经根型颈椎病相关基因,利用韦恩图筛选行气活血通络方中活性成分治疗神经根型颈椎病的作用靶点。利用Cytoscape软件构建活性成分-作用靶点网络图,利用STRING数据库绘制蛋白互作网络。最后,利用Metascape数据库对靶点进行GO(基因本体)及KEGG(基因组百科全书)通路分析。结果行气活血通络方所含11味中药共筛选出93种活性成分,涉及250个靶点基因,其中有213个基因与神经根型颈椎病相关。网络分析结果表明,此方治疗神经根型颈椎病涉及的生物学过程主要包括毒性反应、无机物反应、细胞对氮化合物的反应等;涉及的分子功能主要包括神经递质受体的活性、激酶结合、G蛋白偶联胺受体活性等。其作用机制可能与AGE-RAGE signaling pathway in diabetic complications(糖尿病并发症晚期糖基化终末产物与其受体信号通路)、TNF(肿瘤坏死因子)、neuroactive ligand-receptor interaction(神经活性配体-受体相互作用)、HTLV-I infection(人T细胞白血病病毒I型感染)、MAPK(丝裂原活化蛋白激酶)、cAMP(环磷酸腺苷)、NF-κB(核因子-κB)、Amoebiasis(阿米巴病)、Platinum drug resistance(铂耐药性)、Pathways in cancer(癌症通路)等信号通路有关。结论本研究体现了行气活血通络方多成分、多靶点、多通路的作用特点,为进一步开展此方治疗神经根型颈椎病作用机制的研究提供了新思路和新方法。
目的:利用网络药理学方法从整体观念探讨中药复方伸膝汤治疗膝关节骨性关节炎(Knee Osteoarthritis,KOA)的作用机制。方法:通过BATMAN-TCM数据库,对伸膝汤所含活性成分进行筛选并预测作用靶点,利用GeneCards、OMIM和CTD数据库检索KOA相关基因,利用韦恩图筛选伸膝汤中活性成分治疗KOA的作用靶点。利用Cytoscape软件构建活性成分-作用靶点网络图。利用String数据库绘制伸膝汤蛋白互作网络,分析计算出最重要的5个蛋白。利用Metascape数据库对靶点进行基因本体(Gene Ontology,GO)及京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析。结果:伸膝汤所含8味中药共筛选出184种活性成分,涉及1491个靶点基因,其中有710个基因与KOA相关。网络分析结果表明,伸膝汤治疗KOA涉及的生物学过程主要包括毒性反应、细胞外刺激反应、激素水平调节等;涉及的分子功能主要包括辅因子结合、羧酸结合、维生素结合等。其作用机制可能与HIF-1信号通路、PI3K-AKT信号通路、cAMP信号通路、钙离子信号通路、TNF信号通路、碳代谢、凋亡、流体剪切应力与动脉粥样硬化、非酒精性脂肪肝等信号通路有关。结论:本研究初步揭示了伸膝汤多靶点整体调节KOA的作用特点,为进一步开展此方治疗KOA作用机制的研究提供了新的思路和方法。
