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杨坤杰

作品数：5 被引量：33H指数：2
供职机构：宁波大学生命科学与生物工程学院教育部应用海洋生物技术重点实验室更多>>
发文基金：国家高技术研究发展计划国家自然科学基金浙江省重中之重学科开放基金更多>>
相关领域：农业科学生物学更多>>

合作作者

文献类型

  • 3篇期刊文章
  • 2篇专利

领域

  • 2篇农业科学
  • 1篇生物学

主题

  • 4篇对虾
  • 2篇养殖
  • 2篇异养细菌
  • 2篇排污
  • 2篇排污效果
  • 2篇南美白对虾
  • 2篇角毛藻
  • 2篇凡纳滨对虾
  • 2篇高产
  • 2篇白对虾
  • 1篇代谢废物
  • 1篇定量PCR
  • 1篇养殖方法
  • 1篇养殖水体
  • 1篇幼虾
  • 1篇群结构
  • 1篇种内
  • 1篇种内变异
  • 1篇细菌群落
  • 1篇消化道菌群

机构

  • 5篇宁波大学

作者

  • 5篇张德民
  • 5篇杨坤杰
  • 4篇黄雷
  • 3篇张化俊
  • 2篇陈伟
  • 1篇陈和平
  • 1篇阎永伟
  • 1篇李长红
  • 1篇郭安南
  • 1篇王欣
  • 1篇熊金波
  • 1篇王凯
  • 1篇唐姝

传媒

  • 1篇生物学杂志
  • 1篇水产学报
  • 1篇生态学杂志

年份

  • 1篇2019
  • 1篇2018
  • 2篇2016
  • 1篇2015
共 5 条 记 录，以下是 1-5
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排序方式：
健康和患病凡纳滨对虾幼虾消化道菌群结构的比较被引量：18
2016年
凡纳滨对虾养殖过程中,早期阶段是病害易感阶段,而消化道菌群结构与对虾健康关系密切。因此,探讨幼虾的消化道菌群尤其是弧菌类细菌与对虾发病的关系对病害有效防治具有重要意义。本实验采用Illumina测序研究了凡纳滨对虾健康和患病幼虾的消化道细菌群落结构,并基于纯培养和16S r DNA,rec A和pyr H基因序列比对,分析了幼虾消化道中弧菌的主要种类组成。结果发现,健康幼虾消化道中α-变形菌纲和厚壁菌门丰度较高,而患病幼虾中γ-变形菌纲、拟杆菌门、放线菌门和β-变形菌纲较高,其中放线菌门丰度差异显著。基于科水平的响应比分析,发现患病幼虾消化道中动性球菌科和噬菌弧菌科的丰度显著降低,而弧菌科的丰度显著升高。相似度分析发现,驱动群落变异的OTU主要来源于弧菌属、海洋杆状菌属、冷杆菌属、假交替单胞菌属以及未分类至属的红杆菌科和微杆菌科。健康幼虾消化道弧菌组成以锡那罗亚州弧菌为主,而患病幼虾消化道弧菌组成以坎氏弧菌为主。尽管健康和患病幼虾消化道内细菌群落结构整体差异不显著,但一些重要类群丰度变化显著,其特征与已知的生态功能一致。
杨坤杰王欣熊金波裘钱玲琳黄雷张化俊郭安南李来国张德民
关键词：凡纳滨对虾消化道菌群弧菌
凡纳滨对虾健康状态分化前后养殖水体浮游细菌群落的比较被引量：15
2019年
养殖水体浮游细菌群落与对虾健康状态息息相关.本研究基于16S rRNA高通量测序技术手段比较了凡纳滨对虾病害发生前后病害趋向塘与健康塘的浮游细菌群落多样性、组成及关键类群互作关系的动态变化.结果表明:对虾发病前,病害趋向养殖水体浮游细菌群落Shannon指数显著低于健康养殖水体,且呈现持续下降的趋势;伴随疾病爆发,病害趋向养殖水体浮游细菌群落结构离散程度显著增大,群落稳定性较差;发病前,病害趋向塘养殖水体中绿弯菌门、δ-变形菌纲和Saccharibacteria平均相对丰度均显著高于健康水体,而拟杆菌门显著低于健康水体;部分病害指示OTU隶属于弧菌科及黄杆菌科,隶属于红杆菌科的OTU1是发病前健康塘的健康指示OTU.网络分析表明,大多数与OTU1存在相互作用的指示OTUs属于黄杆菌科,说明黄杆菌科在对虾养殖水体浮游细菌群落中扮演重要角色.鉴于以上结果,对虾发病可能与多种浮游细菌群落相关,当出现“生态位机会”时,条件致病菌快速繁殖进而导致对虾发病,而保持和恢复细菌群落平衡可以成为预防对虾发病的有效策略.
杜世聪黄雷杨坤杰姚志远陈和平张德民
关键词：凡纳滨对虾浮游细菌RRNA
一种绿色高产的南美白对虾养殖方法
本发明公开了一种绿色高产的南美白对虾养殖方法，特点是包括养殖前期准备、角毛藻培养、碳源添加、饲养管理和水质监测等步骤，养殖前添加有益角毛藻占领生态位，养殖期间调节饲料和葡萄糖的输入比例，可刺激异养细菌吸收氮磷代谢废物大量...
张德民黄雷刘紫丹张化俊杨坤杰陈伟
文献传递
哈维弧菌16S rRNA基因拷贝数的种内变异被引量：2
2015年
利用荧光定量PCR法测定哈维弧菌（Vibrio harveyi）基因组内16S rRNA基因拷贝数。基于16S rDNA、pyrH、rpo A和rec A4个基因的系统发育学分析鉴定弧菌菌株,然后通过重叠PCR构建包含哈维弧菌模式菌株16S rDNA和gyrB基因片段的标准质粒,建立了定量PCR测定细胞内16S rRNA基因拷贝数方法,并测定了6株测试菌株和哈维弧菌模式株的16S rRNA基因拷贝数,同时以已知拷贝数的菌株ATCC BAA-1116做对照。6个测试菌株均为哈维弧菌。菌株ATCC BAA-1116的16S rRNA基因拷贝数为11个,与已知值相符。模式菌株MCCC 1H00031-T和6个测试菌株SXB-C、SCB-4、NBV00029、NBV00035、NBV00039和NBV00269的拷贝数分别为9、12、13、12、11、13和9个。利用荧光定量PCR法测定哈维弧菌基因组内16S rRNA基因拷贝数的方法简单可行。哈维弧菌16S rRNA基因拷贝数的种内变异可能是其适应近岸多变生境的原因之一。
郑嘉来阎永伟唐姝杨坤杰李长红王凯张德民
关键词：RRNA基因基因拷贝数定量PCR
一种绿色高产的南美白对虾养殖方法
本发明公开了一种绿色高产的南美白对虾养殖方法，特点是包括养殖前期准备、角毛藻培养、碳源添加、饲养管理和水质监测等步骤，养殖前添加有益角毛藻占领生态位，养殖期间调节饲料和葡萄糖的输入比例，可刺激异养细菌吸收氮磷代谢废物大量...
张德民黄雷刘紫丹张化俊杨坤杰陈伟
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