苏玉亮
- 作品数：2 被引量：4H指数：1
- 供职机构：天津医科大学附属肿瘤医院更多>>
- 发文基金：天津市自然科学基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- EGFR突变相关miR-335靶基因预测及其生物信息学分析
- 目的：通过筛选肺癌组织中表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)突变差异表达的microRNAs(miRs),并对其进行靶基因预测及功能的生物信息学分析,以期为miR...
- 苏玉亮张寰曲金力钱碧云
- 关键词：生物信息学
- EGFR突变相关miR-335靶基因预测及其功能的生物信息学分析被引量：4
- 2013年
- 目的:通过筛选肺癌组织中表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)突变差异表达的microRNAs(miRs),并对其进行靶基因预测及功能的生物信息学分析,以期为miR与EGFR在肺癌中潜在的相互作用机制研究奠定基础。方法:利用TaqMan低密度芯片(TaqMan Low Density Array,TLDA)在4对肺癌组织中筛选EGRF突变差异表达的miRs。应用miRanda、PicTar和TargetScan数据库进行靶基因预测,并通过DAVID数据库对预测的靶基因进行Gene Ontology(GO)分析和KEGG信号转导通路富集分析。结果:miR-335在配对肺癌组织样本间差异表达值ΔΔC(tcycle threshold)的绝对值均>1,预测其有57个靶基因,功能主要集中于通道调节因子活性等8类分子(P<0.05)和RNA代谢调节等22类生物学过程(P<0.05)。分析结果未提示有显著富集的细胞组分和信号转导通路(P>0.05)。结论:本研究虽然未明确提示miR-335与EGFR具有直接作用,但是其参与的调控网络可能与EGFR具有密切联系。
- 苏玉亮张寰曲金力钱碧云
- 关键词：肺癌表皮生长因子受体生物信息学
