郑璐
- 作品数：5 被引量：4H指数：1
- 供职机构：中国科学院南京土壤研究所土壤与农业可持续发展国家重点实验室更多>>
- 发文基金：国家重点基础研究发展计划国家重点实验室开放基金江苏省普通高校研究生科研创新计划项目更多>>
- 相关领域：生物学轻工技术与工程农业科学化学工程更多>>
- 植物非组蛋白赖氨酸乙酰化修饰的蛋白质组学研究进展被引量：2
- 2021年
- 蛋白质赖氨酸乙酰化是植物中普遍存在的重要蛋白质翻译后修饰过程。过去的研究主要集中在染色体组蛋白的乙酰化修饰及其调控机制。目前,随着定量乙酰化蛋白质组学技术的发展,大量非组蛋白赖氨酸乙酰化修饰被发现,其在植物中存在的普遍性及其生理功能的重要性也随之凸显。非组蛋白赖氨酸乙酰化修饰在植物不同组织、器官和细胞器中大量存在,广泛参与植物生长发育的各种代谢过程的调控,并在植物应答和适应逆境胁迫中发挥作用。综述了近年来植物非组蛋白赖氨酸乙酰化修饰的蛋白质组学研究进展,阐明乙酰化修饰在植物不同组织和亚细胞中的分布特征以及在植物生长发育和逆境胁迫响应中的作用,并阐述乙酰化修饰与其他蛋白质翻译后修饰的交互作用,最后对未来的研究进行展望和讨论。
- 郑璐沈仁芳兰平
- 关键词：非组蛋白胁迫响应
- D-乳酸生产菌菊糖芽孢乳杆菌来源的D-乳酸脱氢酶同工酶
- 2016年
- 【目的】菊糖芽孢乳杆菌(Sporolactobacillus inulinus)作为典型的同型发酵产D-乳酸的优势菌株,能够高效生产高纯度的D-乳酸。该菌株发酵受到多方面环境因素影响。糖代谢的关键酶例如葡萄糖激酶、磷酸果糖激酶、丙酮酸激酶以及乳酸脱氢酶均为由葡萄糖代谢成为乳酸的关键酶,该菌中相关代谢酶的研究是发酵调控至关重要的基础。分析S.inulinus的基因组表明有3个推测为D-乳酸脱氢酶的基因,其中已有报道研究了1个双功能蛋白[bifunctional protein(BP)]。本研究分别克隆并解析了另2个D-乳酸脱氢酶同工酶的性质。【方法】本研究以S.inulinus Y2-8基因组DNA为模板,克隆得到2个D-ldh基因(dldh、dhdh),经测序分别为D-乳酸脱氢酶[D-lactic acid dehydrogenase(DLDH)]和D-羟基酸脱氢酶[D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase(DHDH)]的基因。构建的重组菌表达蛋白DLDH,DHDH均具有催化丙酮酸生成D-乳酸的功能。【结果】重组菌表达的蛋白经镍柱亲和层析达到电泳纯。SDS-PAGE分析表明DLDH的表观分子量为37 k Da,DHDH的表观分子量为39 k Da。此外,DLDH以丙酮酸为底物时Km值为(0.58±0.04)mmol/L,对底物有较高的亲和力,最适反应温度为35°C,最适p H为6.5;而DHDH以丙酮酸为底物时Km值为(1.70±0.08)mmol/L最适反应温度为30°C,最适p H为7.5。另有报道的BP以丙酮酸为底物时Km值为(3.40±0.02)mmol/L,最适反应温度为30°C,最适p H为5.5。【结论】根据对底物丙酮酸的亲和力,最适温度及最适p H,推测DLDH是乳酸发酵中产D-乳酸的主导催化剂。结合相关酶学性质的分析可为今后的发酵调控提供理论依据。
- 张淡如郑璐吴斌何冰芳
- 关键词：克隆酶学性质
- 菊糖芽孢乳杆菌丙酮酸激酶在大肠杆菌中的表达、纯化及调控性质
- 郑璐柏中中何冰芳
- 关键词：丙酮酸激酶
- D-乳酸高产菌菊糖芽胞乳杆菌Y2-8磷酸果糖激酶基因在大肠杆菌中的克隆和表达被引量：1
- 2014年
- 以D-乳酸高产菌菊糖芽胞乳杆菌Y2-8基因组DNA为模板,通过PCR扩增得到960 bp的磷酸果糖激酶基因(pfk)。氨基酸序列比对分析表明,该磷酸果糖激酶(PFK)与其他乳酸菌PFK具有保守的底物结合位点,但是其变构效应物结合位点存在差异。将pfk基因克隆到表达载体pSE380上,获得重组菌E-pSE-pfk。进一步通过诱导条件的优化,重组菌的PFK比酶活达到4.89 U/mg,是优化前的4.79倍。采用低温诱导策略有助于实现菊糖芽胞乳杆菌pfk基因在大肠杆菌中可溶性表达。
- 郑璐柏中中许婷婷何冰芳
- 关键词：D-乳酸大肠杆菌
- 拟南芥RPP1A参与幼苗生长的蛋白质组学分析被引量：1
- 2022年
- 核糖体蛋白不仅参与蛋白质合成,而且参与植物生长发育的调控。利用拟南芥核糖体磷酸蛋白P1(ribosomal phosphoprotein P1,RPP1)家族基因RPP1A缺失突变体rpp1a研究RPP1A缺失对幼苗蛋白质表达水平的影响,揭示其参与调控幼苗生长的作用机制。表型分析发现,与野生型WT相比,RPP1A缺失导致拟南芥幼苗生物量、叶片总表面积和叶柄长度显著增加。基于label-free的蛋白质组学分析,与野生型相比,rpp1a-2突变体有280个蛋白质表达量具有显著差异,其中98个显著上调,182个显著下调。差异蛋白主要富集在细胞过程、代谢过程、刺激反应、细胞成分组织或生物发生和氧化还原过程等生物学过程,并在核糖体、光合作用、mRNA监视途径、RNA降解和苯丙素的生物合成代谢通路中显著富集。拟南芥rpp1a-2突变体通过抑制刺激反应和增强光合作用等过程促进植物生长。
- 李兵娟郑璐沈仁芳兰平
- 关键词：拟南芥核糖体蛋白幼苗生长蛋白质组光合作用
