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张建伟

作品数:1 被引量:14H指数:1
供职机构:华中农业大学植物科学技术学院作物遗传改良国家重点实验室更多>>
发文基金:国家重点基础研究发展计划更多>>
相关领域:生物学更多>>

文献类型

  • 1篇中文期刊文章

领域

  • 1篇生物学

主题

  • 1篇冗余
  • 1篇基因
  • 1篇基因测序
  • 1篇CDNA文库
  • 1篇测序

机构

  • 1篇华中农业大学

作者

  • 1篇张启发
  • 1篇王石平
  • 1篇袁德军
  • 1篇张利达
  • 1篇张建伟

传媒

  • 1篇Journa...

年份

  • 1篇2003
1 条 记 录,以下是 1-1
排序方式:
一种新的EST聚类方法被引量:14
2003年
该研究发展了一种EST(expressedsequencetag)聚类方法 (ESTClustering) ,用于分析大规模EST测序中所产生的大量数据 ,以获得高质量、非重复表达序列。该方法在聚类过程中采用MEGABLAST工具对一致序列进行序列同源比较 ,并用phrap程序对每一EST簇进行拼接检验。这一聚类策略能降低测序错误带来的影响 ,有效识别基因家族成员 ,并避免选择性剪接的干扰。与NCBI(NationalCenterforBiotechnologyInformation)的UniGeneclustering方法相比 ,ESTClustering的聚类结果可以更好地反映表达序列的多样性。用ESTClustering对 112 2 5 6条拟南芥EST聚类测试 ,产生 2 35 81个EST簇 ,其中 135 97个EST簇有对应拟南芥基因组编码序列 ,与该基因组中有EST作为依据的预测基因数目接近。应用该方法对收集的 14 7191条水稻EST序列进行聚类 ,形成 33896个EST簇。
张利达袁德军张建伟王石平张启发
关键词:基因测序
共1页<1>
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