目的:通过荟萃分析,评价亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)基因C677T和A1298C多态性与甲氨蝶呤(MTX)治疗儿童急性淋巴细胞白血病(ALL)毒副反应的相关性。方法:检索维普科技期刊数据库、万方数据-数字化期刊群、中国期刊全文数据库(中国知网)、PubMed及Cochrane library,收集建库至2017年3月的相关文献。纳入研究依据STREGA原则进行质量评价,应用RevMan 5.0软件进行荟萃分析。结果:纳入13项研究,与C677T基因相关的文献13篇,共1001例患者;与A1298C基因相关的文献8篇,共712例患者。荟萃分析结果显示,MTHFR C677T基因多态性的总体毒性(TT vs CC+CT:RR=1.19,95%CI 1.01~1.92,P=0.04)、骨髓抑制(TT vs CC:RR=1.59,95%CI 1.13~2.25,P=0.008;TT vs CC+CT:RR=1.41,95%CI 1.09~1.81,P=0.009)、血红蛋白减少症(TT vs CC:RR=1.47,95%CI 1.02~2.10,P=0.04;TT vs CC+CT:RR=1.52,95%CI 1.1~2.09,P=0.01)差异有统计学意义。MTHFR A1298C基因多态性的总体毒性(AC vs AA:RR=1.73,95%CI 1.08~2.77,P=0.02;AC+CC vs AA:RR=1.83,95%CI 1.15~2.90,P=0.01)、黏膜炎(AC vs AA:RR=1.71,95%CI 1.24~2.37,P=0.001;CC+AC vs AA:RR=1.51,95%CI 1.09~2.08,P=0.01)差异有统计学意义。结论:MTHFR C677T与A1298C的基因多态性与MTX的毒副作用有关。MTHFR 677位点携带TT基因型的儿童使用高剂量MTX发生骨髓抑制和血红蛋白减少症的风险高于野生基因型儿童,MTHFR 1298位点携带AC基因型的儿童使用高剂量MTX发生黏膜炎的风险高于野生基因型儿童。