高凌云
- 作品数：10 被引量：8H指数：2
- 供职机构：华中农业大学更多>>
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- CmEF1α基因和CmRAN基因在甜瓜果实基因表达分析中作为内参基因的应用
- 本发明属于基因表达分析技术领域，公开了CmEF1α基因和CmRAN基因在分析甜瓜果实的基因表达时作为内参基因的应用，所述CmEF1α基因的核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，所述CmRAN基因的核苷酸序列如SEQ I...
- 别之龙孔秋生高凌云袁静贤黄远程菲
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- CL5547.Contig2基因在南瓜基因表达实时荧光定量PCR分析中作为内参基因的用途
- 本发明属于基因表达分析技术领域，具体涉及CL5547.Contig2基因在南瓜基因表达实时荧光定量PCR分析中作为内参基因的用途。本发明利用南瓜转录组数据，在全基因组水平上比较了基因的表达水平和稳定性，从中选择10个表达...
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- 一种西瓜基因表达的实时荧光定量PCR分析方法
- 本发明公开了一种西瓜基因表达实时荧光定量PCR分析方法，属于基因表达分析技术领域。本发明根据目标基因的结构信息，将目标基因的正向或反向引物的结合位点特异地设计在相邻外显子的接头处，使之在cDNA模板上能扩增出目标片段，而...
- 别之龙孔秋生高凌云曹蕾袁静贤
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- 西瓜低温响应MYB(Cla007586)转录因子的功能鉴定及互作蛋白分析
- 西瓜（Citrullus lanatus）是世界范围内广泛栽培和食用的园艺作物，具有很高的经济价值。低温是常见的环境胁迫因子，严重制约农业生产。西瓜属于喜温性作物，在早春和反季节设施栽培过程中，常常受到低温胁迫，影响产量...
- 高凌云
- 关键词：西瓜转录因子低温胁迫酵母双杂交
- 基于转录组denovo拼接鉴定辣椒(Capsicum frutescens)中辣椒素生物合成相关基因被引量：2
- 2014年
- 辣椒素是由辣椒果实产生的一组化合物,被广泛应用于许多领域,尤其是医药行业。辣椒素生物合成途径还没有被清楚地确定。为了解更多辣椒素生物合成的知识,我们对辣椒(Capsicum frutescens L.)胎座和果皮的混合材料进行了转录组测序。并使用不同的拼接软件对各拼接参数的影响进行了评估,最终获得了转录组数据de novo拼接的最佳策略之一。我们利用Trinity软件得到共54 045条高质量unigenes(转录物)。约92.65%的unigenes与马铃薯、番茄和辣椒(C.annuum)ESTs数据库公共蛋白序列和基因组有相似性。我们预测到了3个新的结构基因(DHAD,TD,PAT),填补了由Mazourek提出的辣椒素分子合成途径中的空缺,并且以KEGG(京东基因与基因组百科全书)分析为基础,鉴定到了参与辣椒素生物合成新的候选基因。大量的SSR(简单重复序列)和SNP(单核苷酸多态性)标记在C.frutescens和C.annuum序列中被预测到,这些标记可在识别辣椒群体多态性方面提供帮助。这些数据将为辣椒素生物合成途径及相关研究提供新的思路。此外,我们的转录组de novo拼接策略也可用于其他大量类似研究中。
- Liu ShaoqunLi WanshunWu YiminChen ChangmingLei Jianjun高凌云孔秋生
- 关键词：辣椒辣椒素转录组DE生物合成
- ClCAC基因和ClSAND基因在西瓜果实基因表达分析中作为内参基因的应用
- 本发明属于基因表达分析技术领域，具体涉及ClCAC基因和ClSAND基因在西瓜果实发育过程中用作为基因表达分析的内参基因的应用。本发明为ClCAC和ClSAND基因设计了特异引物，该引物跨基因上相邻的2个外显子的接头位点...
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- CmEF1α基因和CmRAN基因在甜瓜果实基因表达分析中作为内参基因的应用
- 本发明属于基因表达分析技术领域，公开了CmEF1α基因和CmRAN基因在分析甜瓜果实的基因表达时作为内参基因的应用，所述CmEF1α基因的核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，所述CmRAN基因的核苷酸序列如SEQ I...
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- 一种检测西瓜cDNA样品中是否有基因组DNA污染的方法
- 本发明属于基因表达分析技术领域，是一种西瓜基因表达分析时，检测cDNA样品中是否存在基因组DNA污染的方法。本发明的原理是根据基因的结构和序列信息，在相邻的两个外显子上分别设计正向和反向引物，使之在基因组DNA模板上扩增...
- 别之龙孔秋生曹蕾高凌云刘朋刘越
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- 辣椒SSR标记的开发和高密度遗传连锁图谱的构建被引量：2
- 2013年
- 为了方便辣椒的标记辅助育种和遗传分析,我们利用辣椒基因组富集文库和公共数据库辣椒的cDNA序列,从中开发了一批非冗余的、具有2～3个碱基基序的SSR(simple sequence repeat)标记。SSR富集文库由三种限制性内切酶(AluI、HaeⅢ、RsaI)和两种生物素标记的寡核苷酸探针b(GA)15和b(CA)15共同构建而成。从6528个克隆开发了1736个基因组SSR标记,从13003个序列中获得了1344个cDNA序列来源的SSR标记。利用自交系K9-11和MZC-180的种内杂交种(K9-11×MZC-180)获得了双单倍体分离群体,并用于遗传作图。将597个标记定位到该连锁图上,其中包括265个新开发的SSR标记。将该遗传图谱命名为KL-DH,它包括12个连锁群,覆盖了2028cM的遗传距离,标记间的平均距离少于4cM。将KL-DH图谱的框架结构与已发表的COSⅡ图谱进行了比较,并利用番茄的基因组序列来整合两个图谱。COSⅡ图谱是由C.frutescens×C.annuum种间杂种的F2分离群体构建而成。本研究所建立的种内杂交KL-DH图谱和种间杂交COSⅡ图谱在图谱长度和标记分布上比较相似,表明KL-DH图谱几乎覆盖了整个辣椒基因组。
- Toru SugitaYukari SemiHiromasa SawadaYumi UtoyamaYuko HosomiEri YoshimotoYuki MaehataHiroyuki FukuokaRyutaro NagataAkio Ohyama高凌云孔秋生
- 关键词：辣椒SEQUENCE
- CL5547.Contig2基因在南瓜基因表达实时荧光定量PCR分析中作为内参基因的用途
- 本发明属于基因表达分析技术领域，具体涉及CL5547.Contig2基因在南瓜基因表达实时荧光定量PCR分析中作为内参基因的用途。本发明利用南瓜转录组数据，在全基因组水平上比较了基因的表达水平和稳定性，从中选择10个表达...
- 别之龙孔秋生张群芳曹蕾高凌云谢俊俊
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