曹芳芳
- 作品数:7 被引量:11H指数:2
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- 山葡萄查尔酮异构酶(VamCHI)基因的克隆与分析
- 花色苷是黄酮类化合物中的一类,除了赋予植物器官各种颜色外,对授粉、种子传播、防护紫外线损伤、抵抗病原物侵染等方面具有重要作用。花色苷的合成是植物体内类黄酮类物质合成途径的分支之一,合成过程主要分为两个阶段:苯丙氨酸先转化...
- 李娟曹芳芳刘海峰
- 关键词:山葡萄查尔酮异构酶克隆
- 山葡萄黄烷酮3-羟化酶VamF3H基因及其克隆
- 2015年
- 采用RT-PCR与RACE技术相结合的方法,从山葡萄果皮中克隆到黄烷酮3-羟化酶(F3H)基因的c DNA全长序列。该基因全长1 398 bp,包含1 092 bp的完整开放阅读框,编码363个氨基酸,相对分子质量为40.81 ku,等电点(PI)值为5.37。二级结构预测表明,随机卷曲是Vam F3H蛋白最大量的结构元件,不具有信号肽,属于不稳定亲水蛋白。氨基酸序列与欧亚种葡萄(FQ389950)、圆叶葡萄(KF040970)、美国蔓藤(JX087441)等的F3H类基因同源性较高,相似性分别为99%、99%、96%。
- 李娟曹芳芳权哲刘海峰
- 关键词:山葡萄CDNA克隆
- 山葡萄无色花色素双加氧酶基因(LDOX)cDNA的克隆与表达被引量:3
- 2016年
- 为获得山葡萄LDOX基因的全长序列,采用RT-PCR与SMART RACE技术克隆LDOX基因,并对该基因进行生物信息学分析。结果显示,山葡萄LDOX基因全长1 353bp,其中开放阅读框(ORF)为1 068bp,编码355个氨基酸,氨基酸序列的分子质量为40.19ku,等电点为5.61;VAmLDOX基因(GenBank登陆号:FJ645769)属于双加氧酶基因家族,不含信号肽,VAmLDOX蛋白属于不稳定亲水蛋白,二级结构中随机卷曲含量最高;山葡萄VAmLDOX氨基酸序列与欧亚种葡萄、苹果、大豆、三花龙胆和紫苏等的同源性系数分别为99%、81%、80%、77%和75%;半定量RT-PCR分析显示,在山葡萄果实着色过程中,VAmLDOX在不同时期的果皮中均有表达,在转色期的叶片、茎、果肉中也均有表达,且表达量相近。
- 李娟刘海峰曹芳芳
- 关键词:山葡萄CDNA克隆
- 山葡萄查尔酮异构酶(VamCHI)基因的克隆与分析被引量:2
- 2016年
- 采用RT-PCR和RACE技术相结合的方法,从山葡萄(Vitis amurensis Rupr.)果皮中克隆到查尔酮异构酶(CHI)基因的c DNA全长序列。该基因全长955 bp,包含705 bp的完整开放阅读框,编码234个氨基酸。分子量为25.04 k Da,等电点(PI)为5.21。该基因属于查尔酮超级基因家族,二级结构预测表明,随机卷曲是Vam CHI蛋白质最大量的结构元件,不具有信号肽,属于稳定的亲水蛋白质。氨基酸序列与欧亚种葡萄(NP_001268033)、美洲种葡萄(ACS36662)和显齿蛇葡萄(AGO02170)的同源性较高,相似性分别为98%、98%和91%。
- 李娟曹芳芳刘海峰
- 关键词:DNA克隆查尔酮异构酶
- 山葡萄查尔酮合成酶基因的克隆与分析被引量:2
- 2015年
- 为揭示查尔酮合成酶在山葡萄中的次生代谢途径,采用RT-PCR和RACE技术相结合的方法,从山葡萄果皮中克隆到查尔酮合成酶(CHS)基因的cDNA全长序列。结果表明:该基因全长1 461bp,包含1 182bp的完整开放阅读框,编码393个氨基酸,分子量为42.91KDa,等电点(PI)值为6.10。该基因属于无色花色素双加氧酶基因家族,二级结构预测表明,α-螺旋是VamCHS蛋白最大量的结构元件,氨基酸序列与欧亚种葡萄(BAB84112)、杂交种葡萄(ACS36661)和圆叶葡萄(ACN30003)等的CHS类基因同源性较高,分别为100%、96%和96%。
- 李娟曹芳芳刘海峰
- 关键词:山葡萄CDNA克隆查尔酮合成酶
- 山葡萄VamF3H基因及其启动子的克隆与表达分析
- 山葡萄的浆果可用于酿造葡萄酒,是葡萄酒工业的主要原料。影响葡萄酒质量的关键因素是葡萄果皮的颜色,而葡萄果皮颜色又取决于花色苷的组成与含量,在花色苷生物合成过程中,F3H基因是黄烷酮与花青素代谢途径的关键基因。 本研究是...
- 曹芳芳
- 关键词:山葡萄启动子基因克隆基因表达
- 山葡萄DFR基因全长cDNA的克隆与序列分析被引量:3
- 2016年
- 应用RT-PCR和SMART RACE等技术克隆山葡萄二氢黄酮醇4-还原酶基因的全长c DNA序列,结果表明,该基因全长1 362 bp,包括1 014 bp的完整开放阅读框,推测其编码337个氨基酸。该基因表达产物相对分子质量为37.50 ku,等电点为5.95,是稳定蛋白,不包含信号肽。蛋白质疏水性分析结果表明,DFR疏水性最大值为2.511,最小值为-2.267,平均值为-0.146,整体表现为亲水性。二级结构分析结果表明,DFR的二级结构主要以α-螺旋(35.31%)和不规则卷曲(46.29%)为蛋白最大量的结构元件。对不同植物DFR氨基酸序列进行多重比对发现,同源性较高,DFR与NADPH结合区域和底物结合区域都表现出高度保守。用推导的氨基酸序列与蛋白质数据库进行同源性比较,其氨基酸序列与欧亚种葡萄、大豆、矮牵牛等植物的DFR氨基酸序列两两比对的相似性系数分别为98%、76%、74%。
- 曹芳芳李娟刘海峰
- 关键词:山葡萄克隆